Exozomální složka 9 - Exosome component 9

EXOSC9
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2NN6
Identifikátory
Aliasy	EXOSC9, PM / Scl-75, PMSCL1, RRP45, Rrp45p, p5, p6, komponenta Exosome 9, PCH1D
Externí ID	OMIM: 606180 MGI: 1355319 HomoloGene: 3693 Genové karty: EXOSC9
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	121,817,021 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	36,565,727 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy; • aktivita exoribonukleázy; • Vazba prvků bohatých na AU; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivace transkripčního faktoru aktivující RNA polymerázu II; • Vazba RNA; • Vazba na oblast bohatou na mRNA 3'-UTR AU;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • exosom (komplex RNázy); • jaderný exosom (komplex RNázy); • nukleární chromozom; • jádro; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytoplazmatický exosom (komplex RNázy);
Biologický proces	• Zpracování RNA; • regulace stability mRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na rRNA; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA; • pozitivní regulace buněčného růstu; • dozor nad jadernou mRNA; • imunitní odpověď; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • zpracování rRNA; • exonukleolytické trimování pro generování zralého 3'-konce 5,8S rRNA z tricistronického rRNA transkriptu (SSU-rRNA, 5,8S rRNA, LSU-rRNA); • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, exonukleolytický, 3'-5 '; • Zpracování 3'-konce U1 snRNA; • Zpracování 3'-konce U4 snRNA; • Zpracování 3'-konce U5 snRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na tRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na mRNA; • katabolický proces rRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5393
	50911
	ENSG00000123737
	ENSMUSG00000027714
	Q06265
	Q9JHI7
	NM_001034194; NM_005033
	NM_019393
	NP_001029366; NP_005024
	NP_062266
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Exozomální složka 9, také známý jako EXOSC9, je člověk gen, jehož proteinový produkt je součástí exosomový komplex a je autoantigenem jsou pacienti s určitými autoimunitními chorobami, zejména skleromyozitida.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123737 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027714 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: EXOSC9 exosomová složka 9".

Další čtení

Alderuccio F, Chan EK, Tan EM (1991). „Molekulární charakterizace autoantigenu PM-Scl u syndromu překrytí polymyositis / sklerodermie: jedinečná a úplná lidská cDNA kódující zjevný 75-kD kyselý protein nukleolárního komplexu“. J. Exp. Med. 173 (4): 941–52. doi:10.1084 / jem.173.4.941. PMC 2190817. PMID 2007859.
Allmang C, Petfalski E, Podtelejnikov A, et al. (1999). „Exosom kvasinek a lidský PM – Scl jsou příbuzné komplexy 3 ′ → 5 ′ exonukleáz“. Genes Dev. 13 (16): 2148–58. doi:10.1101 / gad.13.16.2148. PMC 316947. PMID 10465791.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R a kol. (2001). „Tři nové složky lidského exosomu“. J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. doi:10,1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.
Chen CY, Gherzi R, Ong SE a kol. (2002). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.
Mukherjee D, Gao M, O'Connor JP a kol. (2002). „Savčí exozom zprostředkovává účinnou degradaci mRNA, které obsahují prvky bohaté na AU“. EMBO J.. 21 (1–2): 165–74. doi:10.1093 / emboj / 21.1.165. PMC 125812. PMID 11782436.
Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.
Brouwer R, Vree Egberts WT, Hengstman GJ a kol. (2002). „Autoprotilátky zaměřené na nové složky komplexu PM / Scl, lidský exosom“. Arthritis Res. 4 (2): 134–8. doi:10,1186 / ar389. PMC 83843. PMID 11879549.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2003). „Asociace lidského autoantigenu PM / Scl-75 s exosomem závisí na nově identifikovaném N konci“. J. Biol. Chem. 278 (33): 30698–704. doi:10,1074 / jbc.M302488200. PMID 12788944.
Lehner B, Semple JI, Brown SE a kol. (2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
Raijmakers R, Renz M, Wiemann C a kol. (2004). „PM-Scl-75 je hlavním autoantigenem u pacientů se syndromem překrytí polymyositis / sklerodermie“. Artritida Rheum. 50 (2): 565–9. doi:10.1002 / art.20056. PMID 14872500.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Tsang HT, Connell JW, Brown SE a kol. (2006). „Systematická analýza interakcí humánního proteinu CHMP: další proteiny obsahující doménu MIT se vážou na více složek lidského komplexu ESCRT III.“ Genomika. 88 (3): 333–46. doi:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
van Dijk EL, Schilders G, Pruijn GJ (2007). „Růst lidských buněk vyžaduje funkční cytoplazmatický exosom, který se účastní různých cest rozpadu mRNA“. RNA. 13 (7): 1027–35. doi:10,1261 / rna.575107. PMC 1894934. PMID 17545563.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123737 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027714 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: EXOSC9 exosomová složka 9".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]