Exozomální složka 10 - Exosome component 10

EXOSC10
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2CPR, 3SAF, 3SAG, 3SAH
Identifikátory
Aliasy	EXOSC10, PM-Scl, PM / Scl-100, PMSCL, PMSCL2, RRP6, Rrp6p, p2, p3, p4, exozomální složka 10
Externí ID	OMIM: 605960 MGI: 1355322 HomoloGene: 31105 Genové karty: EXOSC10
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	11,099,881 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	148,582,401 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • aktivita exoribonukleázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • katalytická aktivita; • Aktivita 3'-5 'exonukleázy; • vazba nukleové kyseliny; • aktivita nukleázy; • aktivita exonukleázy; • aktivita hydrolázy; • Vazba RNA; • Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy; • vazba telomerázy RNA; • jednořetězcová vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • exosom (komplex RNázy); • membrána; • jaderný exosom (komplex RNázy); • intracelulární; • jádro; • transkripčně aktivní chromatin; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• Zpracování RNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na rRNA; • hydrolýza fosfodiesterové vazby nukleové kyseliny; • jaderná retence nesestříhané pre-mRNA v místě transkripce; • STŘIH katabolický proces; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA; • dozor nad jadernou mRNA; • buněčný metabolismus; • zrání 5,8S rRNA; • histonová mRNA katabolický proces; • kompenzace dávky inaktivací chromozomu X; • metabolický proces složený z nukleobáze; • zpracování rRNA; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, exonukleolytická; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, nesmysl zprostředkovaný rozpad; • negativní regulace údržby telomer prostřednictvím telomerázy; • regulace lokalizace telomerasové RNA do Cajalova těla; • exonukleolytické trimování pro generování zralého 3'-konce 5,8S rRNA z tricistronického rRNA transkriptu (SSU-rRNA, 5,8S rRNA, LSU-rRNA); • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na snoRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na snRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na tRNA; • katabolický proces CUT závislý na jaderné polyadenylaci; • nukleární polyadenylace závislý antisense transkript katabolický proces; • zpracování na 3'-konci snoRNA závislé na polyadenylaci;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5394
	50912
	ENSG00000171824
	ENSMUSG00000017264
	Q01780
	P56960
	NM_001001998; NM_002685
	NM_016699; NM_001355489; NM_001355490
	NP_001001998; NP_002676
	NP_057908; NP_001342418; NP_001342419
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Exozomální složka 10, také známý jako EXOSC10, je člověk gen, jehož proteinový produkt je součástí exosomový komplex a je autoantigenem jsou pacienti s určitými autoimunitními chorobami, zejména skleromyozitida.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171824 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017264 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: EXOSC10 exozomální složka 10“.

Další čtení

Blüthner M, Bautz FA (1992). „Klonování a charakterizace cDNA kódující nukleolární 100-kD protein související se syndromem polymyositis-sklerodermie překrývající se“. J. Exp. Med. 176 (4): 973–80. doi:10.1084 / jem.176.4.973. PMC 2119404. PMID 1383382.
Ge Q, Frank MB, O'Brien C, Targoff IN (1992). „Klonování komplementární DNA kódující 100 kD antigenní protein autoantigenu PM-Scl“. J. Clin. Investovat. 90 (2): 559–70. doi:10.1172 / JCI115895. PMC 443135. PMID 1644924.
Allmang C, Petfalski E, Podtelejnikov A, et al. (1999). „Exosom kvasinek a lidský PM-Scl jsou příbuzné komplexy 3 '-> 5' exonukleáz.". Genes Dev. 13 (16): 2148–58. doi:10.1101 / gad.13.16.2148. PMC 316947. PMID 10465791.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R a kol. (2001). „Tři nové složky lidského exosomu“. J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. doi:10,1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.
Stover C, Endo Y, Takahashi M a kol. (2001). „Lidský gen pro serinovou proteázu-2 vázanou na mannan s lektinem (MASP-2), efektorová složka lektinové cesty aktivace komplementu, je součástí těsně spojeného genového klastru na chromozomu 1p36.2-3.“. Genes Immun. 2 (3): 119–27. doi:10.1038 / sj.gene.6363745. PMID 11426320.
Chen CY, Gherzi R, Ong SE a kol. (2002). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186.
Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.
Brouwer R, Vree Egberts WT, Hengstman GJ a kol. (2002). „Autoprotilátky zaměřené na nové složky komplexu PM / Scl, lidský exosom“. Arthritis Res. 4 (2): 134–8. doi:10,1186 / ar389. PMC 83843. PMID 11879549.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
Scherl A, Couté Y, Déon C a kol. (2003). "Funkční proteomická analýza lidského nukleolu". Mol. Biol. Buňka. 13 (11): 4100–9. doi:10,1091 / mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2003). „Asociace lidského autoantigenu PM / Scl-75 s exosomem závisí na nově identifikovaném N konci“. J. Biol. Chem. 278 (33): 30698–704. doi:10,1074 / jbc.M302488200. PMID 12788944.
Lejeune F, Li X, Maquat LE (2003). „Nonsense zprostředkovaný rozpad mRNA v buňkách savců zahrnuje dekapování, deadenylaci a exonukleolytické aktivity“. Mol. Buňka. 12 (3): 675–87. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00349-6. PMID 14527413.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H a kol. (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216.
Raijmakers R, Renz M, Wiemann C a kol. (2004). „PM-Scl-75 je hlavním autoantigenem u pacientů se syndromem překrytí polymyositis / sklerodermie“. Artritida Rheum. 50 (2): 565–9. doi:10.1002 / art.20056. PMID 14872500.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
van Dijk EL, Schilders G, Pruijn GJ (2007). „Růst lidských buněk vyžaduje funkční cytoplazmatický exosom, který se účastní různých cest rozpadu mRNA“. RNA. 13 (7): 1027–35. doi:10,1261 / rna.575107. PMC 1894934. PMID 17545563.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171824 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017264 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: EXOSC10 exozomální složka 10“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]