IGF2BP1 - IGF2BP1

IGF2BP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3KRM
Identifikátory
Aliasy	IGF2BP1, CRD-BP, CRDBP, IMP-1, IMP1, VICKZ1, ZBP1, inzulin podobný růstový faktor 2 protein vázající mRNA 1
Externí ID	OMIM: 608288 MGI: 1890357 HomoloGene: 4772 Genové karty: IGF2BP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	49,056,145 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	96,005,940 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• činnost regulačního orgánu překladu; • mRNA 3'-UTR vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • mRNA 5'-UTR vazba; • mRNA vazba; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • CRD zprostředkovaný komplex stability mRNA; • buněčná projekce; • filopodium; • růstový kužel; • dendritická páteř; • axon; • dendrit; • perinukleární oblast cytoplazmy; • Stresová granule; • buněčné jádro; • lamellipodium; • nukleoplazma; • cytosol; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• Stabilizace mRNA zprostředkovaná CRD; • transport mRNA; • negativní regulace překladu; • proliferace buněk pallium v předním mozku; • udržování populace neuronálních kmenových buněk; • regulace procesu biosyntézy cytokinů; • Lokalizace RNA; • regulace překladu; • regulace stability mRNA při reakci na stres; • regulace stability mRNA; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10642
	140486
	ENSG00000159217
	ENSMUSG00000013415
	Q9NZI8
	O88477
	NM_001160423; NM_006546
	NM_009951
	NP_001153895; NP_006537
	NP_034081
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inzulinu podobný růstový faktor 2 protein vázající mRNA 1 je protein že u lidí je kódován IGF2BP1 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje člena rodiny IGF-II mRNA-vázající protein (IMP). Protein kódovaný tímto genem obsahuje čtyři K homologické domény a dvě RNA rozpoznávací motivy. Funguje vazbou na 5 'UTR růstový faktor podobný inzulínu 2 (IGF2) mRNA a regulace překladu IGF2.^[7]

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000159217 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000013415 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nielsen J, Christiansen J, Lykke-Andersen J, Johnsen AH, Wewer UM, Nielsen FC (únor 1999). „Rodina proteinů vázajících mRNA na inzulinový růstový faktor II potlačuje translaci v pozdním vývoji“. Mol Cell Biol. 19 (2): 1262–70. doi:10.1128 / MCB.19.2.1262. PMC 116055. PMID 9891060.
^ Yaniv K, Yisraeli JK (květen 2002). „Zapojení konzervované rodiny proteinů vázajících RNA do embryonálního vývoje a karcinogeneze“. Gen. 287 (1–2): 49–54. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00866-6. PMID 11992722.
^ ^A ^b "Entrez Gene: IGF2BP1 inzulinový růstový faktor 2 mRNA vázající protein 1".

