LSM10 - LSM10

LSM10
Identifikátory
Aliasy	LSM10, MST074, MSTP074, U7 spojená s malou jadernou RNA
Externí ID	OMIM: 617909 MGI: 2151045 HomoloGene: 13154 Genové karty: LSM10
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	36,397,908 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	126,098,584 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• U7 snRNA vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • histonová pre-mRNA DCP vazba; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• Cajal tělo; • U7 snRNP; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderné těleso;
Biologický proces	• pozitivní regulace přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • Zpracování mRNA; • metabolický proces histonové mRNA; • Sestřih RNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84967
	116748
	ENSG00000181817
	ENSMUSG00000050188
	Q969L4
	Q8QZX5
	NM_032881
	NM_001163266; NM_138721
	NP_116270
	NP_001156738; NP_620046
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Sm-like protein LSm10 spojený s U7 snRNA je protein že u lidí je kódován LSM10 gen.^[5]^[6]

Interakce

LSM10 bylo prokázáno komunikovat s LSM3.^[7]^[8]

Viz také

U7 malá jaderná RNA

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000181817 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000050188 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Pillai RS, Will CL, Lührmann R, Schümperli D, Müller B (říjen 2001). „Purifikovaným U7 snRNP chybí proteiny Sm D1 a D2, ale obsahují Lsm10, nový protein podobný proteinu Sm D1 14 kD“ (PDF). Časopis EMBO. 20 (19): 5470–9. doi:10.1093 / emboj / 20.19.5470. PMC 125645. PMID 11574479.
^ „Entrez Gene: LSM10 LSM10, U7 small nuclear RNA associated“.
^ Lehner B, Sanderson CM (červenec 2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Výzkum genomu. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Další čtení

Dominski Z, Zheng LX, Sanchez R, Marzluff WF (květen 1999). „Protein vázající se na kmenovou smyčku usnadňuje tvorbu 3'-konce stabilizací vazby U7 snRNP na pre-mRNA histonu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (5): 3561–70. doi:10,1128 / mcb.19.5.3561. PMC 84148. PMID 10207079.
Dominski Z, Erkmann JA, Yang X, Sànchez R, Marzluff WF (leden 2002). „Nový protein se zinkovým prstem je spojen s U7 snRNP a interaguje s proteinem vázajícím se na kmenovou smyčku v pre-mRNP histonu, aby stimuloval zpracování na 3'-konci“. Geny a vývoj. 16 (1): 58–71. doi:10,1101 / gad. 932302. PMC 155312. PMID 11782445.
Pillai RS, Grimmler M, Meister G, Will CL, Lührmann R, Fischer U, Schümperli D (září 2003). „Unikátní Sm základní struktura U7 snRNP: sestavení specializovaným SMN komplexem a role nové komponenty, Lsm11, při zpracování histonové RNA“. Geny a vývoj. 17 (18): 2321–33. doi:10,1101 / gad.274403. PMC 196468. PMID 12975319.
Hassel S, Eichner A, Yakymovych M, Hellman U, Knaus P, Souchelnytskyi S (květen 2004). „Proteiny spojené s kostním morfogenetickým proteinovým receptorem typu II (BMPR-II) a identifikované pomocí dvourozměrné gelové elektroforézy a hmotnostní spektrometrie“. Proteomika. 4 (5): 1346–58. doi:10.1002 / pmic.200300770. PMID 15188402.
Lehner B, Sanderson CM (červenec 2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Výzkum genomu. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Azzouz TN, Pillai RS, Däpp C, Chari A, Meister G, Kambach C, Fischer U, Schümperli D (říjen 2005). „Směrem k montážní lince pro U7 snRNP: interakce L7 proteinů specifických pro U7 s komplexy PRMT5 a SMN“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (41): 34435–40. doi:10,1074 / jbc.M505077200. PMID 16087681.
Wagner EJ, Marzluff WF (září 2006). „ZFP100, součást aktivního omezení UR snRNP pro zpracování pre-mRNA histonu, je vyžadován pro vstup do S fáze“. Molekulární a buněčná biologie. 26 (17): 6702–12. doi:10.1128 / MCB.00391-06. PMC 1592837. PMID 16914750.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000181817 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000050188 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11574479-5] Pillai RS, Will CL, Lührmann R, Schümperli D, Müller B (říjen 2001). „Purifikovaným U7 snRNP chybí proteiny Sm D1 a D2, ale obsahují Lsm10, nový protein podobný proteinu Sm D1 14 kD“ (PDF). Časopis EMBO. 20 (19): 5470–9. doi:10.1093 / emboj / 20.19.5470. PMC 125645. PMID 11574479.

[entrez-6] „Entrez Gene: LSM10 LSM10, U7 small nuclear RNA associated“.

[pmid15231747-7] Lehner B, Sanderson CM (červenec 2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Výzkum genomu. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.

[pmid16189514-8] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]