Geobacter metallireducens - Geobacter metallireducens
| Geobacter metallireducens | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | |
| Druh: | G. metallireducens |
| Binomické jméno | |
| Geobacter metallireducens Lovley a kol. 1995 | |
Geobacter metallireducens je gramnegativní redukující kov proteobakterium.[1] Je to přísný anaerob, který oxiduje několik krátkých řetězců mastné kyseliny, alkoholy, a monoaromatické sloučeniny s Fe (III) jako jediný akceptor elektronů.[2] Může také použít uran pro jeho růst a převést U (VI) na U (IV).[3]
Geobacter metallireducens objevil Derek Lovley v UMass Amherst v roce 1993.[1] Jedná se o bakterii redukující železo a předpokládá se, že mikrob může být použit k ošetření průmyslových areálů, kde se vytvořily „komplexy kyanid-kov“ ke kontaminaci místa.[4] Geobacter metallireducens v případě potřeby se stane pohyblivým a vytvoří bičík, aby se přemístil, když se podmínky prostředí stanou nepříznivými. [4]
Genom Geobacter metallireducens má délka chromozomu 3 997 420 bp. Má to kruhový bakteriální chromozom, což znamená, že neexistují žádné volné konce DNA. Tvar je zhruba podobný vejci.[5] Geobacter metallireducens také má Obsah GC 59,51%.[5] The plazmid má nižší Obsah GC, o 52,48%, a má délku 13 762 bp. Plazmid kóduje stabilizující protein RelE / ParE, který umožňuje Geobacter metallireducens přizpůsobit se a prospívat v různých a nových podmínkách prostředí.[6]
G. metallireducens bylo prokázáno, že snižuje chloramfenikol (CAP) k dokončení produktů dechlorace za podmínek čisté kultury. Výzkum využívající cyklické voltamogramy a chronoamperometrie odhalily, že bakterie vykazovaly negativní korelační účinnost odstranění CAP s počátečními dávkami CAP, což ukazuje potenciální aplikaci organismu na bioremediace v prostředích znečištěných antibiotiky.[7]
Reference
- ^ A b Lovley DR, Giovannoni SJ, White DC, Champine JE, Phillips EJ, Gorby YA, Goodwin S (1993). „Geobacter metallireducens gen. Nov. Sp. Nov., Mikroorganismus schopný spojit úplnou oxidaci organických sloučenin s redukcí železa a jiných kovů“. Archiv mikrobiologie. 159 (4): 336–344. doi:10.1007 / BF00290916. PMID 8387263.
- ^ Tremblay PL, Aklujkar M, Leang C, Nevin KP, Lovley D (únor 2012). „Genetický systém pro Geobacter metallireducens: role bičíku a pilinu při snižování oxidu Fe (III)“. Zprávy o mikrobiologii životního prostředí. 4 (1): 82–88. doi:10.1111 / j.1758-2229.2011.00305.x. PMID 23757233.
- ^ Koribanics NM, Tuorto SJ, Lopez-Chiaffarelli N, McGuinness LR, Häggblom MM, Williams KH, Long PE, Kerkhof LJ (2015). „Prostorová distribuce betaproteobakteria dýchajícího uran na místě terénního výzkumu Rifle, CO“. PLOS ONE. 10 (4): e0123378. Bibcode:2015PLoSO..1023378K. doi:10.1371 / journal.pone.0123378. PMC 4395306. PMID 25874721.
- ^ A b Childers SE, Ciufo S, Lovley DR (duben 2002). "Geobacter metallireducens přistupuje k nerozpustnému oxidu Fe (III) chemotaxí". Příroda. 416 (6882): 767–769. Bibcode:2002 Natur.416..767C. doi:10.1038 / 416767a. PMID 11961561.
- ^ A b Aklujkar M, Krushkal J, DiBartolo G, Lapidus A, Land ML, Lovley DR (květen 2009). „Sekvence genomu Geobacter metallireducens: společné rysy metabolismu, fyziologie a regulace a odlišné od Geobacter sulirreducens“. Mikrobiologie BMC. 9: 109. doi:10.1186/1471-2180-9-109. PMC 2700814. PMID 19473543.
- ^ Anantharaman V, Aravind L (2003). „Nová spojení v prokaryotické síti toxin-antitoxin: vztah s eukaryotickým nesmyslem zprostředkovaným systémem rozpadu RNA“. Genome Biology. 4 (12): R81. doi:10.1186 / gb-2003-4-12-r81. PMC 329420. PMID 14659018.
- ^ Xu, H., Xiao, L., Zheng, S. a kol. "Redukční degradace chloramfenikolů pomocí Geobacter metallireducens". Sci. China Technol. Sci. 62, 1688–1694 (2019). doi:10.1007 / s11431-018-9415-2
Další čtení
- Eickhoff M, Birgel D, Talbot HM, Peckmann J, Kappler A (2013). "Bacteriohopanoid inventarizace Geobacter sulfurreducens a Geobacter metallireducens". Organická geochemie. 58: 107–114. doi:10.1016 / j.orggeochem.2013.02.013. ISSN 0146-6380.
- Schleinitz KM, Schmeling S, Jehmlich N, von Bergen M, Harms H, Kleinsteuber S, Vogt C, Fuchs G (červen 2009). „Odbourávání fenolu v přísně anaerobní bakterii redukující železo Geobacter metallireducens GS-15“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 75 (12): 3912–3919. doi:10.1128 / AEM.01525-08. PMC 2698347. PMID 19376902.
- Zhang T, Tremblay PL, Chaurasia AK, Smith JA, Bain TS, Lovley DR (22. května 2014). "Identifikace genů specificky požadovaných pro anaerobní metabolismus benzenu v Geobacter metallireducens". Hranice v mikrobiologii. 5: 245. doi:10.3389 / fmicb.2014.00245. PMC 4033198. PMID 24904558.
