ITPKA - ITPKA

ITPKA
Protein ITPKA PDB 1tzd.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyITPKA, IP3-3KA, IP3KA, inositol-trisfosfát 3-kináza A
Externí IDOMIM: 147521 MGI: 1333822 HomoloGene: 1671 Genové karty: ITPKA
Umístění genu (člověk)
Chromozom 15 (lidský)
Chr.Chromozom 15 (lidský)[1]
Chromozom 15 (lidský)
Genomické umístění pro ITPKA
Genomické umístění pro ITPKA
Kapela15q15.1Start41,493,393 bp[1]
Konec41,503,551 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE ITPKA 205874 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

3706

228550

Ensembl

ENSG00000137825

ENSMUSG00000027296

UniProt

P23677

Q8R071

RefSeq (mRNA)

NM_002220

NM_146125

RefSeq (protein)

NP_002211

NP_666237

Místo (UCSC)Chr 15: 41,49 - 41,5 MbChr 2: 119,74 - 119,75 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Inositol-trisfosfát 3-kináza A je enzym že u lidí je kódován ITPKA gen.[5][6][7]

Struktura

ITPKA je jedním ze tří genů inositol-trisfosfát 3-kinázy (ITP3K) u lidí. ITP3K proteiny regulují inositol fosfát metabolismus fosforylace druhého posla inositol 1,4,5-trisfosfát k výrobě Ins (1,3,4,5) P4, který je někdy zkrácen jako IP4. Strukturálně ITPKA patří k inositol polyfosfát kináza (IPK) rodina. Aktivita inositol 1,4,5-trisfosfát 3-kinázy je zodpovědná za regulaci hladin velkého počtu inositol polyfosfátů, které jsou důležité v buněčné signalizaci, zejména inositol trisphosphate, což je jediný substrát enzymu. Jak vápník /klimodulin a jeho aktivitu řídí mechanismy fosforylace proteinů. Je to také substrát pro cyklická AMP-dependentní protein kináza, proteinkináza II závislá na vápníku / kalmodulinu, a protein kináza C. in vitro. ITPKA a ITPKB jsou v EU 68% identické C-konec oblast Aminoterminální oblast ITPKA váže vláknitou aktin. Tato vlastnost lokalizuje ITPKA na dendritické trny v hlavních neuronech.[8][9][10] ITPKA je fyziologicky exprimován v neuronech, ale někdy je exprimován v rakovinných buňkách a může přispívat k procesům metastáz.[11]

Fyziologická funkce

ITPKA se účastní procesů učení a paměti v neuronech.[12][13]

Role v nemoci člověka

Ačkoli je ITPKA fyziologicky exprimován v neuronech a varlatech, někdy se exprimuje v rakovinných buňkách a díky expresi je rakovina obvykle agresivnější.[11][14]

