Německé informační centrum pro výzkum genomu - German Resource Center for Genome Research

Německé informační centrum pro výzkum genomu
servisní středisko
Hlavní sídloBerlín-Charlottenburg
Heidelberg
Oblast sloužila
Německo
Londýn
Služby
  • genomové buněčné klony a databáze cDNA
  • buněčné kultury
  • mikročipy
  • profily výrazů
  • služby affymetrix
  • Nabídky PCR

The Německé informační centrum pro výzkum genomu (RZPD, Resourcenzentrum Primärdatenbank) bylo servisní středisko pro gen a genom výzkum v Berlín -Charlottenburg a Heidelberg.

Dějiny

V roce 1987 založili Hans Lehrach a Günther Zehetner Referenční knihovna / primární databáze (RLDB) na Imperial Cancer Research Fund (ICRF) v Londýn.[1] Distribuováno RLDB makročipy generované na ICRF výzkumným skupinám po celém světě. Makra sestávala z klony z genomický a cDNA knihovny převedeny na nylonové filtry 22 × 22 cm pomocí robotů, které vyvinul Zehetner na ICRF. Experimentální výsledky provedené se standardizovanými materiály byly hlášeny zpět výzkumy a shromážděny v Primární databáze.[2]

Špinění
hlava>
(Osa Z)
^ Macroarray
filtr
^ Mikrotitr
talíř
Hlava
sterilizace
koupel v
sušení
mat v
počítač
monitor
Raná verze pozorovacího robota vyvinutého na ICRF pro generování makro pole filtrovat membrány z klonů v mikrotitrační destičky.

Na začátku roku 1995 byla RLDB přesunuta do Berlína do Max Planck Institute for Molecular Genetics, kde pokračovala ve své práci.[3]

V létě roku 1995 bylo v rámci Německa založeno Resource Center Projekt lidského genomu (DHGP) Hans Lehrach (Max Planck Institute for Molecular Genetics (MPIMG), Berlin-Dahlem ), Günther Zehetner (MPIMG, do července 2000 vědecký ředitel berlínského informačního centra) a Annemarie Poustka (Německé centrum pro výzkum rakoviny (DKFZ), Heidelberg). Tak jako Centrum zdrojů / primární databáze (RZPD) převzala práci RLDB. Bylo financováno z Federální ministerstvo školství a výzkumu (BMBF) za účelem bezplatného poskytnutí materiálů členům DHGP, zatímco byly k dispozici dalším výzkumným pracovníkům za cenu nákladů. RZPD se stala největší databáze pro genetické klony po celém světě a byla spojena s mnoha významnými národními a mezinárodními projekty výzkumu genů a genomu.

Zmrazené mikrotitrační destičky s knihovními klony

RZPD byl jedním z pouhých dvou distributorů v Evropě pro OBRAZY cDNA klony a také postavil svůj vlastní plazmid, kosmid, YAC a cDNA knihovny. Každý klon byl uložen v jamce 96 nebo 384 jamky mikrotitrační destička, které byly uchovávány, i když nebyly použity pro špinění, v hlubokých mrazácích při -80 ° C.

Dne 1. Července 2000 byla RZPD přeměněna na Neziskové -Gesellschaft mit beschränkter Haftung (gGmbH). Tento společnost s ručením omezeným byla podpořena třemi nejvýznamnějšími výzkumnými společnostmi v Německu: Společnost Maxe Plancka, Německé centrum pro výzkum rakoviny a Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC Berlin-Buch ). Jako členové vědecké společnosti sloužili Hans Lehrach (MPIMG), Annemarie Poustka (DKFZ), Jens Reich (MDC) Matthias Uhlen (Karolinska Institute, Stockholm ) a Harald zur Hausen (DKFZ).

Dne 31. července 2007 byla nezisková společnost rozpuštěna. Velkou část stávajících služeb převzali dvě nové společnosti. ImaGenes (počáteční společnost bývalými výkonnými řediteli RZPD) a ATLAS Biolabs GmbH, kterou Lehrach spoluzaložil s bývalými vedoucími oddělení RZPD Uwe Radelof und Bernd Drescher.[4]

Služby

Neobarokní budova institutu v Berlíně

Rozsah služeb se neustále rozšiřoval a zahrnoval poskytování genomových buněčných klonů a databází cDNA, buněčné kultury, mikročipy, výraz profily, Affymetrix služby a PCR nabídky. Údaje shromážděné v Primární databáze byly poskytnuty k porovnání experimentálních výsledků pomocí výzkumů využívajících globálně standardizovaný materiál poskytnutý centrem.[5]

Místa

Royal College of Surgeons (uprostřed) a Imperial Cancer Research Fund (vpravo), Londýn

Kancelář RLDB v Londýně byla umístěna v hlavní budově ICRF v Lincoln's Inn Fields, Holborn a později se přestěhoval do větších prostor v sousedním Royal College of Surgeons budova.

V Berlíně byla RZPD nejprve umístěna na Institutu Maxe Plancka pro molekulární genetiku v Berlíně-Dahlem a poté se přesunula do nedalekého místa na silnici Harnack (která je dnes místem Max Planck Institute for the History of Science ) předtím, než se centrum přestěhovalo do svého konečného umístění v bývalé budově Císařovna Auguste Viktoria Dětský domov v Heubnerweg v Berlíně-Charlottenburgu. The Neobarokní budova byla postavena v letech 1907–1909 pod vedením architekt a berlínský komisař pro plánování měst Ludwig Hoffmann projektování bylo výrazně ovlivněno architektem Alfred Messel. Malá Heidelbergova součást centra byla umístěna v DKFZ.

Reference

  1. ^ The Reference Library System - sdílení biologického materiálu a experimentálních dat. Günther Zehetner a Hans Lehrach (3. února 1994). Příroda, sv. 367, str. 489-491
  2. ^ Příprava a screening polí s vysokou hustotou cDNA pomocí genomových klonů (Methods in Molecular Biology, sv. 175 :. Genomics Protocols, edit: MP Starkey a R. Elaswarapu, Humana Press Inc., Totowa, NJ), Günther Zehetner, Maria Pack a Katja Schäfer (2001), str. 169-188
  3. ^ Max-Planck-Institut bude Gen-Bank einrichten, Die Welt, 31. května 1995
  4. ^ RZPD wird ImaGenes - Wirtschaftlicher Erfolg ermöglicht Änderung der Rechtsform GenomXPress 3/07, 2007
  5. ^ Vývoj a perspektivy vědeckých služeb nabízených středisky genomických biologických zdrojů, Oxford Journals, briefing in Functional Genomics and Proteomics 2007, Volume 6, Number 3, pp. 163-170