FUSIP1 - FUSIP1

SRSF10
Identifikátory
Aliasy	SRSF10, FUSIP1, FUSIP2, NSSR, PPP1R149, SFRS13, SFRS13A, SRp38, SRrp40, TASR, TASR1, TASR2, spojovací faktor bohatý na serin / arginin 10, spojovací faktor bohatý na serin a arginin 10
Externí ID	OMIM: 605221 MGI: 1333805 HomoloGene: 134051 Genové karty: SRSF10
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	23,980,927 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	135,869,908 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• rozložená vazba na bílkoviny; • Vazba domény RS; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• Sestřih RNA prostřednictvím transesterifikačních reakcí; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • Zpracování mRNA; • sestava spliceosomálního tri-snRNP komplexu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu; • Výběr místa sestřihu mRNA; • export mRNA z jádra; • Sestřih RNA; • regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu; • cytosolický transport; • regulace sestřihu RNA; • regulace alternativního mRNA sestřihu pomocí spliceosomu; • rozpoznávání mRNA 5'-místa sestřihu; • mRNA cis sestřih, prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10772
	14105
	ENSG00000188529
	ENSMUSG00000028676
	O75494; Q5JRI1
	Q9R0U0
NM_001191005; NM_001191006; NM_001191007; NM_001191009; NM_001300936;
	NM_001300937; NM_006625; NM_054016
	NM_001080387; NM_001284195; NM_001284196; NM_010178
NP_001177934; NP_001177935; NP_001177936; NP_001177938; NP_001287865;
	NP_001287866; NP_006616; NP_473357; NP_001287865.1
	NP_001073856; NP_001271124; NP_001271125; NP_034308
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

FUS interagující protein bohatý na serin-arginin 1 je protein že u lidí je kódován SFRS13A gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento genový produkt je členem serin-argininu (SR ) rodina proteinů, která se podílí na konstitutivním a regulovaném sestřihu RNA. Členové této rodiny se vyznačují N-koncovými motivy RNP1 a RNP2, které jsou nutné pro vazbu na RNA, a četnými C-koncovými SR / RS opakováními, které jsou důležité při zprostředkování spojení s jinými buněčnými proteiny. Tento protein může ovlivnit výběr místa sestřihu pre-mRNA adenoviru E1A. Interaguje s onkoproteinem TLS a ruší vliv TLS na sestřih pre-mRNA E1A. Alternativní sestřih Výsledkem tohoto genu jsou alespoň dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy. Kromě toho existují varianty transkriptu využívající alternativní polyA místa.^[7]

Interakce

FUSIP1 bylo prokázáno komunikovat s FUS.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000188529 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028676 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yang L, Embree LJ, Tsai S, Hickstein DD (listopad 1998). „Onkoprotein TLS interaguje s proteiny serinu a argininu zapojenými do sestřihu RNA“. J. Biol. Chem. 273 (43): 27761–4. doi:10.1074 / jbc.273.43.27761. PMID 9774382.
^ Clinton JM, Chansky HA, Odell DD, Zielinska-Kwiatkowska A, Hickstein DD, Yang L (březen 2002). "Charakterizace a exprese lidského genu kódujícího dva proteiny serin-arginin (TASR) spojené s translokačním liposarkomovým proteinem". Gen. 284 (1–2): 141–7. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00382-7. PMID 11891055.
^ ^A ^b "Entrez Gene: FUSIP1 FUS interagující protein (bohatý na serin / arginin) 1".
^ Yang L, Embree LJ, Hickstein DD (květen 2000). „Fúzní protein leukémie TLS-ERG inhibuje sestřih RNA zprostředkovaný proteiny serin-arginin“. Mol. Buňka. Biol. 20 (10): 3345–54. doi:10.1128 / MCB.20.10.3345-3354.2000. PMC 85627. PMID 10779324.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Yang L, Embree LJ, Hickstein DD (2000). „Fúzní protein leukémie TLS-ERG inhibuje sestřih RNA zprostředkovaný proteiny serin-arginin“. Mol. Buňka. Biol. 20 (10): 3345–54. doi:10.1128 / MCB.20.10.3345-3354.2000. PMC 85627. PMID 10779324.
Cowper AE, Cáceres JF, Mayeda A, Screaton GR (2001). „Serin-arginin (SR) proteiny podobné faktory, které antagonizují autentické SR proteiny a regulují alternativní sestřih“. J. Biol. Chem. 276 (52): 48908–14. doi:10,1074 / jbc.M103967200. PMID 11684676.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298.
Shin C, Manley JL (2002). „SR protein SRp38 potlačuje sestřih v buňkách M fáze“. Buňka. 111 (3): 407–17. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 01038-3. PMID 12419250.
Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (2003). „Regulace alternativního sestřihu pomocí SRrp86 a jeho interagujících proteinů“. Mol. Buňka. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Shin C, Feng Y, Manley JL (2004). „Defosforylovaný SRp38 působí jako spojovací represor v reakci na tepelný šok“. Příroda. 427 (6974): 553–8. doi:10.1038 / nature02288. PMID 14765198.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (2005). „Cílená proteomická analýza 14-3-3 sigma, efektoru p53 běžně umlčeného při rakovině“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (6): 785–95. doi:10,1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
Shin C, Kleiman FE, Manley JL (2005). „Několik vlastností sestřihovacího represoru SRp38 jej odlišuje od typických proteinů SR“. Mol. Buňka. Biol. 25 (18): 8334–43. doi:10.1128 / MCB.25.18.8334-8343.2005. PMC 1234314. PMID 16135820.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000188529 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028676 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9774382-5] Yang L, Embree LJ, Tsai S, Hickstein DD (listopad 1998). „Onkoprotein TLS interaguje s proteiny serinu a argininu zapojenými do sestřihu RNA“. J. Biol. Chem. 273 (43): 27761–4. doi:10.1074 / jbc.273.43.27761. PMID 9774382.

[pmid11891055-6] Clinton JM, Chansky HA, Odell DD, Zielinska-Kwiatkowska A, Hickstein DD, Yang L (březen 2002). "Charakterizace a exprese lidského genu kódujícího dva proteiny serin-arginin (TASR) spojené s translokačním liposarkomovým proteinem". Gen. 284 (1–2): 141–7. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00382-7. PMID 11891055.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: FUSIP1 FUS interagující protein (bohatý na serin / arginin) 1".

[pmid10779324-8] Yang L, Embree LJ, Hickstein DD (květen 2000). „Fúzní protein leukémie TLS-ERG inhibuje sestřih RNA zprostředkovaný proteiny serin-arginin“. Mol. Buňka. Biol. 20 (10): 3345–54. doi:10.1128 / MCB.20.10.3345-3354.2000. PMC 85627. PMID 10779324.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]