GoLoco motiv - GoLoco motif - Wikipedia
GoLoco motiv | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() krystalová struktura lidského gal se váže na goloco motiv rgs14 | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | GoLoco | ||||||||
Pfam | PF02188 | ||||||||
InterPro | IPR003109 | ||||||||
CHYTRÝ | GoLoco | ||||||||
SCOP2 | 1 kjy / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
|
GoLoco motiv je protein strukturální motiv.[1][2][3]
v heterotrimerní G-protein signalizace, receptory buněčného povrchu (GPCR ) jsou spojeny s membránovými heterotrimery obsahujícími GTP-hydrolyzující podjednotku G-alfa a a G-beta / G-gama dimer. Neaktivní forma obsahuje alfa podjednotku vázanou na GDP a komplexy s beta a gama podjednotkou. Když je ligand asociován s receptorem, GDP je vytěsněn z G-alfa a GTP je vázán. Komplex GTP / G-alfa se oddělí od trimeru a přidruží se k efektoru, dokud vnitřní aktivita GTPasy G-alfa nevrátí protein do formy vázané na GDP. Opětná asociace G-alfa vázaného na GDP s dimerem G-beta / G-gama ukončí signál. Několik mechanismů reguluje výstup signálu v různých fázích kaskády G-proteinů. Jako inhibitory aktivace G proteinu působí dvě třídy intracelulárních proteinů: proteiny aktivující GTPázu (GAP), které zvyšují hydrolýzu GTP (viz PDOC50132 ) a inhibitory disociace guaninu (GDI), které inhibují disociaci GDP. Motiv GoLoco nebo regulační G-protein (GPR) nalezený v různých regulátorech G-proteinu.[1][4] působí jako GDI na G-alfa (i).[2][5]
Struktura
Krystalová struktura motivu GoLoco v komplexu s G-alfa (i) byla vyřešena.[6] Skládá se ze tří malých alfa šroubovic. Vysoce konzervovaná triáda Asp-Gln-Arg v motivu GoLoco se přímo účastní vazby GDP prodloužením argininového postranního řetězce do kapsy vázající nukleotidy, což vysoce připomíná katalytický argininový prst používané v proteinu aktivujícím GTPázu (viz PDOC50238 ). Toto přidání argininu do vazebné kapsy ovlivňuje interakci GDP s G-alfa, a proto je určitě důležité pro aktivitu GoLoco GDI.[6]
Příklady
Některé proteiny, o nichž je známo, že obsahují motiv GoLoco, jsou uvedeny níže:
- Savčí regulátory G-proteinů signalizujících 12 a 14 (RGS12 a RGS14), mnohostranné regulátory signální transdukce.
- Loco, homolog drosophila RGS12.
- Savčí protein Purkyňových buněk-2 (Pcp2). Může fungovat jako modulátor specifický pro buněčný typ pro buněčnou signalizaci zprostředkovanou G proteinem. Je jedinečně exprimován v cerebelárních Purkyňových buňkách a v bipolárních neuronech sítnice.
- Eukaryotický Rap1GAP. Aktivátor GTPázy pro regulační protein RAP-1A související s jaderným ras.
- Drosophila protein Rapsynoid (také známý jako Partner of Inscuteable, Pins) a jeho savčí homology, AGS3 a LGN. Tvoří rodinu regulátorů G-proteinu, která také obsahuje TPR opakování.
Lidské proteiny obsahující tuto doménu zahrnují:
Reference
- ^ A b Siderovski DP, Diversé-Pierluissi M, De Vries L (září 1999). "Motiv GoLoco: vazebný motiv Galphai / o a potenciální faktor výměny guanin-nukleotid". Trends Biochem. Sci. 24 (9): 340–1. doi:10.1016 / s0968-0004 (99) 01441-3. PMID 10470031.
- ^ A b De Vries L, Fischer T, Tronchère H, Brothers GM, Strockbine B, Siderovski DP, Farquhar MG (prosinec 2000). „Aktivátor signalizace G proteinu 3 je inhibitorem disociace guaninu pro podjednotky Galpha i“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (26): 14364–9. doi:10.1073 / pnas.97.26.14364. PMC 18924. PMID 11121039.
- ^ Kimple RJ, Kimple ME, Betts L, Sondek J, Siderovski DP (duben 2002). "Strukturální determinanty pro GoLoco indukovanou inhibici uvolňování nukleotidů podjednotkami Galpha". Příroda. 416 (6883): 878–81. doi:10.1038 / 416878a. PMID 11976690.
- ^ Ponting CP (1999). „Domény vázající Ras / Rap podobné Raf v signálních proteinech RGS12 a zátiší“ (PDF). J. Mol. Med. 77 (10): 695–698. doi:10,1007 / s001099900054. PMID 10606204.
- ^ Artemyev NO, Natochin M, Lester B, Peterson YK, Bernard ML, Lanier SM (2000). „AGS3 inhibuje disociaci GDP z galpha podjednotek rodiny Gi a aktivaci transducinu závislou na rhodopsinu“. J. Biol. Chem. 275 (52): 40981–40985. doi:10,1074 / jbc.M006478200. PMID 11024022.
- ^ A b Siderovski DP, Kimple RJ, Kimple ME, Betts L, Sondek J (2002). "Strukturální determinanty pro GoLoco indukovanou inhibici uvolňování nukleotidů podjednotkami Galpha". Příroda. 416 (6883): 878–881. doi:10.1038 / 416878a. PMID 11976690.
![]() | Tento membránový protein –Vztahující se článek je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |