Haloquadratum - Haloquadratum - Wikipedia
| Haloquadratum | |
|---|---|
 | |
| Vědecká klasifikace | |
| Doména: | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | Haloquadratum Popáleniny et al. 2007 |
| Druh | |
Haloquadratum je halofilní rod z rodina Halobacteriaceae.[1] První druh, který lze identifikovat v této skupině, Haloquadratum walsbyi, je neobvyklý v tom, že jeho buňky mají tvar čtvercových plochých krabic.[2]
Tento archaean, objeven v roce 1980 A.E. Walsby v Gavish Sabkha,[3] pobřežní hypersalinní bazén (sabkha ) na Sinajský poloostrov v Egypt, nebyl kultivován až do roku 2004.[4]
Buňky obvykle obsahují polyhydroxyalkanoát (PHA) granule, stejně jako velké množství refraktilní, naplněné plynem vakuoly které poskytují vztlak v vodní prostředí a může pomoci umístěte buňky tak, aby se maximalizovaly sklizeň světla.[5] Buňky mohou připojit se k ostatním k vytvoření křehkých listů až 40 mikrometry široký.
H. walsbyi lze najít kdekoli[Citace je zapotřebí ] v hypersalinné vody. Když mořská voda se odpařuje, vysoká koncentrace a srážení uhličitan vápenatý a síran vápenatý Výsledkem je hypersalin chlorid sodný - bohatá solanka. Další odpařování vede ke srážení chloridu sodného nebo halit, a poté na koncentrovanou chlorid hořečnatý solanka pojmenovaná hořký. Během závěrečné fáze tvorby halitu, než koncentrace chloridu hořečnatého způsobí, že se stane solankou sterilní, H. walsbyi vzkvétá a může tvořit 80% biomasy solného roztoku.
Popis a význam
H. walsbyi byl poprvé objeven v roce 1980 uživatelem A.E. Walsby v Gavish Sabkha, pobřežním slaném nálevu na Sinajském poloostrově v Egyptě a formálně popsaném Burnsem et al. v roce 2007.[4] Organismy byly pozoruhodné díky své extrémně tenké (kolem 0,15 μm), čtvercové struktuře. V laboratoři se pěstoval až v roce 2004.
Struktura genomu
Mapování H. walsbyi 'Genom byl dokončen, což umožňuje lepší pochopení genealogie a taxonomie organismu a role, kterou hraje v ekosystému.[6] Genomické srovnání španělských a australských izolátů (kmeny HBSQ001 a C23T) silně naznačuje rychlou globální disperzi, protože jsou si tak podobné a zachovaly si genové pořadí (synteny).[7]
Struktura buněk a metabolismus
H. walsbyi má jedinečný tvar buňky - tvar extrémně tenkého čtverce, jeho nejznámější charakteristika. Buňky disponují množstvím intracelulárních refrakčních těl známých jako plynové vakuoly - vakuoly naplněné plynem, které poskytují vztlak - udržují horní polohu ve vodním sloupci. Jednotlivé čtvercové buňky jsou spojeny s ostatními za vzniku velkých listů, někdy až 40 um. Tyto listy jsou extrémně křehké a spojení mezi buňkami se snadno rozbije.
Jeho způsob metabolismu není zcela znám; úplná genetická informace poskytne vědcům potřebný přehled.
Ekologie
H. walsbyi byl poprvé zaznamenán a převzat z fyziologických roztoků v Egyptě, ale lze jej nalézt v hypersalinních vodních útvarech po celém světě. Odpařování vody v těchto bazénech zanechává vysoké koncentrace soli, což zajišťuje optimální růstové prostředí. Podle Bolhuise et al.„V tomto smyslu jsou nejhypertičtějšíhalofilní známé další organismy, protože další koncentrace hořečnatých solí (bitternů) vede ke sterilitě solných roztoků. “Jeho přesná role v ekosystému není známa jistě, ale díky jeho jedinečné morfologii bude více informací o něm jistě poskytovat nějaké informace o vývoj a morfologická adaptace archaeanů.
Reference
- ^ Viz NCBI webové stránky na Haloquadratum. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.
- ^ Stoeckenius W (1. října 1981). „Walsbyho čtvercová bakterie: jemná struktura ortogonálního prokaryota“. J. Bacteriol. 148 (1): 352–60. doi:10.1128 / JB.148.1.352-360.1981. PMC 216199. PMID 7287626.
- ^ Walsby, A. E. (1980). "Čtvercová bakterie". Příroda. 283 (5742): 69–71. Bibcode:1980Natur.283 ... 69W. doi:10.1038 / 283069a0.
- ^ A b Burns, D. G .; Janssen, P. H .; Itoh, T .; Kamekura, M .; Li, Z .; Jensen, G .; Rodriguez-Valera, F .; Bolhuis, H .; Dyall-Smith, M. L. (2007). "Haloquadratum walsbyi gen. nov., sp. nov., čtvercový haloarchaeon Walsby, izolovaný od solných krystalizátorů v Austrálii a Španělsku ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 57 (2): 387. doi:10.1099 / ijs.0.64690-0. PMID 17267984.
- ^ Oren A, Pri-El N, Shapiro O, Siboni N (2006). „Studie vztlaku v přírodních společenstvech čtvercových plyn-vakuolátových archaeí v nádržích solného krystalizátoru“. Solné systémy. 2: 4. doi:10.1186/1746-1448-2-4. PMC 1459177. PMID 16613609.
- ^ [https://archive.is/20140223073536/http://cmr.jcvi.org/cgi-bin/CMR/GenomePage.cgi?org=nthw01 archivováno 2014-02-23 v Archiv. Dnes Institut J. Craiga Ventera ]
- ^ Dyall-Smith, M. L .; Pfeiffer, F .; Klee, K .; Palm, P .; Gross, K .; Schuster, S. C .; Rampp, M .; Oesterhelt, D. (2011). Lopez-Garcia, Purification (ed.). „Haloquadratum walsbyi: Limited Diversity in a Global Pond“. PLOS ONE. 6 (6): e20968. Bibcode:2011PLoSO ... 620968D. doi:10.1371 / journal.pone.0020968. PMC 3119063. PMID 21701686.
Další čtení
- Burns DG, Camakaris HM, Janssen PH, Dyall-Smith ML (2004). "Pěstování Walsbyho čtvercového haloarchaeonu". FEMS Microbiol. Lett. 238 (2): 469–73. doi:10.1016 / j.femsle.2004.08.016. PMID 15358434.
- Oren A, Ventosa A (2000). „Mezinárodní výbor pro systematickou bakteriologii Podvýbor pro taxonomii Halobacteriaceae. Zápis ze schůze, 16. srpna 1999, Sydney, Austrálie“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50: 1405–7. doi:10.1099/00207713-50-3-1405. PMID 10843089.
- Gibbons, NE (1974). „Čeleď V. Halobacteriaceae fam. Nov.“. V RE Buchanan; NE Gibbons (eds.). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (8. vydání). Baltimore: Williams & Wilkins Co. ISBN 0-683-01117-0.