IPO5 - IPO5

IPO5
Identifikátory
Aliasy	IPO5, IMB3, KPNB3, Pse1, RANBP5, imp5, import 5
Externí ID	OMIM: 602008 MGI: 1917822 HomoloGene: 1710 Genové karty: IPO5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	98,024,296 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	120,947,999 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita inhibitoru GTPázy; • Proběhla vazba GTPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba sekvence nukleární lokalizace; • Vazba RNA; • aktivita signálního receptoru jaderného importu;
Buněčná složka	• membrána; • jaderná periferie; • jaderný pór; • jádro; • buněčné jádro; • ne membrána; • cytoplazma;
Biologický proces	• import ribozomálního proteinu do jádra; • buněčná odpověď na stimul aminokyselin; • transport bílkovin; • pozitivní regulace importu bílkovin do jádra; • GO: virový proces 0022415; • transport intracelulárních proteinů; • GO: 0034259 negativní regulace aktivity GTPázy; • Import proteinů nesoucích NLS do jádra; • doprava; • import bílkovin do jádra; • negativní regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kinázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3843
	70572
	ENSG00000065150
	ENSMUSG00000030662
	O00410
	Q8BKC5
	NM_002271
	NM_023579; NM_001360602
	NP_002262
	NP_076068; NP_001347531
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Importin-5 je protein že u lidí je kódován IPO5 gen.^[5]^[6]^[7] Protein kódovaný tímto genem je členem importovat rodina beta.

Funkce

Jaderná doprava, proces závislý na signálu a energii, probíhá prostřednictvím komplexů jaderných pórů zabudovaných do jaderný obal. Import proteinů obsahujících a signál jaderné lokalizace (NLS) vyžaduje importní receptor NLS, heterodimer importních alfa a beta podjednotek, také známý jako karyofheriny. Importin alfa váže náklad obsahující NLS v cytoplazmě a importin beta dokuje komplex na cytoplazmatické straně komplexu jaderných pórů. V přítomnosti nukleosid trifosfátů a malého proteinu vázajícího GTP Běžel, komplex se přesune do komplexu jaderných pórů a importinové podjednotky se oddělí. Importin alfa vstupuje do nukleoplazmy s cestujícím proteinem a importin beta zůstává v póru. Interakce mezi importinem beta a FG opakováním nukleoporinů jsou nezbytné při translokaci komplexem pórů.^[8]

IPO5 usnadňuje translokaci cytoplazmatického polyadenylačního prvku vázajícího protein (CPEB) 3 vazbou na motiv RRM1 CPEB3 v neuronech. Signalizace NMDAR zvyšuje expresi RanBP1 a snižuje hladinu cytoplazmatického Ran vázaného na GTP. Tyto změny zvyšují interakci CPEB3 – IPO5, což následně zrychluje jaderný import CPEB3 a podporuje jeho jadernou funkci.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000065150 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030662 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yaseen NR, Blobel G (květen 1997). "Klonování a charakterizace lidského karyofherinu beta3". Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (9): 4451–6. doi:10.1073 / pnas.94.9.4451. PMC 20743. PMID 9114010.
^ Deane R, Schäfer W, Zimmermann HP, Mueller L, Görlich D, Prehn S, Ponstingl H, Bischoff FR (září 1997). „Ran-binding protein 5 (RanBP5) souvisí s nukleinovým transportním faktorem importin-beta, ale interaguje odlišně s RanBP1“. Mol Cell Biol. 17 (9): 5087–96. PMC 232359. PMID 9271386.
^ Deng T, Engelhardt OG, Thomas B, Akoulitchev AV, Brownlee GG, Fodor E (listopad 2006). „Role proběhlého vazebného proteinu 5 v jaderném importu a sestavení komplexu RNA polymerázy viru chřipky. J Virol. 80 (24): 11911–9. doi:10.1128 / JVI.01565-06. PMC 1676300. PMID 17005651.
^ „Entrez Gene: RANBP5 RAN binding protein 5“.
^ Chao HW, Lai YT, Lu YL, Lin CL, Mai W, Huang YS (září 2012). „Signalizace NMDAR usnadňuje IPO5 zprostředkovaný jaderný import CPEB3“. Nucleic Acids Res. 40 (17): 8484–98. doi:10.1093 / nar / gks598. PMC 3458550. PMID 22730302.

