Elafin - Elafin

PI3
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1FLE, 2 REL
Identifikátory
Aliasy	PI3, ESI, SKALP, WAP3, WFDC14, cementoin, inhibitor peptidázy 3
Externí ID	OMIM: 182257 HomoloGene: 122140 Genové karty: PI3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	45,176,544 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita inhibitoru peptidázy; • aktivita inhibitoru endopeptidázy; • aktivita inhibitoru endopeptidázy serinového typu; • strukturní složka epidermis;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • cytosol; • zrohovatělá obálka; • extracelulární matrix;
Biologický proces	• negativní regulace aktivity peptidázy; • páření; • negativní regulace aktivity endopeptidázy; • antimikrobiální humorální odpověď; • zrohovatění; • zesíťování peptidů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5266
	n / a
	ENSG00000124102
	n / a
	P19957
	n / a
	NM_002638
	n / a
	NP_002629
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Elafin, také známý jako inhibitor peptidázy 3 nebo kožní antileukoproteáza (SKALP), je protein že u lidí je kódován PI3 gen.^[3]^[4]^[5]

Funkce

Tento gen kóduje elastáza -charakteristický inhibitor proteázy, který obsahuje doménu čtyřdisulfidového jádra typu WAP (WFDC), a je tedy členem WFDC doména rodina. Většina členů genu WFDC je lokalizována na chromozom 20q 12-q13 ve dvou klastrech: centromerický a telomerický. Tento gen patří do centromerické shluku.^[5]

Klinický význam

Bylo zjištěno, že elafin je užitečný jako biomarker pro onemocnění kůže štěpem proti hostiteli.^[6]

Elafin hraje určitou roli při zánětu střev.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124102 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Molhuizen HO, Zeeuwen PL, Olde Weghuis D, Geurts van Kessel A, Schalkwijk J (únor 1994). "Přiřazení lidského genu kódujícího inhibitor epidermální serinové proteinázy SKALP (PI3) do oblasti chromozomu 20q12 → q13". Cytogenet Cell Genet. 66 (2): 129–31. doi:10.1159/000133683. PMID 8287685.
^ Clauss A, Lilja H, Lundwall A (listopad 2002). „Lokus na lidském chromozomu 20 obsahuje několik genů exprimujících domény inhibitoru proteázy s homologií se syrovátkovým kyselým proteinem“. Biochem J.. 368 (Pt 1): 233–42. doi:10.1042 / BJ20020869. PMC 1222987. PMID 12206714.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PI3 peptidázový inhibitor 3, odvozený z kůže (SKALP)".
^ Paczesny S, Levine JE, Hogan J, Crawford J, Braun TM, Wang H, Faca V, Zhang Q, Pitteri S, Chin A, Choi SW, Kitko CL, Krijanovski OI, Reddy P, Mineishi S, Whitfield J, Jones S , Hanash SM, Ferrara JLM (únor 2009). „[Elafin je biomarker štěpu proti hostitelské nemoci kůže“. Biologie transplantace krve a dřeně. 15 (2 Suppl 1): 13–14. doi:10.1016 / j.bbmt.2008.12.039. PMC 2895410. PMID 20371463.
^ https://articles.latimes.com/2012/nov/01/news/la-heb-engineered-bacteria-crohns-and-colitis-20121031