Vztah k F-traktinu

F-traktin je aminokyselina 9-52 krysí ITPKA. Později bylo zjištěno, že aminokyseliny 9-40 jsou dostatečné pro vazbu vláknitého aktinu.[15][16] Při fúzi s reportérem, jako je zelený fluorescenční protein Je užitečný pro vizualizaci dynamiky aktinů v živých buňkách.[17][18]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137825 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027296 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Erneux C, Roeckel N, Takazawa K, Mailleux P, Vassart G, Mattei MG (říjen 1992). „Lokalizace genů pro lidskou inositol 1,4,5-trisfosfát 3-kinázu A (ITPKA) a B (ITPKB) do chromozomových oblastí 15q14-q21 a 1q41-q43 pomocí hybridizace in situ“. Genomika. 14 (2): 546–7. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80265-4. PMID  1330886.
  6. ^ Takazawa K, Perret J, Dumont JE, Erneux C (prosinec 1990). "CDNA sekvence lidského mozku inositol 1,4,5-trisfosfát 3-kinázy". Výzkum nukleových kyselin. 18 (23): 7141. doi:10.1093 / nar / 18.23.7141. PMC  332787. PMID  2175886.
  7. ^ name = "entrez"„Entrez Gene: ITPKA inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A“.
  8. ^ Yamada M, Kakita A, Mizuguchi M, Rhee SG, Kim SU, Ikuta F (březen 1993). "Specifická exprese inositol 1,4,5-trisfosfát 3-kinázy v dendritických trnech". Výzkum mozku. 606 (2): 335–40. doi:10.1016 / 0006-8993 (93) 91004-C. PMID  8387863.
  9. ^ Schell MJ, Erneux C, Irvine RF (říjen 2001). „Inositol 1,4,5-trisfosfát 3-kináza A se asociuje s F-aktinem a dendritickými trny prostřednictvím svého N konce“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (40): 37537–46. doi:10,1074 / jbc.M104101200. PMID  11468283.
  10. ^ Windhorst S, Minge D, Bähring R, Hüser S, Schob C, Blechner C, Lin HY, Mayr GW, Kindler S (březen 2012). „Inositol-1,4,5-trisfosfát 3-kináza A reguluje dendritickou morfologii a tvaruje synaptické Ca2 + přechodné jevy“. Mobilní signalizace. 24 (3): 750–7. doi:10.1016 / j.cellsig.2011.11.010. PMID  22120525.
  11. ^ A b Windhorst S, Fliegert R, Blechner C, Möllmann K, Hosseini Z, Günther T, Eiben M, Chang L, Lin HY, Fanick W, Schumacher U, Brandt B, Mayr GW (únor 2010). „Inositol 1,4,5-trisfosfát 3-kináza-A je nový protein podporující motilitu buněk, který zvyšuje metastatický potenciál nádorových buněk o dvě funkční aktivity“. The Journal of Biological Chemistry. 285 (8): 5541–54. doi:10.1074 / jbc.M109.047050. PMC  2820782. PMID  20022963.
  12. ^ Chung S, Kim IH, Lee D, Park K, Kim JY, Lee YK, Kim EJ, Lee HW, Choi JS, Son GH, Sun W, Shin KS, Kim H (duben 2016). „Role inositol 1,4,5-trisfosfát 3-kinázy A při regulaci emočního chování a funkce amygdaly“. Vědecké zprávy. 6: 23757. doi:10.1038 / srep23757. PMC  4823716. PMID  27053114.
  13. ^ Choi B, Lee HW, Mo S, Kim JY, Kim HW, Rhyu IJ, Hong E, Lee YK, Choi JS, Kim CH, Kim H (2018). „Inositol 1,4,5-trisfosfát 3-kináza A nadměrně exprimovaná v myším předním mozku moduluje synaptický přenos a mGluR-LTD pyramidových neuronů CA1“. PLOS One. 13 (4): e0193859. doi:10.1371 / journal.pone.0193859. PMC  5884490. PMID  29617377.
  14. ^ Windhorst S, Song K, Gazdar AF (srpen 2017). „Inositol-1,4,5-trisfosfát 3-kináza-A (ITPKA) je často nadměrně exprimován a funguje jako onkogen u několika typů nádorů“. Biochemická farmakologie. 137: 1–9. doi:10.1016 / j.bcp.2017.03.023. PMC  5555585. PMID  28377279.
  15. ^ Johnson HW, Schell MJ (prosinec 2009). „Neuronální IP3 3-kináza je protein vázající F-aktiny: role v dendritickém cílení a regulaci morfologie páteře“. Molekulární biologie buňky. 20 (24): 5166–80. doi:10,1091 / mbc.E09-01-0083. PMC  2793293. PMID  19846664.
  16. ^ Yi J, Wu XS, Crites T, Hammer JA (březen 2012). „Aktinový retrográdní tok a kontrakce obloukem aktomyosinu II pohánějí klastrovou dynamiku shluků receptorů na imunologické synapse v Jurkat T buňkách“. Molekulární biologie buňky. 23 (5): 834–52. doi:10,1091 / mbc.E11-08-0731. PMC  3290643. PMID  22219382.
  17. ^ Belin BJ, Goins LM, Mullins RD (2014). "Srovnávací analýza nástrojů pro živé zobrazení buněk aktinové síťové architektury". Bioarchitektura. 4 (6): 189–202. doi:10.1080/19490992.2014.1047714. PMC  4914014. PMID  26317264.
  18. ^ Melak M, Plessner M, Grosse R (únor 2017). „Vizualizace aktinu na první pohled“. Journal of Cell Science. 130 (3): 525–530. doi:10,1242 / jcs.189068. PMID  28082420.

Další čtení