GAPVD1 - GAPVD1
GAPVD1 | |||
---|---|---|---|
Identifikátory | |||
Aliasy | GAPVD1, GAPEX5, GAPex-5, RAP6, protein aktivující GTPázu a domény VPS9 1 | ||
Externí ID | OMIM: 611714 MGI: 1913941 HomoloGene: 32637 Genové karty: GAPVD1 | ||
Ortology | |||
Druh | Člověk | Myš | |
Entrez | |||
Ensembl | |||
UniProt | |||
RefSeq (mRNA) | |||
RefSeq (protein) | |||
Místo (UCSC) | Chr 9: 125,26 - 125,37 Mb | Chr 2: 34,67 - 34,76 Mb | |
PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |
Wikidata | |||
GTPáza aktivující protein a domény VPS9 1, také známý jako GAPVD1, Gapex-5 a RME-6 je protein který je u lidí kódován GAPVD1 gen.[5][6]
Funkce
GAPVD1 je Rab GTPáza guaninový nukleotidový výměnný faktor nezbytné pro aktivaci RAB5A během zaplavení apoptotický buňky.[7] GAPVD1 se také podílí na degradaci receptor epidermálního růstového faktoru.[8]Aktivace Rab5 zprostředkovaná gapex-5 se podílí na inzulínem stimulované tvorbě plazmatické membrány fosfatidylinositol-3-fosfát.[9]
Struktura
Na základě sekvenční homologie bylo prokázáno, že savčí Gapex-5 má amino-koncový Ras MEZERA doména, centrální polyprolin (SH3 vazebnou) oblast a karboxy-terminální Rab GEF doména. Doména RabGEF byla navržena k aktivaci Rab5[10] a Rab31.[11]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165219 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026867 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Entrez Gene: GAPVD1 GTPáza aktivující protein a domény VPS9 1“.
- ^ Hunker CM, Galvis A, Kruk I, Giambini H, Veisaga ML, Barbieri MA (únor 2006). „Rab5-aktivující protein 6, nový endozomální protein s rolí v endocytóze“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 340 (3): 967–75. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.12.099. PMID 16410077.
- ^ Kitano M, Nakaya M, Nakamura T, Nagata S, Matsuda M (květen 2008). „Zobrazování aktivity Rab5 identifikuje základní regulátory pro zrání fagozomu“. Příroda. 453 (7192): 241–5. doi:10.1038 / nature06857. PMID 18385674.
- ^ Su X, Kong C, Stahl PD (červenec 2007). „GAPex-5 zprostředkovává ubikvitinaci, obchodování a degradaci receptoru epidermálního růstového faktoru“. J. Biol. Chem. 282 (29): 21278–84. doi:10,1074 / jbc.M703725200. PMID 17545148.
- ^ Lodhi IJ, Bridges D, Chiang SH, Zhang Y, Cheng A, Geletka LM, Weisman LS, Saltiel AR (červenec 2008). „Inzulín stimuluje produkci fosfatidylinositol 3-fosfátu aktivací Rab5“. Mol. Biol. Buňka. 19 (7): 2718–28. doi:10,1091 / mbc.E08-01-0105. PMC 2441665. PMID 18434594.
- ^ Su X, Lodhi IJ, Saltiel AR, Stahl PD (září 2006). „Inzulínem stimulovaná interakce mezi substrátem 1 inzulinového receptoru a p85alfa a aktivace proteinkinázy B / Akt vyžaduje Rab5“. J. Biol. Chem. 281 (38): 27982–90. doi:10,1074 / jbc.M602873200. PMID 16880210.
- ^ Lodhi IJ, Chiang SH, Chang L, Vollenweider D, Watson RT, Inoue M, Pessin JE, Saltiel AR (leden 2007). „Gapex-5, rab31 guaninový nukleotidový výměnný faktor, který reguluje obchodování glutlut4 v adipocytech“. Cell Metab. 5 (1): 59–72. doi:10.1016 / j.cmet.2006.12.006. PMC 1779820. PMID 17189207.
Další čtení
- Su X, Kong C, Stahl PD (2007). „GAPex-5 zprostředkovává ubikvitinaci, obchodování a degradaci receptoru epidermálního růstového faktoru“. J. Biol. Chem. 282 (29): 21278–84. doi:10,1074 / jbc.M703725200. PMID 17545148.
- Hunker CM, Galvis A, Kruk I a kol. (2006). „Rab5-aktivující protein 6, nový endozomální protein s rolí v endocytóze“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 340 (3): 967–75. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.12.099. PMID 16410077.
- Jin J, Smith FD, Stark C a kol. (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Nagase T, Kikuno R, Ishikawa K a kol. (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (2): 143–50. doi:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID 10819331.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD a kol. (1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |