HUWE1 - HUWE1

HUWE1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EKK, 3G1N, 3H1D, 2MUL
Identifikátory
Aliasy	HUWE1, ARF-BP1, HECTH9, HSPC272, Ib772, LASU1, MULE, URE-B1, UREB1, HECT, UBA a WWE doména obsahující 1, E3 ubikvitinová proteinová ligáza, HECT, UBA a WWE doména obsahující E3 ubikvitinová proteinová ligáza 1, MRXST
Externí ID	OMIM: 300697 MGI: 1926884 HomoloGene: 45994 Genové karty: HUWE1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	53,686,728 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	151,935,417 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • Vazba RNA; • aktivita transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • extracelulární exosom; • membrána; • nukleoplazma; • extracelulární oblast; • cytosol; • lumen sekreční granule; • lumen granule bohaté na ficolin-1; • buněčné jádro;
Biologický proces	• buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • diferenciace buněk; • monoubikvitinace bílkovin; • ubikvitinace histonu; • Oprava DNA; • ubikvitinace bílkovin; • oprava základní excize; • pozitivní regulace cílení proteinů na mitochondrie; • polyubikvitinace bílkovin; • degranulace neutrofilů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10075
	59026
	ENSG00000086758
	ENSMUSG00000025261
	Q7Z6Z7
	Q7TMY8
	NM_031407
	NM_021523
	NP_113584
	NP_067498
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza HUWE1 je enzym že u lidí je kódován HUWE1 gen.^[5]^[6]^[7]

Provádí třetí krok (ligaci) ve vazbě ubikvitin na proteiny v procesu zvaném ubikvitinace který označuje proteiny k likvidaci.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000086758 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025261 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (září 1997). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. DNA Res. 4 (2): 141–50. doi:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.
^ Jackson PK, Eldridge AG, Freed E, Furstenthal L, Hsu JY, Kaiser BK, Reimann JD (listopad 2000). "Tradice RINGů: rozpoznávání substrátu a katalýza ubikvitinovými ligázami". Trends Cell Biol. 10 (10): 429–39. doi:10.1016 / S0962-8924 (00) 01834-1. PMID 10998601.
^ „Entrez Gene: HUWE1 HECT, UBA a WWE doména obsahující 1“.

Další čtení

Gu J, Dubner R, Fornace AJ, Iadarola MJ (1995). „UREB1, tyrosin fosforylovaný jaderný protein, inhibuje transaktivaci p53“. Onkogen. 11 (10): 2175–8. PMID 7478539.
Gu J, Ren K, Dubner R, Iadarola MJ (1994). „Klonování proteinu vázajícího DNA, který je substrátem tyrosinkinázy a rozpoznává upstream sekvenci podobnou iniciátoru v promotoru genu preprodynorfinu“. Brain Res. Mol. Brain Res. 24 (1–4): 77–88. doi:10.1016 / 0169-328X (94) 90120-1. PMID 7968380.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Nagase T, Kikuno R, Nakayama M a kol. (2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (4): 273–81. doi:10.1093 / dnares / 7.4.271. PMID 10997877.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámečky pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v buňkách hematopoetických kmenových / progenitorových buněk CD34 +“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Yoon SY, Lee Y, Kim JH a kol. (2005). „Nadměrná exprese lidského UREB1 u kolorektálního karcinomu: HECT doména lidského UREB1 inhibuje aktivitu proteinu potlačujícího tumor p53“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 326 (1): 7–17. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.11.004. PMID 15567145.
Liu Z, Oughtred R, Wing SS (2005). „Charakterizace E3Histonu, nové ubikvitinové proteinové ligázy varlat, která ubikvitinuje histony“. Mol. Buňka. Biol. 25 (7): 2819–31. doi:10.1128 / MCB.25.7.2819-2831.2005. PMC 1061639. PMID 15767685.
Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ a kol. (2005). „Sekvence DNA lidského chromozomu X“. Příroda. 434 (7031): 325–37. doi:10.1038 / nature03440. PMC 2665286. PMID 15772651.
Chen D, Kon N, Li M a kol. (2005). „ARF-BP1 / Mule je kritickým mediátorem nádorového supresoru ARF“. Buňka. 121 (7): 1071–83. doi:10.1016 / j.cell.2005.03.037. PMID 15989956. S2CID 16176749.
Zhong Q, Gao W, Du F, Wang X (2005). „Mule / ARF-BP1, ubikvitinová ligáza obsahující pouze BH3 E3, katalyzuje polyubikvitinaci Mcl-1 a reguluje apoptózu.“ Buňka. 121 (7): 1085–95. doi:10.1016 / j.cell.2005.06.009. PMID 15989957. S2CID 16656949.
Warr MR, Acoca S, Liu Z a kol. (2005). „BH3-ligand reguluje přístup MCL-1 k jeho E3 ligáze“. FEBS Lett. 579 (25): 5603–8. doi:10.1016 / j.febslet.2005.09.028. PMID 16213503. S2CID 4981009.
Adhikary S, Marinoni F, Hock A a kol. (2005). „Ubikvitinová ligáza HectH9 reguluje transkripční aktivaci pomocí Myc a je nezbytná pro proliferaci nádorových buněk“. Buňka. 123 (3): 409–21. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.016. PMID 16269333. S2CID 15338406.

externí odkazy

HUWE1 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
HUWE1 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000086758 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025261 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9205841-5] Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (září 1997). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. DNA Res. 4 (2): 141–50. doi:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.

[pmid10998601-6] Jackson PK, Eldridge AG, Freed E, Furstenthal L, Hsu JY, Kaiser BK, Reimann JD (listopad 2000). "Tradice RINGů: rozpoznávání substrátu a katalýza ubikvitinovými ligázami". Trends Cell Biol. 10 (10): 429–39. doi:10.1016 / S0962-8924 (00) 01834-1. PMID 10998601.

[entrez-7] „Entrez Gene: HUWE1 HECT, UBA a WWE doména obsahující 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]