Halorhabdus - Halorhabdus

Halorhabdus
Vědecká klasifikace
Doména:	Archaea
Království:	Euryarchaeota
Kmen:	Euryarchaeota
Třída:	Halobakterie
Objednat:	Halobacteriales
Rodina:	Halobacteriaceae
Rod:	Halorhabdus; Wainø et al. 2000 emend. Antunes a kol. 2008[Citace je zapotřebí ]
Druh
	H. tiamatea Antunes a kol. 2008; H. utahensis Wainø et al. 2000 (typ sp.);

v taxonomie, Halorhabdus je rod z Halobacteriaceae.

Popis a význam

Halorhabdus utahensis (tyč milující sůl) je pohyb, Gramnegativní extrémně halofilní archaeon, který tvoří červené, kruhové kolonie. Roste při teplotách mezi 17 a 55 ° C, přičemž optimální růst nastává při 50 ° C. Může také růst v rozmezí pH 5,5–8,5 s optimální hodnotou pH mezi 6,7 a 7,1. Dále, s extrémně vysokým optimem slanosti 27% NaCl, Halorhabdus má jedno z nejvyšších hodnot slanosti optima jakéhokoli živého organismu.

Struktura genomu

Genom Halorhabdus byl sekvenován v srpnu 2014.^[1] Obsah G + C v jeho DNA se odhaduje na 64%.

Struktura buněk a metabolismus

Buňky H. utahensis jsou extrémně pleomorfní, vykazující jakýkoli tvar od nepravidelného kokcoidu nebo elipsoidu po trojúhelníkové, kyjovité nebo tyčkovité tvary. Tyčkovité a elipsoidní buňky mají velikost 2 - 10 x 0,5 - 1 um a 1 - 2 x 1 um, přičemž sférické buňky mají průměr přibližně 1 um. Archeon používá pro růst pouze omezený rozsah substrátů, jako je glukóza, xylóza a fruktóza, a je jedinečný svou neschopností využívat kvasnicový extrakt nebo pepton. Mezi další látky, které nestimulovaly růst organismu, patří organické kyseliny, aminokyseliny, alkoholy, glykogen a škrob.

Ekologie

Kmeny H. utahensis byly izolovány ze vzorků z Great Salt Lake, Utah, USA.^[2]

Reference

^ Werner, J (srpen 2014). „Halorhabdus tiamatea: měření proteogenomiky a aktivity glykosidázy identifikují první kultivovaný euryarcheon z hlubinného anoxického slaného jezera jako potenciálního degradátoru polysacharidů“. Mikrobiologie prostředí. 16 (8): 2525–37. doi:10.1111/1462-2920.12393. PMC 4257568. PMID 24428220.
^ Viz NCBI webová stránka na Halorhabdus. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.

Další čtení

Vědecké časopisy

Waino M, Tindall BJ, Ingvorsen K (2000). „Halorhabdus utahensis gen. Nov., Sp. Nov., Aerobní, extrémně halofilní člen Archea z Velkého slaného jezera v Utahu“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50: 183–190. doi:10.1099/00207713-50-1-183. PMID 10826803.
Euzeby JP, Boemare NE (2000). „Moderní latinské slovo rhabdus patří k ženskému rodu a vyvolává nezbytné opravy podle pravidel 65 (2), 12c (1) a 13b Bacteriologického zákoníku (revize z roku 1990)“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (4): 1691–1692. doi:10.1099/00207713-50-4-1691. PMID 10939678.
Oren A, Ventosa A (2000). „Mezinárodní výbor pro systematickou bakteriologii Podvýbor pro taxonomii Halobacteriaceae. Zápis ze schůze, 16. srpna 1999, Sydney, Austrálie“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (3): 1405–1407. doi:10.1099/00207713-50-3-1405. PMID 10843089.

Vědecké knihy

Gibbons, NE (1974). „Rodina V. Halobacteriaceae fam. Nov.“. V RE Buchanan; NE Gibbons (eds.). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (8. vydání). Baltimore: Williams & Wilkins Co.

Vědecké databáze

externí odkazy

Tento archaea související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Werner, J (srpen 2014). „Halorhabdus tiamatea: měření proteogenomiky a aktivity glykosidázy identifikují první kultivovaný euryarcheon z hlubinného anoxického slaného jezera jako potenciálního degradátoru polysacharidů“. Mikrobiologie prostředí. 16 (8): 2525–37. doi:10.1111/1462-2920.12393. PMC 4257568. PMID 24428220.

[2] Viz NCBI webová stránka na Halorhabdus. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.

[1]

[2]