GTF3C5 - GTF3C5

GTF3C5
Identifikátory
AliasyGTF3C5, TFIIIC63, TFIIICepsilon, TFiiiC2-63, obecná transkripční faktor IIIC podjednotka 5
Externí IDOMIM: 604890 MGI: 1917489 HomoloGene: 40806 Genové karty: GTF3C5
Umístění genu (člověk)
Chromozom 9 (lidský)
Chr.Chromozom 9 (lidský)[1]
Chromozom 9 (lidský)
Genomické umístění pro GTF3C5
Genomické umístění pro GTF3C5
Kapela9q34.13Start133,030,675 bp[1]
Konec133,058,503 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE GTF3C5 217876 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001122823
NM_001286709
NM_012087

NM_001290484
NM_148928

RefSeq (protein)

NP_001116295
NP_001273638
NP_036219

NP_001277413
NP_683730

Místo (UCSC)Chr 9: 133,03 - 133,06 MbChr 2: 28,57 - 28,58 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Obecný transkripční faktor 3C polypeptid 5 je protein že u lidí je kódován GTF3C5 gen.[5][6]

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce GTF3C5. Podmíněný knockout myš linka, tzv Gtf3c5tm2a (KOMP) Wtsi[11][12] byl vygenerován jako součást International Knockout Mouse Consortium program - vysoce výkonný projekt mutageneze pro generování a distribuci zvířecích modelů nemocí zainteresovaným vědcům.[13][14][15]

Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka k určení účinků vypuštění.[9][16] Bylo provedeno dvacet čtyři testů mutant myši a byly pozorovány dvě významné abnormality.[9] Ne homozygotní mutant embrya byla identifikována během těhotenství, a proto žádná nepřežila až do odstavení. Zbývající testy byly provedeny dne heterozygotní mutantní dospělé myši; u těchto zvířat nebyly pozorovány žádné další významné abnormality.[9]

Interakce

GTF3C5 bylo prokázáno, že komunikovat s GTF3C2[5] a GTF3C4.[17]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148308 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026816 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b Hsieh YJ, Wang Z, Kovelman R, Roeder RG (červenec 1999). „Klonování a charakterizace dvou evolučně konzervovaných podjednotek (TFIIIC102 a TFIIIC63) lidského TFIIIC a jejich zapojení do funkčních interakcí s TFIIIB a RNA polymerázou III“. Mol. Buňka. Biol. 19 (7): 4944–52. doi:10,1128 / mcb.19.7.4944. PMC  84305. PMID  10373544.
  6. ^ „Entrez Gene: GTF3C5 obecný transkripční faktor IIIC, polypeptid 5, 63 kDa“.
  7. ^ "Salmonella data infekce pro Gtf3c5 ". Wellcome Trust Sanger Institute.
  8. ^ "Citrobacter data infekce pro Gtf3c5 ". Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. ^ A b C d Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: Vysoce výkonná charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  10. ^ Portál myších zdrojů Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. ^ „International Knockout Mouse Consortium“.
  12. ^ "Myší genomová informatika".
  13. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  14. ^ Dolgin E (2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  15. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  16. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). „Sada nástrojů pro genetiku myší: odhalení funkce a mechanismu“. Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC  3218837. PMID  21722353.
  17. ^ Hsieh YJ, Kundu TK, Wang Z, Kovelman R, Roeder RG (listopad 1999). „TFIIIC90 podjednotka TFIIIC interaguje s více složkami mechanismu RNA polymerázy III a obsahuje aktivitu histonově specifické acetyltransferázy“. Mol. Buňka. Biol. 19 (11): 7697–704. doi:10.1128 / mcb.19.11.7697. PMC  84812. PMID  10523658.

Další čtení