Další čtení

Sallenave JM (2003). „Úloha inhibitoru sekreční leukocytové proteinázy a elafinu (inhibitor specifický pro elastázu / antileukoproteáza odvozená z kůže) jako alarmujících antiproteináz u zánětlivých onemocnění plic. Respir. Res. 1 (2): 87–92. doi:10.1186 / rr18. PMC 59548. PMID 11667971.
Saheki T, Ito F, Hagiwara H a kol. (1992). "Primární struktura předchůdce lidského elafinového preproelafinu odvozená z nukleotidové sekvence jeho genu a přítomnost jedinečných opakujících se sekvencí v prosegmentu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 185 (1): 240–5. doi:10.1016 / S0006-291X (05) 80981-7. PMID 1339270.
Sallenave JM, MD Marsden, Ryle AP (1992). "Izolace elafinového a elastázově specifického inhibitoru (ESI) z bronchiálních sekretů. Důkaz sekvenční homologie a imunologické zkřížené reaktivity". Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 373 (1): 27–33. doi:10.1515 / bchm3.1992.373.1.27. PMID 1536690.
Chang A, Schalkwijk J, Happle R, van de Kerkhof PC (1990). "Aktivita inhibující elastázu při škálování kožních poruch". Acta Derm. Venereol. 70 (2): 147–51. PMID 1969201.
Schalkwijk J, de Roo C, de Jongh GJ (1991). "Antileukoproteináza odvozená z kůže (SKALP), inhibitor elastázy z lidských keratinocytů. Čištění a biochemické vlastnosti". Biochim. Biophys. Acta. 1096 (2): 148–54. doi:10.1016 / 0925-4439 (91) 90053-c. PMID 2001428.
Sallenave JM, Ryle AP (1991). "Čištění a charakterizace inhibitoru specifického pro elastázu. Sekvenční homologie s inhibitorem hlenové proteinázy". Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 372 (1): 13–21. doi:10.1515 / bchm3.1991.372.1.13. PMID 2039600.
Wiedow O, Schröder JM, Gregory H a kol. (1990). "Elafin: elastázově specifický inhibitor lidské kůže. Čištění, charakterizace a kompletní aminokyselinová sekvence". J. Biol. Chem. 265 (25): 14791–5. PMID 2394696.
Molhuizen HO, Alkemade HA, Zeeuwen PL a kol. (1993). "SKALP / elafin: inhibitor elastázy z kultivovaných lidských keratinocytů. Čištění, sekvence cDNA a důkazy o zesítění transglutaminázy". J. Biol. Chem. 268 (16): 12028–32. PMID 7685029.
Zhang M, Zou Z, Maass N, Sager R (1995). „Diferenciální exprese elafinu v normálních lidských prsních epiteliálních buňkách a karcinomech je regulována na transkripční úrovni“. Cancer Res. 55 (12): 2537–41. PMID 7780965.
Sallenave JM, Silva A (1993). „Charakterizace a genová sekvence prekurzoru elafinu, inhibitoru specifického pro elastázu v bronchiálních sekrecích“. Dopoledne. J. Respir. Cell Mol. Biol. 8 (4): 439–45. doi:10.1165 / ajrcmb / 8.4.439. PMID 8476637.
Tsunemi M, Matsuura Y, Sakakibara S, Katsube Y (1996). "Krystalová struktura elastázově specifického inhibitoru elafinu v komplexu s prasečí pankreatickou elastázou stanovena při rozlišení 1,9 A". Biochemie. 35 (36): 11570–6. doi:10.1021 / bi960900l. PMID 8794736.
Pfundt R, van Ruissen F, van Vlijmen-Willems IM a kol. (1996). "Konstitutivní a indukovatelná exprese SKALP / elafinu poskytuje anti-elastázovou obranu v lidských epitelích". J. Clin. Investovat. 98 (6): 1389–99. doi:10,1172 / JCI118926. PMC 507565. PMID 8823304.
Steinert PM, Marekov LN (1997). „Přímý důkaz, že involucrin je hlavní časně isopeptidově zesítěnou složkou buněčného obalu zrohovatělého keratinocytů“. J. Biol. Chem. 272 (3): 2021–30. doi:10.1074 / jbc.272.3.2021. PMID 8999895.
Francart C, Dauchez M, Alix AJ, Lippens G (1997). "Struktura roztoku R-elafinu, specifického inhibitoru elastázy". J. Mol. Biol. 268 (3): 666–77. doi:10.1006 / jmbi.1997.0983. PMID 9171290.
Kuijpers AL, Pfundt R, Zeeuwen PL a kol. (1998). „Polymorfismy genu SKALP / elafin nejsou spojeny s pustulárními formami psoriázy“. Clin. Genet. 54 (1): 96–101. doi:10.1111 / j.1399-0004.1998.tb03703.x. PMID 9727750. S2CID 34775360.
Mihaila A, Tremblay GM (2001). "Lidské alveolární makrofágy exprimují elafin a sekreční inhibitor leukocytové proteázy". Z. Naturforsch. C. 56 (3–4): 291–7. doi:10.1515 / znc-2001-3-420. PMID 11371023. S2CID 29205936.
Simpson AJ, Wallace WA, Marsden ME a kol. (2001). „Adenovirová augmentace elafinu chrání plíce před akutním poškozením způsobeným aktivovanými neutrofily a bakteriální infekcí“. J. Immunol. 167 (3): 1778–86. doi:10,4049 / jimmunol.167.3.1778. PMID 11466403.
Sumi Y, Inoue N, Azumi H a kol. (2002). "Exprese tkáňové transglutaminázy a elafinu v lidské koronární tepně: důsledek pro nestabilitu plaku". Ateroskleróza. 160 (1): 31–9. doi:10.1016 / S0021-9150 (01) 00542-1. PMID 11755920.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P19957 (Elafin) u PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124102 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8287685-3] Molhuizen HO, Zeeuwen PL, Olde Weghuis D, Geurts van Kessel A, Schalkwijk J (únor 1994). "Přiřazení lidského genu kódujícího inhibitor epidermální serinové proteinázy SKALP (PI3) do oblasti chromozomu 20q12 → q13". Cytogenet Cell Genet. 66 (2): 129–31. doi:10.1159/000133683. PMID 8287685.

[pmid12206714-4] Clauss A, Lilja H, Lundwall A (listopad 2002). „Lokus na lidském chromozomu 20 obsahuje několik genů exprimujících domény inhibitoru proteázy s homologií se syrovátkovým kyselým proteinem“. Biochem J.. 368 (Pt 1): 233–42. doi:10.1042 / BJ20020869. PMC 1222987. PMID 12206714.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: PI3 peptidázový inhibitor 3, odvozený z kůže (SKALP)".

[Paczesny_2009-6] Paczesny S, Levine JE, Hogan J, Crawford J, Braun TM, Wang H, Faca V, Zhang Q, Pitteri S, Chin A, Choi SW, Kitko CL, Krijanovski OI, Reddy P, Mineishi S, Whitfield J, Jones S , Hanash SM, Ferrara JLM (únor 2009). „[Elafin je biomarker štěpu proti hostitelské nemoci kůže“. Biologie transplantace krve a dřeně. 15 (2 Suppl 1): 13–14. doi:10.1016 / j.bbmt.2008.12.039. PMC 2895410. PMID 20371463.

[7] ttps://articles.latimes.com/2012/nov/01/news/la-heb-engineered-bacteria-crohns-and-colitis-20121031

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]