KI polyomavirus - KI polyomavirus - Wikipedia

Lidský polyomavirus 3
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Monodnaviria
Království:Shotokuvirae
Kmen:Cossaviricota
Třída:Papovaviricetes
Objednat:Sepolyvirales
Rodina:Polyomaviridae
Rod:Betapolyomavirus
Druh:
Lidský polyomavirus 3

KI polyomavirus (také známý jako Virus KI, KIPyVnebo Lidský polyomavirus 3) je virus z rodiny Polyomaviridae. Byl objeven v roce 2007 ve skladovaných vzorcích lidských respiračních sekretů shromážděných Karolinska Institute, podle kterého je virus pojmenován.[1]

Objev

Virus KI byl objeven v roce 2007 ve vzorcích lidských respiračních sekretů, které byly systematicky prohledávány jako součást programu pro identifikaci nových lidských virů. Bylo identifikováno uživatelem sekvenční homologie na známé lidské polyomaviry BK virus a Virus JC a opičí polyomavirus SV40.[1] Virus KI byl třetím popsaným lidským polyomavirem a prvním objeveným od BK a JC v roce 1971.[2] Velmi podobný respirační virus, Virus WU, byla rovněž hlášena později v roce 2007.[3]

Genom

Struktura genomu Virus WU.[3] Virus KI má téměř identickou strukturu s mírně odlišnou délkou 5040 párů bází.[1]

Kompletní genom viru KI byl sekvenován a bylo zjištěno, že je kruhový dvouvláknová DNA genom 5040 základní páry obsahující genetický materiál charakteristický pro polyomaviry, kódující pět virové proteiny: tři kapsid komponenty, hlavní kapsidový protein VP1, VP2 a VP3; a dva další proteiny podílející se na replikaci, velký nádorový antigen a malý nádorový antigen.[1]

Prevalence

Prevalence viru KI, jak je detekována přítomností jeho DNA v lidských vzorcích, se obecně odhaduje v rozmezí 1–5% v různých lokalitách a populacích, což svědčí o věkové závislosti.[4] Virus byl detekován v respiračních sekretech dětí s respiračními infekcemi na více místech.[5][6] Naproti tomu byla umístěna jedna studie z roku 2009 séroprevalence - tj. prevalence protilátky proti viru (v tomto případě plášťový protein VP1) - až 55% u populace amerických dospělých a 56% u populace amerických dětí.[7] Další studie z roku 2009 zjistila přibližně 70% séroprevalence u dospělých, přičemž věkové vzorce naznačují, že kojenci mohou dědit mateřské protilátky proti WU i KI.[8] Studie séroprevalence polyomavirů z roku 2016 zjistila virus WU u 91,3% vzorků z jiné americké populace.[9] Obecně se předpokládá, že k primární infekci dochází v dětství.[9]

Sdružení nemocí

Není známo, že by virus KI, stejně jako jeho blízký příbuzný virus WU, byl spojen s jakýmkoli klinickým onemocněním navzdory své přítomnosti v respiračních sekrecích.[10] Míra souběžné infekce jinými respiračními viry je vysoká, takže je obtížné přiřadit příčinnou souvislost s virem KI, i když jsou přítomny klinické příznaky.[4] Některé polyomaviry jsou dobře známé jako karcinogenní, včetně lidského polyomaviru Polyomavirus z Merkelových buněk, ale virus KI také nebyl spojován s rakovinou.[11] I když nebyla zjištěna jasná souvislost s klinickými příznaky, existují slabé náznaky, že viry WU a KI mohou mít patogenní potenciál imunokompromitovaný pacientů.[12]

Nomenklatura a klasifikace

Virus KI dostal své jméno od Karolinska Institute, institucionální příslušnost výzkumníků, kteří virus objevili a nahlásili.[1]

Z lidských polyomavirů je KI nejpodobnější Virus WU. Klasifikace navržená v roce 2010 doporučila rozdělení polyomavirů do tří rodů, které obsahují jeden rod ptačích virů a dva savčí viry; jeden z nich byl určen Wukipolyomavirus k označení jeho dvou zakládajících členů.[13] V aktualizovaném klasifikačním systému pro rodinu polyomavirů navrženém v roce 2016 je virus WU klasifikován jako člen skupiny rod Betapolyomavirus spolu s BK, JC a KI.[2]

