HNRPH2 - HNRPH2

HNRNPH2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 WEZ, 1WG5
Identifikátory
Aliasy	HNRNPH2, FTP3, HNRPH ', HNRPH2, hnRNPH', heterogenní jaderný ribonukleoprotein H2 (H '), heterogenní jaderný ribonukleoprotein H2, MRXSB, NRPH2
Externí ID	OMIM: 300610 MGI: 1201779 HomoloGene: 23165 Genové karty: HNRNPH2
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	101,414,133 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	134,607,060 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• membrána; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • RNA metabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3188
	56258
	ENSG00000126945
	ENSMUSG00000045427
	P55795
	P70333
	NM_019597; NM_001032393
	NM_019868; NM_001313716; NM_001313717
	NP_001027565; NP_062543
	NP_001300645; NP_001300646; NP_063921
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Heterogenní jaderný ribonukleoprotein H2 je protein že u lidí je kódován HNRNPH2 gen.^[5]^[6]

Tento gen patří do podčeledi všudypřítomně exprimovaných heterogenních jaderných ribonukleoproteinů (hnRNP). HnRNP jsou proteiny vázající RNA a komplexují se s heterogenní jadernou RNA (hnRNA). Tyto proteiny jsou spojeny s pre-mRNA v jádru a zdá se, že ovlivňují zpracování pre-mRNA a další aspekty metabolismu a transportu mRNA. Zatímco všechny hnRNP jsou přítomny v jádru, zdá se, že některé přecházejí mezi jádrem a cytoplazmou. Proteiny hnRNP mají odlišné vlastnosti vázání nukleových kyselin. Protein kódovaný tímto genem má tři opakování kvazi-RRM domén, které se váží na RNA. Je to velmi podobné členu rodiny HNRPH1. Předpokládá se, že je do tohoto genu zapojen Fabryho choroba a X-vázaný fenotyp agamaglobulinemie. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících stejný protein.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126945 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045427 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Honore B, Rasmussen HH, Vorum H, Dejgaard K, Liu X, Gromov P, Madsen P, Gesser B, Tommerup N, Celis JE (leden 1996). „Heterogenní nukleární ribonukleoproteiny H, H 'a F jsou členy všudypřítomně exprimované podrodiny příbuzných, ale odlišných proteinů kódovaných geny mapujícími různé chromozomy“. J Biol Chem. 270 (48): 28780–9. doi:10.1074 / jbc.270.48.28780. PMID 7499401.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HNRPH2 heterogenní jaderný ribonukleoprotein H2 (H ')“.

Další čtení

Vorechovský I, Vetrie D, Holland J a kol. (1994). "Izolace kosmidových a cDNA klonů v oblasti obklopující gen BTK v Xq21.3-q22". Genomika. 21 (3): 517–24. doi:10.1006 / geno.1994.1310. PMID 7959728.
Vetrie D, Vorechovský I, Sideras P a kol. (1993). „Gen zapojený do agamaglobulinémie vázané na X je členem rodiny protein-tyrosin kináz src.“ Příroda. 361 (6409): 226–33. doi:10.1038 / 361226a0. PMID 8380905.
Tsukada S, Saffran DC, Rawlings DJ a kol. (1993). "Deficitní exprese cytoplazmatické tyrosinkinázy B buněk v lidské X-vázané agamaglobulinemii". Buňka. 72 (2): 279–90. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90667-F. PMID 8425221.
Oeltjen JC, Malley TM, Muzny DM a kol. (1997). „Rozsáhlá srovnávací sekvenční analýza lidských a myších Brutonových tyrosinkinázových lokusů odhaluje konzervativní regulační domény“. Genome Res. 7 (4): 315–29. doi:10,1101 / gr. 7.4.315. PMID 9110171.
Honoré B, Vorum H, Baandrup U (1999). "hnRNPs H, H 'a F se chovají odlišně s ohledem na posttranslační štěpení a subcelulární lokalizaci". FEBS Lett. 456 (2): 274–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00911-4. PMID 10456323.
Zhang Y, Lindblom T, Chang A a kol. (2001). „Důkaz, že dim1 se asociuje s proteiny zapojenými do sestřihu pre-mRNA a vymezení zbytků nezbytných pro interakce dim1 s hnRNP F a Npw38 / PQBP-1“. Gen. 257 (1): 33–43. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00372-3. PMID 11054566.
Caputi M, Zahler AM (2001). „Stanovení RNA vazebné specificity heterogenní nukleární ribonukleoproteinové (hnRNP) rodiny H / H '/ F / 2H9“. J. Biol. Chem. 276 (47): 43850–9. doi:10,1074 / jbc.M102861200. PMID 11571276.
Shu H, Chen S, Bi Q a kol. (2004). „Identifikace fosfoproteinů a jejich fosforylačních míst v buněčné linii lymfomu WEHI-231 B“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (3): 279–86. doi:10,1074 / mcp. D300003-MCP200. PMID 14729942.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H a kol. (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216.
Honoré B, Baandrup U, Vorum H (2004). "Heterogenní nukleární ribonukleoproteiny F a H / H 'vykazují rozdílnou expresi v normálních a vybraných rakovinných tkáních". Exp. Cell Res. 294 (1): 199–209. doi:10.1016 / j.yexcr.2003.11.011. PMID 14980514.
Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ a kol. (2005). „Sekvence DNA lidského chromozomu X“. Příroda. 434 (7031): 325–37. doi:10.1038 / nature03440. PMC 2665286. PMID 15772651.
Alkan SA, Martincic K, Milcarek C (2006). „HnRNP F a H2 se vážou na podobné sekvence, aby ovlivnily genovou expresi“. Biochem. J. 393 (Pt 1): 361–71. doi:10.1042 / BJ20050538. PMC 1383695. PMID 16171461.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126945 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045427 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7499401-5] Honore B, Rasmussen HH, Vorum H, Dejgaard K, Liu X, Gromov P, Madsen P, Gesser B, Tommerup N, Celis JE (leden 1996). „Heterogenní nukleární ribonukleoproteiny H, H 'a F jsou členy všudypřítomně exprimované podrodiny příbuzných, ale odlišných proteinů kódovaných geny mapujícími různé chromozomy“. J Biol Chem. 270 (48): 28780–9. doi:10.1074 / jbc.270.48.28780. PMID 7499401.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HNRPH2 heterogenní jaderný ribonukleoprotein H2 (H ')“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]