Další čtení

Bukrinsky MI, Haffar OK (2004). „Jaderný import HIV-1: při hledání vůdce“. Přední. Biosci. 2: d578–87. doi:10.2741 / A213. PMID 9366553.
Bukrinsky MI, Haffar OK (1998). „Jaderný import HIV-1: maticový protein je zpět v centru pozornosti, tentokrát společně s Vpr“. Mol. Med. 4 (3): 138–43. doi:10.1007 / BF03401911. PMC 2230352. PMID 9562972.
Christophe D, Christophe-Hobertus C, Pichon B (2000). "Jaderné cílení na proteiny: kolik různých signálů?". Buňka. Signál. 12 (5): 337–41. doi:10.1016 / S0898-6568 (00) 00077-2. PMID 10822175.
Chook YM, Blobel G (2002). "Karyofheriny a jaderný dovoz". Curr. Opin. Struct. Biol. 11 (6): 703–15. doi:10.1016 / S0959-440X (01) 00264-0. PMID 11751052.
Bukrinsky MI, Sharova N, Dempsey MP, Stanwick TL, Bukrinskaya AG, Haggerty S, Stevenson M (1992). „Aktivní jaderný import preintegračních komplexů viru lidské imunodeficience typu 1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (14): 6580–4. doi:10.1073 / pnas.89.14.6580. PMC 49545. PMID 1631159.
Bukrinsky MI, Haggerty S, Dempsey MP, Sharova N, Adzhubel A, Spitz L, Lewis P, Goldfarb D, Emerman M, Stevenson M (1993). "Signál nukleární lokalizace v proteinu matrice HIV-1, který řídí infekci nedělících se buněk". Příroda. 365 (6447): 666–9. doi:10.1038 / 365666a0. PMID 8105392.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Gallay P, Hope T, Chin D, Trono D (1997). „HIV-1 infekce nedělících se buněk rozpoznáním integrázy cestou importin / karyoferin“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (18): 9825–30. doi:10.1073 / pnas.94.18.9825. PMC 23276. PMID 9275210.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Henderson BR, Percipalle P (1998). „Interakce mezi HIV Rev a nukleárními importními a exportními faktory: signál nukleární lokalizace Rev zprostředkovává specifickou vazbu na lidský importin-beta“. J. Mol. Biol. 274 (5): 693–707. doi:10.1006 / jmbi.1997.1420. PMID 9405152.
Efthymiadis A, Briggs LJ, Jans DA (1998). „Sekvence nukleární lokalizace HIV-1 Tat propůjčuje nové vlastnosti jaderného importu“. J. Biol. Chem. 273 (3): 1623–8. doi:10.1074 / jbc.273.3.1623. PMID 9430704.
Vodička MA, Koepp DM, Silver PA, Emerman M (1998). „HIV-1 Vpr interaguje s cestou transportu jader za účelem podpory infekce makrofágů“. Genes Dev. 12 (2): 175–85. doi:10.1101 / gad.12.2.175. PMC 316441. PMID 9436978.
Popov S, Rexach M, Zybarth G, Reiling N, Lee MA, Ratner L, Lane CM, Moore MS, Blobel G, Bukrinsky M (1998). „Virový protein R reguluje jaderný import předintegračního komplexu HIV-1“. EMBO J.. 17 (4): 909–17. doi:10.1093 / emboj / 17.4.909. PMC 1170440. PMID 9463369.
Popov S, Rexach M, Ratner L, Blobel G, Bukrinsky M (1998). „Virový protein R reguluje dokování preintegračního komplexu HIV-1 do komplexu jaderných pórů“. J. Biol. Chem. 273 (21): 13347–52. doi:10.1074 / jbc.273.21.13347. PMID 9582382.
Fouchier RA, Meyer BE, Simon JH, Fischer U, Albright AV, González-Scarano F, Malim MH (1998). „Interakce proteinu Vpr viru lidské imunodeficience typu 1 s komplexem jaderných pórů“. J. Virol. 72 (7): 6004–13. PMC 110405. PMID 9621063.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000065150 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030662 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9114010-5] Yaseen NR, Blobel G (květen 1997). "Klonování a charakterizace lidského karyofherinu beta3". Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (9): 4451–6. doi:10.1073 / pnas.94.9.4451. PMC 20743. PMID 9114010.

[pmid9271386-6] Deane R, Schäfer W, Zimmermann HP, Mueller L, Görlich D, Prehn S, Ponstingl H, Bischoff FR (září 1997). „Ran-binding protein 5 (RanBP5) souvisí s nukleinovým transportním faktorem importin-beta, ale interaguje odlišně s RanBP1“. Mol Cell Biol. 17 (9): 5087–96. PMC 232359. PMID 9271386.

[pmid17005651-7] Deng T, Engelhardt OG, Thomas B, Akoulitchev AV, Brownlee GG, Fodor E (listopad 2006). „Role proběhlého vazebného proteinu 5 v jaderném importu a sestavení komplexu RNA polymerázy viru chřipky. J Virol. 80 (24): 11911–9. doi:10.1128 / JVI.01565-06. PMC 1676300. PMID 17005651.

[entrez-8] „Entrez Gene: RANBP5 RAN binding protein 5“.

[pmid22730302-9] Chao HW, Lai YT, Lu YL, Lin CL, Mai W, Huang YS (září 2012). „Signalizace NMDAR usnadňuje IPO5 zprostředkovaný jaderný import CPEB3“. Nucleic Acids Res. 40 (17): 8484–98. doi:10.1093 / nar / gks598. PMC 3458550. PMID 22730302.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]