Virus hepatitidy sysel - Ground squirrel hepatitis virus
| Virus hepatitidy sysel | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Riboviria |
| Království: | Pararnavirae |
| Kmen: | Artverviricota |
| Třída: | Revtraviricetes |
| Objednat: | Blubervirales |
| Rodina: | Hepadnaviridae |
| Rod: | Orthohepadnavirus |
| Druh: | Virus hepatitidy sysel |
Virus hepatitidy sysel, zkráceně GSHV, je částečně dvouvláknová DNA virus to úzce souvisí s člověkem Virus hepatitidy B. (HBV) a Virus hepatitidy Woodchuck (WHV).[1] Je členem rodiny virů Hepadnaviridae a rod Orthohepadnavirus.[2] Stejně jako ostatní členové jeho rodiny má GSHV vysoký stupeň druhové a tkáňové specificity.[3] Bylo objeveno v Beechey sysel, Spermophilus beecheyi, ale také infikuje Polární veverky, Spermophilus parryi.[1][2] Komonality mezi GSHV a HBV zahrnují morfologii, aktivitu DNA polymerázy při opravě genomu, křížově reagující virové antigeny a výslednou přetrvávající infekci virovým antigenem v krvi (antigenemie).[4] Ve výsledku se GSHV používá jako experimentální model pro HBV.[5]
Morfologie
Genom
Virus hepatitidy veverka se skládá z genomu DNA, který je primárně dvouvláknový. Stejně jako ostatní hepadnaviry se skládá z jednořetězcové oblasti proměnlivé délky, která je konvertována na dvouřetězcovou DNA virionem DNA polymeráza.[4][6] Protein je kovalentně navázán na 5 'konec minus řetězce, který může být použit jako primer pro syntézu DNA.[7]
Existují čtyři evidentní otevřené čtecí rámce v genomu, všechny na stejném řetězci. Dva jsou pro geny kódující strukturní proteiny (povrchové antigeny a základní antigeny) a další dva nejsou přiřazeny. Větší z nepřiřazených rámců, který se nazývá gen A a pokrývá 80% genomu, předpokládá se, že kóduje virovou DNA polymerázu. Kratší, gen B, neodpovídá známému virovému proteinu.
V hostitelské buňce může genom GSHV existovat ve dvou formách: kruhový duplex a heterogenní částečně jednovláknová DNA.[6] Kruhová DNA může být buď kovalentně uzavřená nebo otevřená.[7]
Genom GSHV je velmi podobný příbuzným hepadnavirům. Hepatitida sysel má délku 3311 párů bází, takže velikost je k nerozeznání od HBV. GSHV má větší homologii nukleotidů a aminokyselin s WHV než HBV, s 82% nukleotidovou a 78% aminokyselinovou homologií mezi GSHV a WHV a 55% nukleotidů a 46% aminokyselinovou homologii mezi GSHV a HBV.[6][8] Otevřené čtecí rámce GSHV jsou podobné HBV a WHV, ale viry se liší EcoRI místa pro rozpoznávání restrikčních enzymů.[4]
Struktura
Virus hepatitidy sysel je sférický, obalený virus. Jádro částice, nebo nukleokapsid, Obsahuje e antigen, virovou DNA a endogenní DNA polymerázu.[9] Virové částice obsahují dva hlavní strukturní proteiny, povrchové antigeny (sAg) a základní antigeny (cAg). Oba proteiny byly identifikovány na základě homologie s analogickými proteiny v jiných hepadnavirech. Zralá veverka hepatitida sAg (GSHsAg) měla 90% aminokyselinovou homologii s svízel hepatitida sAg a předpokládá se, že je glykosylován. Hepatitida cAg (GSHcAg) je nejvíce konzervovanou proteinovou sekvencí mezi GSHV, WHV a HBV.[6]
Cyklus replikace
Virová vstup
Předpokládá se, že hepadnaviry vstupují do hostitelských buněk zprostředkovaných receptory endocytóza.[2]
Replikace a přepis
