HP1BP3 - HP1BP3 - Wikipedia
Heterochromatinový protein 1, vazebný protein 3 je protein že u lidí je kódován HP1BP3 gen.[5] Byl identifikován jako nový podtyp linkeru histon H1, zapojený do struktury heterochromatinu [6][7][8]
Modelové organismy
| Charakteristický | Fenotyp |
|---|---|
| Homozygot životaschopnost | Abnormální |
| Recesivní smrtící studie | Normální |
| Plodnost | Normální |
| Tělesná hmotnost | Abnormální[9] |
| Úzkost | Normální |
| Neurologické hodnocení | Normální |
| Síla úchopu | Normální |
| Horký talíř | Normální |
| Dysmorfologie | Normální |
| Nepřímá kalorimetrie | Normální |
| Zkouška tolerance glukózy | Normální |
| Sluchová odezva mozkového kmene | Normální |
| DEXA | Abnormální[10] |
| Radiografie | Normální |
| Tělesná teplota | Normální |
| Morfologie očí | Normální |
| Klinická chemie | Abnormální[11] |
| Hematologie | Normální |
| Lymfocyty periferní krve | Abnormální |
| Mikrojaderný test | Normální |
| Váha srdce | Abnormální[12] |
| Oční histopatologie | Normální |
| Citrobacter infekce | Normální[13] |
| Všechny testy a analýzy od[14][15] |
Modelové organismy byly použity při studiu funkce HP1BP3. Podmíněný knockout myš linka, tzv Hp1bp3tm1a (EUCOMM) Wtsi[16][17] byl vygenerován jako součást International Knockout Mouse Consortium program - vysoce výkonný projekt mutageneze pro generování a distribuci zvířecích modelů nemocí zainteresovaným vědcům - na Wellcome Trust Sanger Institute.[18][19][20] Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka k určení účinků vypuštění.[14][21] Bylo provedeno dvacet tři testů a šest významných fenotypy byly hlášeny. Méně homozygotní mutant embrya byla identifikována během těhotenství, než předpovídal Mendelianův poměr. Homozygotní mutantní dospělé ženy měly sníženou tělesnou hmotnost, hmotnost srdce a kostní minerální hustota a zvýšené množství krve močovina úrovně a T buňka číslo.[14]
Nedostatek HP1BP3 u myší má za následek těžký nanismus a poškození kostní hmoty způsobené změněnou endokrinní signalizací IGF-1.[22] Gen je vysoce exprimován v mozku a pro myši byla popsána řada behaviorálních fenotypů. Nedostatek HP1BP3 vedl k narušení chování matky a snížení úzkosti, což vedlo k dramatickému snížení přežití vrhu.[23] To může souviset se spojením mezi HP1BP3 a poporodní depresí u lidí.[24] Nakonec byl HP1BP3 zapojen do Alzheimerovy choroby.[1].[25]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000127483 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028759 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Entrez Gene: heterochromatinový protein 1, vazebný protein 3“. Citováno 2011-08-30.
- ^ Garfinkel BP, Melamed-Book N, Anuka E, Bustin M, Orly J (únor 2015). „HP1BP3 je nový protein související s histonem H1, který má zásadní roli v životaschopnosti a růstu“. Výzkum nukleových kyselin. 43 (4): 2074–90. doi:10.1093 / nar / gkv089. PMC 4344522. PMID 25662603.
- ^ Dutta B, Ren Y, Hao P, Sim KH, Cheow E, Adav S, Tam JP, Sze SK (září 2014). „Profilování proteinu spojeného s chromatiny identifikuje HP1BP3 jako nový regulátor progrese buněčného cyklu“. Molekulární a buněčná proteomika. 13 (9): 2183–97. doi:10,1074 / mcp.M113.034975. PMC 4159643. PMID 24830416.
- ^ Hayashihara K, Uchiyama S, Shimamoto S, Kobayashi S, Tomschik M, Wakamatsu H, No D, Sugahara H, Hori N, Noda M, Ohkubo T, Zlatanova J, Matsunaga S, Fukui K (únor 2010). „Střední oblast proteinu vázajícího HP1, HP1-BP74, se asociuje s linkerovou DNA v místě vstupu / výstupu nukleosomální DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 285 (9): 6498–507. doi:10,1074 / jbc.M109.092833. PMC 2825445. PMID 20042602.
- ^ „Data tělesné hmotnosti pro Hp1bp3“. Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ „Data DEXA pro Hp1bp3“. Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ "Data klinické chemie pro Hp1bp3". Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ „Údaje o hmotnosti srdce pro Hp1bp3“. Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ "Citrobacter data infekce pro Hp1bp3 ". Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ A b C Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: Vysoce výkonná charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88 (S248). doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
- ^ Portál myších zdrojů Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ „International Knockout Mouse Consortium“.
