FBLIM1 - FBLIM1

FBLIM1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2K9U, 2W0P, 4P3W
Identifikátory
Aliasy	FBLIM1, CAL, FBLP-1, FBLP1, filamin vázající protein LIM 1
Externí ID	OMIM: 607747 MGI: 1921452 HomoloGene: 56774 Genové karty: FBLIM1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	15,786,594 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	141,606,096 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba filaminu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčná kůra; • cytoskelet; • stresové vlákno; • ohnisková adheze; • fibrilární centrum; • buněčné spojení;
Biologický proces	• regulace aktivace integrinu; • buněčná adheze; • sestava buněčného spojení; • regulace tvaru buňky; • buněčná adheze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54751
	74202
	ENSG00000162458
	ENSMUSG00000006219
	Q8WUP2
	Q71FD7
	NM_001024215; NM_001024216; NM_017556; NM_001350151
	NM_001163256; NM_133754; NM_001378958; NM_001378959
	NP_001019386; NP_001019387; NP_060026; NP_001337080
	NP_001156728; NP_598515; NP_001365887; NP_001365888
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Filamin vázající protein LIM 1 je protein že u lidí je kódován FBLIM1 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje protein s N-koncovou doménou vázající filamin, centrální doménou bohatou na prolin a více C-koncovými LIM doménami. Tento protein se lokalizuje na buněčných spojích a může spojovat buněčné adhezní struktury s aktinovým cytoskeletem. Tento protein může být zapojen do sestavování a stabilizace aktinových vláken a pravděpodobně hraje roli v modulaci buněčné adheze, morfologie buněk a buněčné motility. Tento protein se také lokalizuje do jádra a může ovlivnit diferenciaci kardiomyocytů po navázání s transkripčním faktorem CSX / NKX2-5. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[7]

Interakce

FBLIM1 bylo prokázáno komunikovat s Filamin,^[8] PLEKHC1^[5] a FLNB.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162458 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006219 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Tu Y, Wu S, Shi X, Chen K, Wu C (duben 2003). „Migfilin a Mig-2 spojují fokální adheze s filaminem a aktinovým cytoskeletem a fungují v modulaci buněčného tvaru“. Buňka. 113 (1): 37–47. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00163-6. PMID 12679033.
^ Takafuta T, Saeki M, Fujimoto TT, Fujimura K, Shapiro SS (březen 2003). „Nový člen rodiny proteinů LIM se váže na filamin B a lokalizuje se na stresových vláknech“. J Biol Chem. 278 (14): 12175–81. doi:10,1074 / jbc.M209339200. PMID 12496242.
^ ^A ^b "Entrez Gene: FBLIM1 filamin vázající LIM protein 1".
^ Tu, Yizeng; Wu Shan; Shi Xiaohua; Chen Ka; Wu Chuanyue (duben 2003). „Migfilin a Mig-2 spojují fokální adheze s filaminem a aktinovým cytoskeletem a fungují v modulaci buněčného tvaru“. Buňka. Spojené státy. 113 (1): 37–47. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00163-6. ISSN 0092-8674. PMID 12679033.
^ Takafuta, Toshiro; Saeki Mari; Fujimoto Tetsuro-Takahiro; Fujimura Kingo; Shapiro Sandor S (duben 2003). „Nový člen rodiny proteinů LIM se váže na filamin B a lokalizuje se na stresových vláknech“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 278 (14): 12175–81. doi:10,1074 / jbc.M209339200. ISSN 0021-9258. PMID 12496242.

Další čtení

Wu C (2005). „Migfilin a jeho vazební partneři: od buněčné biologie po lidské nemoci“. J. Cell Sci. 118 (Pt 4): 659–64. doi:10.1242 / jcs.01639. PMID 15701922.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Akazawa H, Kudoh S, Mochizuki N a kol. (2004). „Nový LIM protein Cal podporuje srdeční diferenciaci spojením s CSX / NKX2-5“. J. Cell Biol. 164 (3): 395–405. doi:10.1083 / jcb.200309159. PMC 2172236. PMID 14757752.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Gkretsi V, Zhang Y, Tu Y a kol. (2005). „Fyzikální a funkční asociace migfilinu s adhezí mezi buňkami“. J. Cell Sci. 118 (Pt 4): 697–710. doi:10.1242 / jcs.01638. PMID 15671069.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y a kol. (2006). "Transkriptomová analýza lidské rakoviny žaludku". Mamm. Genom. 16 (12): 942–54. doi:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674.
Zhang Y, Tu Y, Gkretsi V, Wu C (2006). „Migfilin interaguje s vazodilatátorem stimulovaným fosfoproteinem (VASP) a reguluje lokalizaci VASP na adheze a migraci buněčné matrice.“. J. Biol. Chem. 281 (18): 12397–407. doi:10,1074 / jbc.M512107200. PMID 16531412.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. Bibcode:2006 Natur.441..315G. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Papachristou DJ, Gkretsi V, Tu Y a kol. (2007). „Zvýšená cytoplazmatická hladina migfilinu je spojena s vyššími stupni lidského leiomyosarkomu“. Histopatologie. 51 (4): 499–508. doi:10.1111 / j.1365-2559.2007.02791.x. PMC 2768333. PMID 17711449.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162458 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006219 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12679033-5] A ^b Tu Y, Wu S, Shi X, Chen K, Wu C (duben 2003). „Migfilin a Mig-2 spojují fokální adheze s filaminem a aktinovým cytoskeletem a fungují v modulaci buněčného tvaru“. Buňka. 113 (1): 37–47. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00163-6. PMID 12679033.

[pmid12496242-6] Takafuta T, Saeki M, Fujimoto TT, Fujimura K, Shapiro SS (březen 2003). „Nový člen rodiny proteinů LIM se váže na filamin B a lokalizuje se na stresových vláknech“. J Biol Chem. 278 (14): 12175–81. doi:10,1074 / jbc.M209339200. PMID 12496242.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: FBLIM1 filamin vázající LIM protein 1".

[autogenerated2-8] Tu, Yizeng; Wu Shan; Shi Xiaohua; Chen Ka; Wu Chuanyue (duben 2003). „Migfilin a Mig-2 spojují fokální adheze s filaminem a aktinovým cytoskeletem a fungují v modulaci buněčného tvaru“. Buňka. Spojené státy. 113 (1): 37–47. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00163-6. ISSN 0092-8674. PMID 12679033.

[autogenerated1-9] Takafuta, Toshiro; Saeki Mari; Fujimoto Tetsuro-Takahiro; Fujimura Kingo; Shapiro Sandor S (duben 2003). „Nový člen rodiny proteinů LIM se váže na filamin B a lokalizuje se na stresových vláknech“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 278 (14): 12175–81. doi:10,1074 / jbc.M209339200. ISSN 0021-9258. PMID 12496242.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]