Intracelulární predominace dlouhého minus řetězce DNA nad krátkým plus řetězcem naznačuje, že replikace DNA vychází z templátu RNA, stejně jako jiné hepadnaviry.[6] Předpokládá se, že syntéza minus řetězce využívá meziprodukt RNA, který je degradován při jeho kopírování, a plus vlákno je syntetizováno pomocí úplné DNA minus řetězce. Virová DNA polymeráza syntetizuje řetězce DNA plus i minus. Produkce meziproduktu RNA, nazývaného pregenom, během replikace zahrnuje a reverzní transkripce krok připomínající krok retrovirů. Hepadnaviry se od retrovirů liší tím, že přechodnou formou genomu je RNA místo DNA. Integrace do hostitelského genomu také není nutná pro replikaci v hepadnavirech.[2] Tento proces byl poprvé představen v Virus kachní hepatitidy B., související virus v Hepadnaviridae rodina, ve které řetězce minus DNA také převyšují řetězce plus. Tato podobnost naznačuje, že mechanismus replikace je podobný v GSHV.[10]
Po vstupu je parciální DNA duplexní genom opraven virovou DNA polymerázou a cirkularizován, aby sloužil jako templát pro transkripci. Čtyři přepisy jsou vytvořeny v jádře a jsou obvykle transportovány do cytoplazmy.[2]
Shromáždění
Předpokládá se, že virová DNA je zabalena před dokončením syntézy plus řetězce. To by vysvětlovalo přebytek mínus řetězce DNA ve srovnání s DNA plus řetězce.[7]
Infekce a nemoci
Virus hepatitidy veverka se odlišuje od příbuzných virů tím, že nemá patogenní účinek, i když je u infikovaných hostitelů běžné, že mají vysoké titry cirkulujících virionů.[3][6] Virové částice detekované v séru divokých veverek beechey jsou molekulárně a strukturně podobné, ale ne identické s HBV. Obecně jsou částice GSHV v séru větší než částice HBV. Částice vláknitého viru byla nejhojnější formou v séru sysele podobně jako lidská séra infikovaná HBV. Další nejhojnější částice v séru byla sférická s vnějším pláštěm nebo obalem, připomínající částice Dane nalezené v lidech.[4]
Tropismus
Virus hepatitidy veverka infikuje jaterní buňky a je považován za vysoce hepatotropní.[1][6] Infekce GSHV může způsobit přetrvávající infekci.[8] Virus způsobuje chronickou infekci a delší antigenemii (antigen v krvi), když je injikován přímo do jater ve srovnání s injekcí do portální žíly. GSHsAg (virový povrchový antigen) může být detekován v séru několik týdnů po infekci.[5]
Přidružená nemoc
Nemoc nebo smrt u zvířat nesoucích GSHV v důsledku onemocnění jater nebyla prokázána. U mnoha infikovaných veverek s vysokou hladinou GSHsAg a virionové DNA polymerázy nejsou žádné známky cirhóza nebo hepatocelulární karcinom.[1] Je možné, že veverky trvale infikované GSHV vykazují známky mírné, neprogresivní hepatitida.[2] Žádná modulace hostitelských procesů v důsledku infekce GSHV není známa.
Přetrvávající infekce HBV a WHV často vede k hepatocelulárnímu karcinomu (HCC). Stejná asociace nebyla pozorována u GSHV, ale je možné, že přetrvávající infekce po dobu delší, než je požadováno u ostatních dvou virů, může přispět k rozvoji HCC.[8] Přetrvávající infekce GSHV po dobu až tří let vede pouze k mírnému zánětu, takže vývoj HCC by ve většině případů pravděpodobně trval déle.[6]
Přenos
Virus hepatitidy veverky může být přenášen horizontálně i vertikálně.
