Ústav matematických problémů biologie - Institute of Mathematical Problems of Biology - Wikipedia

The Ústav matematických problémů biologie RAS (Ruština: Институт математических проблем биологии) je výzkumný ústav se specializací na výpočetní biologie a bioinformatika. Cílem ústavu je vypracování matematických a výpočetních metod pro biologický výzkum, jakož i implementace těchto metod přímo řešících problémy výpočetní biologie.

Od roku 2016 byl přejmenován na Ústav matematických problémů biologie RAS - pobočka Keldyshův institut aplikované matematiky z Ruská akademie věd (IMPB RAS - pobočka KIAM RAS).

Ústav vydává vědecký časopis "Matematická biologie a bioinformatika".^[1]

Struktura ústavu

Členem institutu jsou:

• Laboratoř makromolekulární krystalografie
• Laboratoř kvantově-mechanických systémů
• Laboratoř molekulární dynamiky
• Laboratoř neuronových sítí
• Laboratoř aplikované matematiky
• Laboratoř bioinformatiky
• Laboratoř výpočetní ekologie
• Laboratoř zpracování dat
• Oddělení budoucích informačních technologií
  • Skupina pro počítačové modelování nanostruktur a biosystémů
• Katedra výpočetní techniky a informačních zdrojů

Vědecká činnost

Pokyny k výzkumu

• Teoretický vývoj;
  • teoretické základy nanobioelektronika;
  • vývoj spektro-analytických metod zpracování dat o výsledcích biologických experimentů;
  • vývoj numerických metod zpracování dat o výsledcích biologických experimentů;
  • analytická řešení Integro-diferenciální rovnice;
  • metody analýzy dynamické systémy.
• Zpracování dat
  • analýza činnosti lidský mozek;
  • vývoj metod pro hodnocení biologické rozmanitosti vegetační kryt;
  • vývoj algoritmů a programů pro studium genomové sekvence;
  • vývoj počítačových metod výzkumu primárních struktur biopolymery;
  • vývoj nových metod dešifrování struktury komplexů biologických makromolekul na základě údajů o rozptylu Rentgenové záření a neutrony;
  • vývoj metod pro získávání, zpracování a analýzu digitální obraz v biologii a medicíně.
• Výpočetní biologie
  • simulace dynamiky biomolekulárních systémů;
  • modely neuronových sítí zpracování informací v mozkových strukturách;
  • rostoucí náhodné grafy a jejich aplikace v matematice neurobiologie;
  • studium modelů napěťově řízených iontových kanálů v vzrušující biomembrány;
  • software pro studium buněčný metabolismus;
  • Matematické modely ve Windows biomechanika;
  • numerické řešení problémů kardiofyzika.
• Synergetika (včetně témat jako: dynamický systém, teorie chaosu, nerovnovážná termodynamika, biologie systémů )
  • studium nelineárních modelů autolokalizovaných stavů v kondenzované hmotě;
  • asymptotické metody a numerické modelování při studiu excitační vlny;
  • the teorie rozdvojení funkční diferenciální rovnice a jevy bifurkační paměť.
• Bioinformatika
• Souběžné výpočty
  • rozvoj vysokého výkonu počítačový cluster;
  • CUDA technologie.

Specializované výzkumné projekty

• Projekt „Matematická buňka“;^[2]
• Projekt „Generalized Spectral-Analytical Method“ (GSAM).^[3][4][5]

Pedagogická a společenská činnost

Na základě ústavu, matematická fakulta Pušchino univerzity^[6] byla založena v roce 1994.

Od roku 2006 pořádá institut každé dva roky konferenci “Matematická biologie a bioinformatika".

Dějiny

Milníky

Ústav matematických problémů biologie RAS (IMPB RAS) byl založen v roce 1972. Po organizaci získal institut název Research Computing Center (RCC) Akademie věd SSSR. V roce 1992 bylo Research Computing Center reorganizováno na Ústav matematických problémů biologie RAS.

V důsledku reorganizace v RAS 2015–16^[7] IMPB se stala pobočkou KIAM od 15. února 2016.

Ředitelé

• 1972–98 Molchanov, Albert Makarievich, režisér, matematik.
• 1998–2016 Lakhno, Viktor Dmitrievich, ředitel, matematik.
• od roku 2016 Lakhno, Viktor Dmitrievich, vedoucí pobočky, matematik.

Slavná fakulta a absolventi

• Dedus, Florence Fyodorovich
• Molchanov, Albert Makarievich
• Shnol, Emmanuel El'evich

Reference

externí odkazy

• Webové stránky ústavu