Imunoglobulinová těžká konstanta alfa 1 - Immunoglobulin heavy constant alpha 1

IGHA1
Identifikátory
AliasyIGHA1, IgA1, imunoglobulinová těžká konstanta alfa 1
Externí IDOMIM: 146900 Genové karty: IGHA1
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

n / a

n / a

RefSeq (protein)

n / a

n / a

Místo (UCSC)n / an / a
PubMed Vyhledávání[1]n / a
Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Imunoglobulinová těžká konstanta alfa 1 je imunoglobulinový gen se symbolem IGHA1.[2] Kóduje konstantní (C) segment Imunoglobulin A těžký řetěz. Imunoglobulin A je protilátka který hraje zásadní roli v imunitní funkci v sliznice. IgA vykazuje stejnou typickou strukturu jiných tříd protilátek, se dvěma těžkými řetězci a dvěma lehkými řetězci a čtyřmi odlišnými doménami: jedna variabilní oblast a tři variabilní oblasti. Jako hlavní třída imunoglobulin v sekrecích těla hraje IgA roli při obraně proti infekce, jakož i zabránění přístupu cizinců antigeny do imunologického systému.

Objev

IGHA1 byl poprvé podrobně popsán v roce 1975, kdy primární struktura (aminokyselinová sekvence) IgA byla objasněna sekvenováním tryptických a chymotryptických peptidů.[3] Podobně byla primární sekvence stanovena nezávisle pro řetězec alfa-2 proteinu v roce 1979.[4] Kompletní nukleotidové sekvence pro konstantní oblast těžkého řetězce alfa-1 a alelický Oblasti těžkého řetězce alfa-2 byly publikovány v roce 1984 a ukázaly, že geny byly obsaženy ve třech exony, z nichž každý kóduje jednu oblast proteinové domény.[5]

Umístění genu

Geny kódující IGHA1 se nacházejí na lidský chromozom 14.[6] Sekvence kódující IGHA1 je dlouhá 1 497 nukleotidů a nachází se mezi lokusy 105 707 168 a 105 708 664.[7] Poloha anotovaného chromozomu je také uvedena jako 14q32.33.[8]

Struktura bílkovin

C oblast Ig alfa-1 řetězce je obsažena v první z konstantních oblastí IgA a je složena z aminokyselina sekvence dlouhá 353 zbytků.[9] The sekundární struktura v této oblasti dominuje beta vlákna, které definují čtyři antiparalelní beta listy. Tyto antiparalelní beta-listy se poté sendvičově vytvoří a vytvoří dva typické beta-sendviče terciární struktura třídy skládání imunoglobulinů.[10] Dva beta listy, které tvoří každý beta-sendvič, jsou spojeny znakem alfa šroubovice na jedné straně. Tyto alfa helixy definují vazebné místo pro tento protein s vazebným místem obsahujícím jeden antiparalelní beta řetězec na obou stranách šroubovice.[9] Kromě vazebných míst je opačná strana beta-sendviče spojena řadou smyček, které definují hypervariabilní smyčkový systém, který může hrát roli při určování specificity interakce mezi IgA a antigenem.[11]

Patologické informace

IGHA1 byl zapojen do a chromozomální abnormalita identifikováno v mnohočetný myelom řádky.[12] Abnormalita byla identifikována jako a přemístění událost, kde translokace mezi IGHA1 (nalezeno na chromozomu 14) a FCRL4 (genová sekvence kódující inhibiční receptor nacházející se na chromozomu 1) vede k produkci a fúzní protein.[13]

Reference

  1. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  2. ^ „Entrez Gene: IGHA1 imunoglobulinová těžká konstanta alfa 1“.
  3. ^ Kratzin, H .; Altevogt, P .; Ruban, E .; Kortt, A .; Staroscik, K .; Hilschmann, N. (01.08.1975). „[Primární struktura monoklonálního IgA-imunoglobulinu (IgA Tro.), II. Aminokyselinová sekvence H-řetězce, alfa typu, podskupiny III; struktura kompletní molekuly IgA (autorův transl)]“. Hoppe-Seyler's Zeitschrift für Physiologische Chemie. 356 (8): 1337–1342. ISSN  0018-4888. PMID  809331.
  4. ^ Putnam, F. W .; Liu, Y. S .; Low, T. L. (1979-04-25). „Primární struktura lidského IgA1 imunoglobulinu. IV. Streptokoková IgA1 proteáza, štěpení, fragmenty Fab a Fc a kompletní aminokyselinová sekvence těžkého řetězce alfa 1“. The Journal of Biological Chemistry. 254 (8): 2865–2874. ISSN  0021-9258. PMID  107164.
  5. ^ Flanagan, J. G .; Lefranc, M. P .; Rabbitts, T. H. (01.03.1984). "Mechanismy divergence a konvergence genových sekvencí lidského imunoglobulinu alfa 1 a alfa 2 v konstantní oblasti". Buňka. 36 (3): 681–688. doi:10.1016/0092-8674(84)90348-9. ISSN  0092-8674. PMID  6421489. S2CID  54312675.
  6. ^ „Prohlížeč dat genomu“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2016-10-16.
  7. ^ "IGHA1 imunoglobulinová těžká konstanta alfa 1 [Homo sapiens (člověk)] - gen - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2016-10-16.
  8. ^ „Zpráva o symbolu IGHA1 | Výbor pro genovou nomenklaturu HUGO“. www.genenames.org. Citováno 2016-10-16.
  9. ^ A b Evropa, Proteinová datová banka v. "Ig alfa-1 řetězec C oblast v vstupu PDB 1ow0‹ PDBe ‹EMBL-EBI". www.ebi.ac.uk. Citováno 2016-10-16.
  10. ^ Berg, Jeremy M .; Tymoczko, John L .; Stryer, Lubert (01.01.2002). „Imunoglobulinový záhyb se skládá z beta-sendvičového rámce s hypervariabilní smyčkou“. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  11. ^ Sela-Culang, Inbal; Kunik, Vered; Ofran, Yanay (10.10.2013). „Strukturální základ rozpoznávání protilátek a antigenů“. Hranice v imunologii. 4: 302. doi:10.3389 / fimmu.2013.00302. ISSN  1664-3224. PMC  3792396. PMID  24115948.
  12. ^ "IGHA1 - Ig alfa-1 řetězec C region - Homo sapiens (člověk) - IGHA1 gen a protein". www.uniprot.org. Citováno 2016-10-16.
  13. ^ "Výsledky pro protein: P01876". bioinf.umbc.edu. Citováno 2016-10-16.

Další čtení