Analýza disperze vyvolaná tokem - Flow-induced dispersion analysis - Wikipedia

Analýza disperze vyvolaná tokem (FIDA) je technologie bez imobilizace používaná k charakterizaci a kvantifikaci biomolekulárních interakcí a protein koncentrace v nativních podmínkách.[1][2][3] Na FIDA test, velikost a ligand (indikátor) s afinitou k cílovému analytu. Když indikátor interaguje s analytem, zjevná velikost se zvětší a tato změna velikosti může být použita ke stanovení koncentrace a interakce analytu.[1][2][4] Navíc hydrodynamický poloměr komplexu analyt-indikátor. Test FIDA je obvykle dokončen během několika minut a vyžaduje pouze mírnou spotřebu vzorku několika µl.[1]
Aplikace
- Kvantifikace analytů (např. bílkoviny, peptidy, DNA, nanočástice[5]) ve složitých řešeních (např. plazma a fermentační vývar [6][7])
- Stanovení
- afinitní konstanty
- kinetika vazby
- velikost molekul (hydrodynamický poloměr )
- difúzní koeficient
Zásada
Princip FIDA je založen na měření změny ve zdánlivé velikosti (difuzivita ) selektivního indikátoru interagujícího s molekulou analytu.[1][2][4] Zdánlivá velikost indikátoru se měří pomocí Taylorova disperze analýza v kapiláře za hydrodynamického toku.[8]
Reference
- ^ A b C d E Poulsen, Nicklas N .; Andersen, Nina Z .; Østergaard, Jesper; Zhuang, Guisheng; Petersen, Nickolaj J .; Jensen, Henrik (2015-06-15). „Analýza disperze indukovaná průtokem rychle kvantifikuje proteiny ve vzorcích lidské plazmy“. Analytik. 140 (13): 4365–4369. doi:10.1039 / c5an00697j. ISSN 1364-5528. PMID 26031223.
- ^ A b C Morten E, Pedersen; Østergaard, Jesper; Jensen, Henrik (2019). „Analýza disperze indukovaná průtokem (FIDA) pro kvantifikaci a charakterizaci proteinů“. V Phillips, Terry M. (ed.). Klinické aplikace kapilární elektroforézy: metody a protokoly. Metody v molekulární biologii. 1972. New York, NY: Springer New York. 109–123. doi:10.1007/978-1-4939-9213-3. ISBN 9781493992126. S2CID 23665803.
- ^ Pedersen, Morten E .; Gad, Sarah I .; Østergaard, Jesper; Jensen, Henrik (05.04.2019). "Charakterizace proteinů ve 3D: hodnocení velikosti, složení a funkce v jednotném přístupu". Analytická chemie. 91 (8): 4975–4979. doi:10.1021 / acs.analchem.9b00537. ISSN 0003-2700. PMID 30916933.
- ^ A b Jensen, Henrik; Østergaard, Jesper (2010-03-31). „Analýza disperze indukovaná průtokem kvantifikuje nekovalentní interakce ve vzorcích Nanoliter“. Journal of the American Chemical Society. 132 (12): 4070–4071. doi:10.1021 / ja100484d. ISSN 0002-7863. PMID 20201527.
- ^ Cholak, Ersoy; Bugge, Katrine; Khondker, Adree; Gauger, Kimmie; Pedraz-Cuesta, Elena; Pedersen, Morten Enghave; Bucciarelli, Saskia; Vestergaard, Bente; Pedersen, Stine F .; Rheinstädter, Maikel C .; Langkilde, Annette Eva (2020). „Avidita v N-koncové kotvě řídí interakci a inzerci membrány α-synukleinu“. FASEB Journal. 34 (6): 7462–7482. doi:10.1096 / fj.202000107R. ISSN 1530-6860. PMID 32277854. S2CID 215742011.
- ^ Poulsen, Nicklas N .; Pedersen, Morten E .; Østergaard, Jesper; Petersen, Nickolaj J .; Nielsen, Christoffer T .; Heegaard, Niels H. H .; Jensen, Henrik (2016-09-20). „Analýza disperze indukovaná průtokem pro zkoumání heterogenity vazby protilátek anti-dsDNA u pacientů se systémovým lupus erythematodes: Směrem k novému přístupu k diagnostice a stratifikaci pacientů“. Analytická chemie. 88 (18): 9056–9061. doi:10.1021 / acs.analchem.6b01741. ISSN 0003-2700. PMID 27571264.
- ^ Pedersen, Morten E .; Østergaard, Jesper; Jensen, Henrik (2020-04-28). „Stanovení titru IgG v roztoku ve fermentační půdě pomocí protilátek a analýzy disperze vyvolané průtokem“. ACS Omega. 5 (18): 10519–10524. doi:10.1021 / acsomega.0c00791. ISSN 2470-1343. PMC 7227040. PMID 32426609.
- ^ Taylor, sir Geoffrey; S, F. R. (1953-08-25). "Disperze rozpustné látky v rozpouštědle pomalu proudící trubicí". Proc. R. Soc. Lond. A. 219 (1137): 186–203. doi:10.1098 / rspa.1953.0139. ISSN 0080-4630. S2CID 97372019.