Horizontální přenos může být výsledkem očkování viremickým sérem. Koncentrace séra nezbytná k přenosu infekce je však mnohem vyšší, než by se dalo předpovědět za předpokladu, že k zahájení infekce je dostatečná jedna virová částice. Jedním z možných vysvětlení může být to, že ne každá částice detekovaná fyzikálními metodami je biologicky aktivní a dalším vysvětlením je, že k zahájení infekce je zapotřebí více virionů.[3]
Vertikální přenos GSHV z matky na novorozence je také možný, ale nebyl podrobně studován.[1]
Rozdělení
Geografickou distribuci lze měřit testováním sér pozemních veverek na virový povrchový antigen, virion DNA polymerázu a virové protilátky na různých místech. Předpokládá se, že distribuce GSHV je velmi lokalizovaná.[1] Bylo zjištěno v okruhu menším než osm mil v severní Kalifornii, ale je pravděpodobné, že existuje na nezjištěných místech. Další důkazy naznačují, že geografické rozložení je nerovnoměrné, což je případ HBV. Neexistují žádné náznaky faktorů, které by mohly ovlivnit geografickou distribuci GSHV.[4]
Nebyly pozorovány žádné rozdíly v distribuci pohlaví GSHV.[1] To je na rozdíl od HBV, kde přetrvávající infekce HBV u mužů převažují nad infekcemi u žen.[4]
Reference
- ^ A b C d E F G Marion, Patricia L .; Knight, Susan S .; Salazar, Felix H .; Popper, Hans; Robinson, William S. (01.01.1983). "Infekce virem hepatitidy Hepatitis". Hepatologie. 3 (4): 519–527. doi:10.1002 / hep.1840030408. ISSN 1527-3350. PMID 6862363.
- ^ A b C d E F "Virus hepatitidy veverky - přehled | Témata ScienceDirect". www.sciencedirect.com. Citováno 2019-11-24.
- ^ A b C Trueba, Daniel; Phelan, Michael; Nelson, John; Beck, Fred; Pecha, Brian S .; Brown, R. James; Varmus, Harold E .; Ganem, Don (01.05.1985). „Přenos viru hepatitidy veverky na homologní a heterologní hostitele“. Hepatologie. 5 (3): 435–439. doi:10.1002 / hep.1840050316. ISSN 1527-3350. PMID 3997073.
- ^ A b C d E F Marion, PL; Oshiro, LS; Regnery, D C; Scullard, GH; Robinson, W S (květen 1980). „Virus v syselech Beechey, který souvisí s lidským virem hepatitidy B“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 77 (5): 2941–2945. doi:10.1073 / pnas.77.5.2941. ISSN 0027-8424. PMC 349522. PMID 6930677.
- ^ A b Seeger, C .; Ganem, D .; Varmus, H. E. (září 1984). „Klonovaný genom viru hepatitidy veverky je u zvířete nakažlivý“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 81 (18): 5849–5852. doi:10.1073 / pnas.81.18.5849. ISSN 0027-8424. PMC 391809. PMID 6091114.
- ^ A b C d E F G h Seeger, C .; Ganem, D .; Varmus, H. E. (srpen 1984). „Nukleotidová sekvence infekčního molekulárně klonovaného genomu viru hepatitidy sysel“. Journal of Virology. 51 (2): 367–375. doi:10.1128 / JVI.51.2.367-375.1984. ISSN 0022-538X. PMC 254447. PMID 6086950.
- ^ A b C Weiser, B; Ganem, D; Seeger, C; Varmus, HE (říjen 1983). "Uzavřená kruhová virová DNA a asymetrické heterogenní formy v játrech od zvířat infikovaných virem hepatitidy sysel". Journal of Virology. 48 (1): 1–9. doi:10.1128 / JVI.48.1.1-9.1983. ISSN 0022-538X. PMC 255316. PMID 6887347.
- ^ A b C Marion, P.L .; Van Davelaar, M. J .; Knight, S. S .; Salazar, F. H .; Garcia, G .; Popper, H .; Robinson, W. S. (červen 1986). „Hepatocelulární karcinom u syslů trvale infikovaných virem hepatitidy sysel“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 83 (12): 4543–4546. doi:10.1073 / pnas.83.12.4543. ISSN 0027-8424. PMC 323770. PMID 3012572.
- ^ Feitelson, MA; Marion, PL; Robinson, W S (srpen 1982). „Základní částice viru hepatitidy B a viru hepatitidy veverka obecná. II. Charakterizace reakce proteinkinázy spojené s virem hepatitidy B a veverkou hepatitidou B“. Journal of Virology. 43 (2): 741–748. doi:10.1128 / JVI.43.2.741-748.1982. ISSN 0022-538X. PMC 256178. PMID 7109041.
- ^ Summers, J .; Mason, W. S. (červen 1982). "Replikace genomu viru podobného hepatitidě B reverzní transkripcí meziproduktu RNA". Buňka. 29 (2): 403–415. doi:10.1016 / 0092-8674 (82) 90157-x. ISSN 0092-8674. PMID 6180831.