HOXA6 - HOXA6

HOXA6
Identifikátory
Aliasy	HOXA6, HOX1, HOX1.2, HOX1B, homeobox A6
Externí ID	OMIM: 142951 MGI: 96178 HomoloGene: 7765 Genové karty: HOXA6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	27,150,603 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• morfogeneze embryonálního kostního systému; • vývoj mnohobuněčných organismů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • specifikace předního / zadního vzoru; • vývoj embryonálního kostního systému; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3203
	15403
	ENSG00000106006
	ENSMUSG00000043219
	P31267
	P09092
	NM_024014
	NM_010454
	NP_076919
	NP_034584
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homeoboxový protein Hox-A6 je protein že u lidí je kódován HOXA6 gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

U obratlovců geny kódující třídu transkripční faktory volala geny homeoboxu se nacházejí v klastrech A, B, C a D na čtyřech samostatných chromozomech. Exprese těchto proteinů je během embryonálního vývoje regulována prostorově a časově. Tento gen je součástí klastru A na chromozomu 7 a kóduje transkripční faktor vázající DNA, který může regulovat genovou expresi, morfogeneze a diferenciace.^[6]

Klinický význam

Leukémie

Bylo zkoumáno, že HOXA6 je přednostně exprimován v primitivních buňkách (např. hematopoetické progenitorové buňky ), pod regulací růstových faktorů a buněčných cyklů. Interleukin 3 a all-trans retinová kyselina Bylo zjištěno, že jsou indukčními faktory, které mohou stimulovat expresi HOXA6. V mitotickém procesu byl HOXA6 vyjádřen hlavně v S-fáze a buňky fáze G2M. Nadměrná exprese HoxA6 zvýšila proliferaci, ale inhibovala diferenciaci multipotenciálních kmenových buněk v procesu hemopoéza,^[7] dokonce měl schopnost transformovat primární hematopoetické buňky na nesmrtelné buněčné linie. Transplantace těchto buněčných linií může u akutních zvířat způsobit akutní myeloidní leukémii.^[8] Rovněž u pacientů s akutní myeloidní leukemií byla exprese HOXA6 zvýšena. Ko-methylace genů HOX, včetně HOXA6, vede k dysfunkci genů potlačujících nádory snížením genové exprese. Methylační procesy lze identifikovat u dospělých chronická lymfocytární leukémie a dětství akutní lymfocytární leukémie.^[9]

Glioblastom

HOXA6 může také přispívat k invazivní tendenci glioblastoma multiforme buňky. Potlačená exprese HOXA6 zavedením jeho antisense fragmentů může snížit invazi multiformních buněk glioblastomu.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106006 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ McAlpine PJ, Ukazuje TB (červenec 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID 1973146.
^ Scott MP (listopad 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HOXA6 homeobox A6“.
^ Dickson GJ, Kwasniewska A, Mills KI, Lappin TR, Thompson A (březen 2009). „Hoxa6 potencuje krátkodobou proliferaci hemopoetických buněk a prodlouženou samoobnovu“. Experimentální hematologie. 37 (3): 322–33.e3. doi:10.1016 / j.exphem.2008.10.015. PMID 19157684.
^ Bach C, Buhl S, Mueller D, poslanec García-Cuéllar, Maethner E, Slany RK (duben 2010). "Leukemogenní transformace HOXA klastrovými geny". Krev. 115 (14): 2910–8. doi:10.1182 / krev-2009-04-216606. PMID 20130239.
^ Kishida Y, Natsume A, Kondo Y, Takeuchi I, An B, Okamoto Y, Shinjo K, Saito K, Ando H, Ohka F, Sekido Y, Wakabayashi T (únor 2012). „Epigenetická subklasifikace meningiomů na základě metylačních analýz DNA v celém genomu“. Karcinogeneze. 33 (2): 436–41. doi:10.1093 / carcin / bgr260. PMID 22102699.
^ Guo YB, Shao YM, Chen J, Xu SB, Zhang XD, Wang MR, Liu HY (leden 2016). „Vliv nadměrné exprese genů HOX na jeho invazivní tendenci v cerebrálním gliomu“. Onkologické dopisy. 11 (1): 75–80. doi:10.3892 / ol.2015.3893. PMC 4727036. PMID 26870170.

Další čtení

Boncinelli E, Acampora D, Pannese M, D'Esposito M, Somma R, Gaudino G, Stornaiuolo A, Cafiero M, Faiella A, Simeone A (1990). "Organizace homeoboxních genů lidské třídy I". Genom. 31 (2): 745–56. doi:10,1139 / g89-133. PMID 2576652.
Apiou F, Flagiello D, Cillo C, Malfoy B, Poupon MF, Dutrillaux B (1996). "Jemné mapování lidských genových shluků HOX". Cytogenetika a genetika buněk. 73 (1–2): 114–5. doi:10.1159/000134320. PMID 8646877.
Walters JR, Howard A, Rumble HE, Prathalingam SR, Shaw-Smith CJ, Legon S (srpen 1997). "Rozdíly v expresi homeoboxových transkripčních faktorů v proximálním a distálním lidském tenkém střevě". Gastroenterologie. 113 (2): 472–7. doi:10.1053 / gast.1997.v113.pm 9247466. PMID 9247466.
Kosaki K, Kosaki R, Suzuki T, Yoshihashi H, Takahashi T, Sasaki K, Tomita M, McGinnis W, Matsuo N (únor 2002). "Kompletní panel pro analýzu mutací 39 lidských genů HOX". Teratologie. 65 (2): 50–62. doi:10.1002 / tera.10009. PMID 11857506.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106006 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1973146-4] McAlpine PJ, Ukazuje TB (červenec 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID 1973146.

[pmid1358459-5] Scott MP (listopad 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HOXA6 homeobox A6“.

[7] Dickson GJ, Kwasniewska A, Mills KI, Lappin TR, Thompson A (březen 2009). „Hoxa6 potencuje krátkodobou proliferaci hemopoetických buněk a prodlouženou samoobnovu“. Experimentální hematologie. 37 (3): 322–33.e3. doi:10.1016 / j.exphem.2008.10.015. PMID 19157684.

[8] Bach C, Buhl S, Mueller D, poslanec García-Cuéllar, Maethner E, Slany RK (duben 2010). "Leukemogenní transformace HOXA klastrovými geny". Krev. 115 (14): 2910–8. doi:10.1182 / krev-2009-04-216606. PMID 20130239.

[9] Kishida Y, Natsume A, Kondo Y, Takeuchi I, An B, Okamoto Y, Shinjo K, Saito K, Ando H, Ohka F, Sekido Y, Wakabayashi T (únor 2012). „Epigenetická subklasifikace meningiomů na základě metylačních analýz DNA v celém genomu“. Karcinogeneze. 33 (2): 436–41. doi:10.1093 / carcin / bgr260. PMID 22102699.

[10] Guo YB, Shao YM, Chen J, Xu SB, Zhang XD, Wang MR, Liu HY (leden 2016). „Vliv nadměrné exprese genů HOX na jeho invazivní tendenci v cerebrálním gliomu“. Onkologické dopisy. 11 (1): 75–80. doi:10.3892 / ol.2015.3893. PMC 4727036. PMID 26870170.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]