Doména GAF - GAF domain - Wikipedia
| Doména GAF | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 3 ', 5'-cyklická nukleotid fosfodiesteráza 2A, obsahující domény GAF A a GAF B.[1] | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | GAF | ||||||||
| Pfam | PF01590 | ||||||||
| Pfam klan | CL0161 | ||||||||
| InterPro | IPR003018 | ||||||||
| CHYTRÝ | GAF | ||||||||
| SCOP2 | 1fl4 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
The Doména GAF je typ proteinová doména který se nachází v široké škále proteinů všech druhů.[2] Doména GAF je pojmenována po některých proteinech, které se nacházejí v: cGMP specifické fosfodiesterázy, Adenylylcyklázy a FhlA. První struktura domény GAF vyřešená Ho a kolegy ukázala, že tato doména sdílela podobný záhyb s doménou PAS doména.[3] U savců se domény GAF nacházejí v pěti členech nadrodiny cyklických nukleotidů a fosfodiesteráz: PDE2, PDE5 a PDE6, které vážou cGMP na doménu GAF, PDE10, který váže cAMP, a PDE11, který váže cGMP i cAMP.[4][5]
Příklady
Lidské proteiny obsahující tuto doménu zahrnují:
Reference
- ^ Martinez SE, Wu AY, Glavas NA, Tang XB, Turley S, Hol WG, Beavo JA (říjen 2002). „Dvě domény GAF ve fosfodiesteráze 2A mají odlišné role při dimerizaci a ve vazbě cGMP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (20): 13260–5. Bibcode:2002PNAS ... 9913260M. doi:10.1073 / pnas.192374899. JSTOR 3073384. PMC 130621. PMID 12271124.
- ^ Aravind L, Ponting CP (prosinec 1997). "Doména GAF: evoluční spojení mezi různými fototransdukčními proteiny". Trendy v biochemických vědách. 22 (12): 458–9. doi:10.1016 / S0968-0004 (97) 01148-1. PMID 9433123.
- ^ Ho YS, Burden LM, Hurley JH (říjen 2000). „Struktura domény GAF, všudypřítomný signální motiv a nová třída cyklického receptoru GMP“. Časopis EMBO. 19 (20): 5288–99. doi:10.1093 / emboj / 19.20.5288. PMC 314001. PMID 11032796.
- ^ Fawcett L, Baxendale R, Stacey P, McGrouther C, Harrow I, Soderling S, Hetman J, Beavo JA, Phillips SC (březen 2000). "Molekulární klonování a charakterizace odlišné rodiny genů lidské fosfodiesterázy: PDE11A". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (7): 3702–7. Bibcode:2000PNAS ... 97.3702F. doi:10.1073 / pnas.050585197. JSTOR 121956. PMC 16303. PMID 10725373.
- ^ Schultz JE (2009). "Strukturální a biochemické aspekty tandemových domén GAF". Příručka experimentální farmakologie. 191 (191): 93–109. doi:10.1007/978-3-540-68964-5_6. ISBN 978-3-540-68960-7. PMID 19089327. Citovat deník vyžaduje
| deník =(Pomoc)