Interferenční - Interferome

INTERFEROME
Database.png
Obsah
Popisdatabáze interferon regulované geny
OrganismyHomo sapiens
Mus musculus
Pan troglodyty
Kontakt
LaboratořMonash Institute of Medical Research
Univerzita v Cambridge
Primární citaceShamith A Samarajiwa a spol. (2009)[1]
Datum vydání2008
Přístup
webová stránkahttp://www.interferome.org

Interferenční je online bioinformatika databáze z geny regulované interferonem (IRG).[1] Tyto Interferon Regulované geny jsou také známé jako interferonem stimulované geny (ISG). Databáze obsahuje informace o regulovaných genech typu I (IFN alfa, beta), typu II (IFN gama) a typu III (IFN lambda) a je pravidelně aktualizována. To je používáno interferon a cytokin výzkumná komunita [2] jak jako analytický nástroj, tak jako informační zdroj. Interferony byly identifikovány jako antivirové proteiny před více než 50 lety. Jejich zapojení do imunomodulace, proliferace buněk, zánět a další homeostatický procesy byly od té doby identifikovány. Tyto cytokiny se používají jako terapeutika při mnoha onemocněních, jako jsou chronická virový infekce, rakovina a roztroušená skleróza.[3] Tyto interferony regulují transkripci přibližně 2 000 genů způsobem závislým na podtypu interferonu, dávce, typu buňky a stimulu. Tato databáze interferonem regulovaných genů je pokusem o integraci informací z vysoce výkonných experimentů a databází molekulární biologie za účelem získání podrobného porozumění biologii interferonů.

Obsah

Interferome zahrnuje následující soubory dat:

Nástroje

Interferome nabízí mnoho způsobů vyhledávání a načítání dat z databáze:

  • Identifikujte podpisy genů regulovaných interferonem v datech microarray;
  • Genová ontologie analýza a anotace;
  • Normální tkáň exprese interferonem regulovaných genů;
  • Regulační analýza genů regulovaných interferonem;
  • VÝBUCH (Basic Local Alignment Search Tool) analýza a stahování ortologové sekvence;

Správa interferonů

Interferome je řízen týmem v Monash University  :Monash Institute of Medical Research a Univerzita v Cambridge

Reference

  1. ^ A b Samarajiwa, Shamith A; Forster Sam; Auchettl Katie; Hertzog Paul J (leden 2009). „INTERFEROME: databáze interferonem regulovaných genů“. Nucleic Acids Res. Anglie. 37 (Problém s databází): D852-7. doi:10.1093 / nar / gkn732. PMC  2686605. PMID  18996892.
  2. ^ http://www.isicr.org/
  3. ^ http://www.cancerhelp.org.uk/help/default.asp?page=4009

externí odkazy