Reference

  1. ^ A b C d E Allander, Tobias; Andreasson, Kalle; Gupta, Shawon; Bjerkner, Annelie; Bogdanovic, Gordana; Persson, Mats A. A .; Dalianis, Tina; Ramqvist, Torbjörn; Andersson, Björn (01.04.2007). „Identifikace třetího lidského polyomaviru“. Journal of Virology. 81 (8): 4130–4136. doi:10.1128 / JVI.00028-07. ISSN  0022-538X. PMC  1866148. PMID  17287263.
  2. ^ A b Studijní skupina Polyomaviridae Mezinárodního výboru pro taxonomii virů; Calvignac-Spencer, S; Feltkamp, ​​MC; Daugherty, MD; Moens, U; Ramqvist, T; Johne, R; Ehlers, B (červen 2016). „Aktualizace taxonomie pro rodinu Polyomaviridae“. Archivy virologie. 161 (6): 1739–50. doi:10.1007 / s00705-016-2794-r. PMID  26923930.
  3. ^ A b Gaynor, AM; Nissen, MD; Whiley, DM; Mackay, IM; Lambert, SB; Wu, G; Brennan, DC; Storch, GA; Slooty, TP; Wang, D (4. května 2007). „Identifikace nového polyomaviru od pacientů s akutními infekcemi dýchacích cest“. PLoS patogeny. 3 (5): e64. doi:10.1371 / journal.ppat.0030064. PMC  1864993. PMID  17480120.
  4. ^ A b Abedi Kiasari, B; Vallely, PJ; Corless, CE; Al-Hammadi, M; Klapper, PE (září 2008). „Vzorec infekce KI a WU polyomaviru související s věkem“. Journal of Clinical Virology. 43 (1): 123–5. doi:10.1016 / j.jcv.2008.05.003. PMC  7108349. PMID  18573691.
  5. ^ Yuan, XH; Jin, Y; Xie, ZP; Gao, HC; Xu, ZQ; Zheng, LS; Zhang, RF; Song, JR; Hou, YD; Duan, ZJ (říjen 2008). „Prevalence lidských KI a WU polyomavirů u dětí s akutní infekcí dýchacích cest v Číně“. Journal of Clinical Microbiology. 46 (10): 3522–5. doi:10.1128 / jcm.01301-08. PMC  2566089. PMID  18667596.
  6. ^ Bialasiewicz, S; Whiley, DM; Lambert, SB; Wang, D; Nissen, MD; Sloots, TP (září 2007). „Nově hlášený lidský polyomavirus, virus KI, je přítomen v dýchacích cestách australských dětí“. Journal of Clinical Virology. 40 (1): 15–8. doi:10.1016 / j.jcv.2007.07.001. PMC  7172449. PMID  17706457.
  7. ^ Kean, JM; Rao, S; Wang, M; Garcea, RL (březen 2009). "Seroepidemiologie lidských polyomavirů". PLoS patogeny. 5 (3): e1000363. doi:10.1371 / journal.ppat.1000363. PMC  2655709. PMID  19325891.
  8. ^ Nguyen, Nang L .; Le, Binh Minh; Wang, David (01.08.2009). „Sérologické důkazy o časté lidské infekci polyomaviry WU a KI“. Vznikající infekční nemoci. 15 (8): 1199–1205. doi:10,3201 / eid1508,090270. ISSN  1080-6059. PMC  2815979. PMID  19751580.
  9. ^ A b Gossai, A; Waterboer, T; Nelson, HH; Michel, A; Willhauck-Fleckenstein, M; Farzan, SF; Hoen, AG; Christensen, BC; Kelsey, KT; Marsit, CJ; Pawlita, M; Karagas, MR (1. ledna 2016). "Seroepidemiologie lidských polyomavirů v populaci USA". American Journal of Epidemiology. 183 (1): 61–9. doi:10.1093 / aje / kwv155. PMC  5006224. PMID  26667254.
  10. ^ Norja, P; Ubillos, I; Templeton, K; Simmonds, P (prosinec 2007). „Žádný důkaz pro souvislost mezi infekcemi polyomaviry WU a KI a respiračním onemocněním“. Journal of Clinical Virology. 40 (4): 307–11. doi:10.1016 / j.jcv.2007.09.008. PMC  7172997. PMID  17997354.
  11. ^ Dalianis, T; Hirsch, HH (15. března 2013). „Lidské polyomaviry v nemoci a rakovině“. Virologie. 437 (2): 63–72. doi:10.1016 / j.virol.2012.12.015. PMID  23357733.
  12. ^ Babakir-Mina, M; Ciccozzi, M; Perno, CF; Ciotti, M (srpen 2013). „Lidské polyomaviry KI a WU: virologické pozadí a klinické důsledky“. APMIS. 121 (8): 746–54. doi:10,1111 / přibližně 12091. PMID  23782405.
  13. ^ Johne, R; Buck, CB; Allander, T; Atwood, WJ; Garcea, RL; Imperiale, MJ; Major, EO; Ramqvist, T; Norkin, LC (září 2011). "Taxonomický vývoj v rodině Polyomaviridae". Archivy virologie. 156 (9): 1627–34. doi:10.1007 / s00705-011-1008-x. PMC  3815707. PMID  21562881.