Genetická příměs - Genetic admixture

Genetická příměs je přítomnost DNA u jedince ze vzdáleně příbuzné populace nebo druhu, v důsledku křížení mezi populacemi nebo druhy, které byly reprodukčně izolovány a geneticky odlišeny.[1][2] Výsledkem příměsi je zavádění nových genetické linie do populace.

Příklady

Klimatické cykly usnadňují genetickou příměs v chladných obdobích a genetickou diverzifikaci v teplých obdobích.[3]Přírodní záplavy může způsobit genetickou příměs v populacích migrujících druhů ryb.[4]Genetická příměs může hrát důležitou roli pro úspěch populací, které kolonizují novou oblast a křížit se s jedinci původních populací.[5]

Mapování

Mapování příměsí je metoda genové mapování který používá a populace smíšeného původu (smíšená populace), aby našli genetiku loci které přispívají k rozdílům v nemocech nebo jiných fenotypy nalezené mezi různými populacemi předků. Metoda se nejlépe aplikuje na populace s nedávnou příměsí ze dvou populací, které byly dříve geneticky izolovány po desítky tisíc let, jako například afro Američané a Evropští Američané (směs afrických a evropských populací). Tato metoda se pokouší korelovat stupeň původu v blízkosti genetického lokusu s požadovaným fenotypem nebo onemocněním. V celém genomu jsou zapotřebí genetické markery, které se liší frekvencí mezi populacemi předků.[6]

Mapování příměsí je založeno na předpokladu, že rozdíly v míře onemocnění nebo fenotypech jsou částečně způsobeny rozdíly ve frekvencích genetických variant způsobujících onemocnění nebo fenotypů mezi populacemi. Ve smíšené populaci se tyto kauzální varianty vyskytují častěji na chromozomálních segmentech zděděných od jedné nebo jiné populace předků. První skenování příměsí bylo publikováno v roce 2005 a od té doby byly zmapovány genetické přispěvatelé k různým rozdílům v chorobách a vlastnostech.[7] Tyto zahrnují hypertenze, roztroušená skleróza, BMI, a rakovina prostaty u afrických Američanů. Do roku 2010 byly zkonstruovány mapovací panely s vysokou hustotou pro Afroameričany, Latino / Hispánce a Ujgurové.

Viz také

Reference

  1. ^ Rius, M. a Darling, J.A. (2014). „Jak důležitá je vnitrodruhová genetická přísada pro úspěch kolonizujících populací?“. Trendy v ekologii a evoluci. 29 (4): 233−242. doi:10.1016 / j.tree.2014.02.003. PMID  24636862.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
  2. ^ Yang, Melinda A .; Fu, Qiaomei (březen 2018). „Pohledy do moderní lidské pravěku pomocí starověkých genomů“. Trendy v genetice. 34 (3): 184–196. doi:10.1016 / j.tig.2017.11.008. PMID  29395378.
  3. ^ Lv, X., Cheng, J., Meng, Y., Chang, Y., Xia, L., Wen, Z., Ge, D., Liu, S. a Yang, Q. (2018). "Disjunktní distribuce a zřetelná vnitrodruhová diverzifikace Eothenomys melanogaster v jižní Číně “. BMC Evoluční biologie. 18 (1): 50. doi:10.1186 / s12862-018-1168-3. PMC  5894153. PMID  29636000.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
  4. ^ Jaisuk, C. a Senanan, W. (2018). „Účinky krajinných prvků na populační genetickou variabilitu tropických potoků, střevle lapování, Garra cambodgiensis, v povodí horní řeky Nan, severní Thajsko ". PeerJ. 6: e4487. doi:10,7717 / peerj.4487. PMC  5845392. PMID  29568710.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
  5. ^ Kolbe, J. J., Larson, A., Losos, J. B. a de Queiroz, K. (2008). „Přísada určuje genetickou rozmanitost a diferenciaci populace při biologické invazi ještěrčího druhu“. Biologické dopisy. 4 (4): 434−437. doi:10.1098 / rsbl.2008.0205. PMC  2610154. PMID  18492644.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
  6. ^ Shriver, MD; et al. (Duben 2003). "Pigmentace kůže, biogeografické předky a mapování příměsí". Genetika člověka. 112 (4): 387–99. doi:10.1007 / s00439-002-0896-r. PMID  12579416. S2CID  7877572.
  7. ^ Winkler, C. A .; Nelson, G. W .; Smith, M. W. (2010). „Mapování příměsí dospívá“. Annu Rev Genom Hum Genet. 11: 65–89. doi:10.1146 / annurev-genom-082509-141523. PMC  7454031. PMID  20594047.

Další čtení