Další čtení

Perycz M, Urbanska AS, Krawczyk P, Parobczak K, Jaworski J (2011). „Vazebný protein 1 pro zip reguluje vývoj dendritických trnů v hipokampálních neuronech“. J. Neurosci. 31 (14): 5271–85. doi:10.1523 / JNEUROSCI.2387-10.2011. PMID 21471362.
Yisraeli JK (2005). „Proteiny VICKZ: multitalentovaná rodina regulačních proteinů vázajících RNA“. Biol. Buňka. 97 (1): 87–96. doi:10.1042 / BC20040151. PMID 15601260. S2CID 8767105.
Prokipcak RD, Herrick DJ, Ross J. (1994). "Čištění a vlastnosti proteinu, který se váže na C-koncovou kódující oblast lidské c-myc mRNA". J. Biol. Chem. 269 (12): 9261–9. PMID 8132663.
Doyle GA, Betz NA, Leeds PF a kol. (1999). „Protein vázající determinant kódující oblast c-myc: člen rodiny proteinů vázajících RNA na KH doménu“. Nucleic Acids Res. 26 (22): 5036–44. doi:10.1093 / nar / 26.22.5036. PMC 147974. PMID 9801297.
Runge S, Nielsen FC, Nielsen J a kol. (2000). „H19 RNA váže čtyři molekuly proteinu vázajícího mRNA na růstový faktor II podobný inzulínu“. J. Biol. Chem. 275 (38): 29562–9. doi:10,1074 / jbc.M001156200. PMID 10875929.
Nielsen FC, Nielsen J, Kristensen MA a kol. (2003). "Cytoplazmatický přenos IGF-II mRNA-vázajícího proteinu konzervovanými KH doménami". J. Cell Sci. 115 (Pt 10): 2087–97. PMID 11973350.
Lemm I, Ross J. (2002). „Regulace úpadku mRNA c-myc překladovým pozastavením v determinantu nestability kódovací oblasti“. Mol. Buňka. Biol. 22 (12): 3959–69. doi:10.1128 / MCB.22.12.3959-3969.2002. PMC 133878. PMID 12024010.
Ioannidis P, Mahaira L, Papadopoulou A a kol. (2003). „8q24 Zisk počtu kopií a exprese proteinu CRD-BP stabilizujícího c-myc mRNA v primárních karcinomech prsu“. Int. J. Cancer. 104 (1): 54–9. doi:10.1002 / ijc.10794. PMID 12532419. S2CID 45119038.
Nielsen J, Adolph SK, Rajpert-De Meyts E a kol. (2003). „Nuclear transit of human zipcode-binding protein IMP1“. Biochem. J. 376 (Pt 2): 383–91. doi:10.1042 / BJ20030943. PMC 1223771. PMID 12921532.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gu L, Shigemasa K, Ohama K (2004). „Zvýšená exprese mRNA mRNA vázající protein IGF II 1 je spojena s pokročilým klinickým stadiem a špatnou prognózou u pacientek s rakovinou vaječníků“. Int. J. Oncol. 24 (3): 671–8. doi:10,3892 / ijo.24.3.671. PMID 14767552.
Hansen TV, Hammer NA, Nielsen J a kol. (2004). „Dwarfism and Impaired Gut Development in Insulin-like Growth Factor II mRNA-Binding Protein 1-Deficient myši“. Mol. Buňka. Biol. 24 (10): 4448–64. doi:10.1128 / MCB.24.10.4448-4464.2004. PMC 400488. PMID 15121863.
Ioannidis P, Kottaridi C, Dimitriadis E a kol. (2004). „Exprese proteinu CRD-BP vázajícího RNA v mozku a nemalobuněčných plicních nádorech“. Cancer Lett. 209 (2): 245–50. doi:10.1016 / j.canlet.2003.12.015. PMID 15159028.
Rackham O, Brown CM (2005). „Vizualizace interakcí RNA – protein v živých buňkách: FMRP a IMP1 interagují na mRNA“. EMBO J.. 23 (16): 3346–55. doi:10.1038 / sj.emboj.7600341. PMC 514514. PMID 15282548.
Nielsen J, Kristensen MA, Willemoës M a kol. (2004). „Sekvenční dimerizace lidského proteinu vázajícího na zipcode IMP1 na RNA: kooperativní mechanismus zajišťující stabilitu RNP“. Nucleic Acids Res. 32 (14): 4368–76. doi:10.1093 / nar / gkh754. PMC 514376. PMID 15314207.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových regionech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Liao B, Patel M, Hu Y a kol. (2005). „Cílený knockdown proteinu vázajícího RNA CRD-BP podporuje buněčnou proliferaci cestou závislou na inzulínu podobném růstovém faktoru II v lidských leukemických buňkách K562“. J. Biol. Chem. 279 (47): 48716–24. doi:10,1074 / jbc.M405853200. PMID 15355996.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000159217 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000013415 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9891060-5] Nielsen J, Christiansen J, Lykke-Andersen J, Johnsen AH, Wewer UM, Nielsen FC (únor 1999). „Rodina proteinů vázajících mRNA na inzulinový růstový faktor II potlačuje translaci v pozdním vývoji“. Mol Cell Biol. 19 (2): 1262–70. doi:10.1128 / MCB.19.2.1262. PMC 116055. PMID 9891060.

[pmid11992722-6] Yaniv K, Yisraeli JK (květen 2002). „Zapojení konzervované rodiny proteinů vázajících RNA do embryonálního vývoje a karcinogeneze“. Gen. 287 (1–2): 49–54. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00866-6. PMID 11992722.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: IGF2BP1 inzulinový růstový faktor 2 mRNA vázající protein 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]