- ^ "Myší genomová informatika".
- ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
- ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
- ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). „Sada nástrojů pro genetiku myší: odhalení funkce a mechanismu“. Genome Biology. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
- ^ Garfinkel BP, Arad S, Le PT, Bustin M, Rosen CJ, Gabet Y, Orly J (prosinec 2015). „Proporcionální nanismus u myší postrádající heterochromatinový protein 1 vázající protein 3 (HP1BP3) je spojen se změnami v endokrinní cestě IGF-1“. Endokrinologie. 156 (12): 4558–70. doi:10.1210 / cs.2015-1668. PMC 5393342. PMID 26402843.
- ^ Garfinkel BP, Arad S, Neuner S, Netser S, Wagner S, Kaczorowski CC, Rosen CJ, Gal M, Soreq H, Orly J (červenec 2016). „Exprese HP1BP3 určuje chování matky a přežití potomstva“. Geny, mozek a chování. 15: 678–88. doi:10.1111 / gbb.12312. PMID 27470444.
- ^ Guintivano J, Arad M, Gould TD, Payne JL, Kaminsky ZA (květen 2014). „Předporodní předpověď poporodní deprese s biomarkery methylace krevní DNA“. Molekulární psychiatrie. 19 (5): 560–7. doi:10,1038 / mp.2013,62. PMID 23689534.
- ^ Neuner SM, Garfinkel BP, Wilmott LA, Ignatowska-Jankowska BM, Citri A, Orly J, Lu L, overall RW, Mulligan MK, Kempermann G, Williams RW, O'Connell KM, Kaczorowski CC (červen 2016). „Systémová genetika identifikuje Hp1bp3 jako nový modulátor kognitivního stárnutí“. Neurobiologie stárnutí. 46: 58–67. doi:10.1016 / j.neurobiolaging.2016.06.008. PMC 5018442. PMID 27460150.
Další čtení
- Rose JE, Behm FM, Drgon T, Johnson C, Uhl GR. „Personalizované odvykání kouření: interakce mezi dávkou nikotinu, závislostí a skóre genotypu při ukončení léčby“. Molekulární medicína. 16 (7–8): 247–53. doi:10.2119 / molmed.2009.00159. PMC 2896464. PMID 20379614.
- Ouyang J, Shi Y, Valin A, Xuan Y, Gill G (duben 2009). „Přímá vazba CoREST1 na SUMO-2/3 přispívá ke genově specifické represi komplexem LSD1 / CoREST1 / HDAC“. Molekulární buňka. 34 (2): 145–54. doi:10.1016 / j.molcel.2009.03.013. PMC 2727917. PMID 19394292.
- Martins-de-Souza D, Gattaz WF, Schmitt A, Rewerts C, Maccarrone G, Dias-Neto E, Turck CW (duben 2009). „Analýza proteomu brokovnice prefrontální kůry odhaluje změněnou homeostázu vápníku a nerovnováhu imunitního systému u schizofrenie.“ Evropský archiv psychiatrie a klinické neurovědy. 259 (3): 151–63. doi:10.1007 / s00406-008-0847-2. PMID 19165527.
- Flachsbart F, Franke A, Kleindorp R, Caliebe A, Blanché H, Schreiber S, Nebel A (prosinec 2010). "Vyšetřování faktorů genetické náchylnosti k lidské dlouhověkosti - cílená nonsynonymní studie SNP". Mutační výzkum. 694 (1–2): 13–9. doi:10.1016 / j.mrfmmm.2010.08.006. PMID 20800603.
- Hayashihara K, Uchiyama S, Shimamoto S, Kobayashi S, Tomschik M, Wakamatsu H, No D, Sugahara H, Hori N, Noda M, Ohkubo T, Zlatanova J, Matsunaga S, Fukui K (únor 2010). „Střední oblast proteinu vázajícího se na HP1, HP1-BP74, se asociuje s linkerovou DNA v místě vstupu / výstupu nukleosomální DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 285 (9): 6498–507. doi:10.1074 / jbc.M109.092833. PMC 2825445. PMID 20042602.
- Gautier VW, Gu L, O'Donoghue N, Pennington S, Sheehy N, Hall WW (2009). „In vitro nukleární interatom z proteinu HIV-1 Tat“. Retrovirologie. 6: 47. doi:10.1186/1742-4690-6-47. PMC 2702331. PMID 19454010.