LCP1 - LCP1

LCP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2D85
Identifikátory
Aliasy	LCP1, CP64, HEL-S-37, L-PLASTIN, LC64P, LPL, PLS2, cytosolový protein lymfocytů 1
Externí ID	OMIM: 153430 MGI: 104808 HomoloGene: 80174 Genové karty: LCP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	46,211,871 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	75,230,842 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba kovových iontů; • vazba aktinového vlákna; • identická vazba na protein; • Vazba GTPázy; • aktinová vazba; • integrinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčná projekce; • membrána; • ohnisková adheze; • filopodium; • prohrábnout; • buněčná membrána; • stresové vlákno; • volánová membrána; • aktinové vlákno; • aktinový cytoskelet; • svazek aktinových vláken; • podosomy; • fagocytární pohár; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • extracelulární; • buněčné spojení; • perinukleární oblast cytoplazmy;
Biologický proces	• demontáž extracelulární matice; • pozitivní regulace sestavy podosomu; • sestava svazku aktinových vláken; • regulace intracelulárního transportu proteinů; • regenerace zvířecích orgánů; • signalizace protein kinázy A.; • migrace buněk; • hojení ran, šíření buněk; • Aktivace T buněk zapojená do imunitní odpovědi; • tvorba sítě aktinových vláken; • tvorba aktinového zesítění; • interleukin-12 zprostředkovaná signální dráha;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3936
	18826
	ENSG00000136167
	ENSMUSG00000021998
	P13796
	Q61233
	NM_002298
	NM_001247984; NM_008879
	NP_002289; NP_002289.2
	NP_001234913; NP_032905
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Plastin-2 je protein že u lidí je kódován LCP1 gen.^[5]

Funkce

Plastiny jsou rodinou proteinů vázajících aktin, které jsou konzervovány během vývoje eukaryot a jsou exprimovány ve většině tkání vyšších eukaryot. U lidí byly identifikovány dvě všudypřítomné plastinové izoformy (L a T). Plastin 1 (jinak známý jako fimbrin ) je třetí odlišná plastinová izoforma, která je specificky exprimována ve vysokých hladinách v tenkém střevě. L izoforma je exprimována pouze v hemopoetických buněčných liniích, zatímco izoforma T byla nalezena ve všech ostatních normálních buňkách pevných tkání, které mají replikační potenciál (fibroblasty, endotelové buňky, epiteliální buňky, melanocyty atd.). L-plastin však byl nalezen v mnoha typech maligních lidských buněkhemopoetický původ naznačuje, že jeho exprese je indukována doprovázející tumorigeneze v pevných tkáních.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136167 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021998 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zu Y, Kohno M, Kubota I, Nishida E, Hanaoka M, Namba Y (leden 1990). "Charakterizace interleukinem 2 stimulovala 65kilodaltonový fosfoprotein v lidských T buňkách". Biochemie. 29 (4): 1055–62. doi:10.1021 / bi00456a030. PMID 2111166.
^ "Entrez Gene: LCP1 lymfocytární cytosolický protein 1 (L-plastin)".

Další čtení

Namba Y, Ito M, Zu Y, Shigesada K, Maruyama K (říjen 1992). "Lidské T buňky L-plastin svazuje aktinová vlákna způsobem závislým na vápníku". Journal of Biochemistry. 112 (4): 503–7. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a123929. PMID 1491005.
Zu YL, Shigesada K, Nishida E, Kubota I, Kohno M, Hanaoka M, Namba Y (září 1990). „Protein 65-kilodaltonů fosforylovaný stimulací interleukinem 2 nese dvě domnělá místa vázající aktin a dvě místa vázající vápník“. Biochemie. 29 (36): 8319–24. doi:10.1021 / bi00488a017. PMID 2252891.
Lin CS, Aebersold RH, Leavitt J (duben 1990). „Oprava N-koncových sekvencí izoforem lidského plastinu pomocí ukotveného polymerázového řetězce: identifikace potenciální domény vázající vápník“. Molekulární a buněčná biologie. 10 (4): 1818–21. doi:10.1128 / MCB.10.4.1818. PMC 362293. PMID 2378651.
Lin CS, Aebersold RH, Kent SB, Varma M, Leavitt J (listopad 1988). „Molekulární klonování a charakterizace plastinu, lidského leukocytového proteinu exprimovaného v transformovaných lidských fibroblastech“. Molekulární a buněčná biologie. 8 (11): 4659–68. doi:10.1128 / MCB.8.11.4659. PMC 365555. PMID 3211125.
Matsushima K, Shiroo M, Kung HF, Copeland TD (květen 1988). „Čištění a charakterizace cytosolického 65-kilodaltonového fosfoproteinu v lidských leukocytech, jejichž fosforylace je zvýšena stimulací interleukinem 1“. Biochemie. 27 (10): 3765–70. doi:10.1021 / bi00410a037. PMID 3261603.
Kondo I, Shin K, Honmura S, Nakajima H, Yamamura E, Satoh H, Terauchi M, Usuki Y, Takita H, Hamaguchi H (1986). „Kazuistika pacienta s retinoblastomem a delecí chromozomu 13q: přiřazení nového genu (genu pro LCP1) na lidský chromozom 13“. Genetika člověka. 71 (3): 263–6. doi:10.1007 / BF00284588. PMID 3864729.
Arpin M, Friederich E, Algrain M, Vernel F, Louvard D (prosinec 1994). „Funkční rozdíly mezi izoformami L- a T-plastinu“. The Journal of Cell Biology. 127 (6 Pt 2): 1995–2008. doi:10.1083 / jcb.127.6.1995. PMC 2120298. PMID 7806577.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Lin CS, Shen W, Chen ZP, Tu YH, Matsudaira P (duben 1994). „Identifikace I-plastinu, lidské izoformy fimbrinu exprimované ve střevech a ledvinách“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (4): 2457–67. doi:10,1128 / mcb.14.4.2457. PMC 358613. PMID 8139549.
Lin CS, Park T, Chen ZP, Leavitt J (únor 1993). "Lidské plastinové geny. Srovnávací genová struktura, umístění chromozomů a diferenciální exprese v normálních a neoplastických buňkách". The Journal of Biological Chemistry. 268 (4): 2781–92. PMID 8428952.
Lin CS, Chen ZP, Park T, Ghosh K, Leavitt J (únor 1993). "Charakterizace promotoru genu lidského L-plastinu v normálních a neoplastických buňkách". The Journal of Biological Chemistry. 268 (4): 2793–801. PMID 8428953.
Jones SL, Brown EJ (červen 1996). „Adheze a fagocytóza zprostředkovaná FcgammaRII indukují fosforylaci L-plastinu v lidských neutrofilech“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (24): 14623–30. doi:10.1074 / jbc.271.24.14623. PMID 8663066.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Okumura Y, Yano M, Murakami M, Mori S, Towatari T, Kido H (leden 1999). "Extracelulární zpracování HIV-1 obalového glykoproteinu gp160 lidským plazminem". FEBS Dopisy. 442 (1): 39–42. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 01612-3. PMID 9923600.
Wang J, Brown EJ (srpen 1999). „Aktivace integrinu vyvolaná imunním komplexem a fosforylace L-plastinu vyžadují proteinovou kinázu A“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (34): 24349–56. doi:10.1074 / jbc.274.34.24349. PMID 10446213.
Lin CS, Lau A, Yeh CC, Chang CH, Lue TF (leden 2000). „Upregulace genu L-plastinu testosteronem v buňkách rakoviny prsu a prostaty: identifikace tří kooperativních sekvencí vázajících androgenní receptory“. DNA a buněčná biologie. 19 (1): 1–7. doi:10.1089/104454900314654. PMID 10668786.
Jia J, Han Q, Borregaard N, Lollike K, Cygler M (červenec 2000). „Krystalová struktura lidského grancalcinu, člena rodiny proteinů penta-EF-hand“. Journal of Molecular Biology. 300 (5): 1271–81. doi:10.1006 / jmbi.2000.3925. PMID 10903868.
Lollike K, Johnsen AH, Durussel I, Borregaard N, Cox JA (květen 2001). „Biochemická charakterizace penta-EF-ručního proteinu grancalcinu a identifikace L-plastinu jako vazebného partnera“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (21): 17762–9. doi:10,1074 / jbc.M100965200. PMID 11279160.
Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, Saito R, Oda H, Endo T, Kondo S, Bono H, Okazaki Y, Hayashizaki Y (říjen 2001). „Panel interakce protein-protein využívající myší plné délky cDNA“. Výzkum genomu. 11 (10): 1758–65. doi:10,1101 / gr. 180101. PMC 311163. PMID 11591653.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136167 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021998 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2111166-5] Zu Y, Kohno M, Kubota I, Nishida E, Hanaoka M, Namba Y (leden 1990). "Charakterizace interleukinem 2 stimulovala 65kilodaltonový fosfoprotein v lidských T buňkách". Biochemie. 29 (4): 1055–62. doi:10.1021 / bi00456a030. PMID 2111166.

[entrez-6] "Entrez Gene: LCP1 lymfocytární cytosolický protein 1 (L-plastin)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]