EcpR1 sRNA - EcpR1 sRNA

EcpR1 (fenotyp podlouhlých buněk RNA1) je a trans-kódovaný malá nekódující RNA v rostlinném symbiotiku Sinorhizobium meliloti, dříve pojmenované SmelC291, SmrC10 nebo Sra33.[1][2][3] Podle svého nadprodukčního fenotypu byl přejmenován na fenotyp podlouhlých buněk RNA1.[4] EcpR1, vyvolaný stresem, negativně reguluje hlavní regulační geny buněčného cyklu dnaA a gcrA na post-transkripční úrovni párováním bází mezi jeho silně konzervovanou smyčkou bohatou na GC a cílovými mRNA. Navrhuje se, že EcpR1 spojuje adaptaci stresu a progresi buněčného cyklu.[4]

Viz také

Další čtení

  1. ^ Schlüter JP, Reinkensmeier J, Daschkey S, Evguenieva-Hackenberg E, Janssen S, Jänicke S, Becker JD, Giegerich R, Becker A (duben 2010). „Genomový průzkum sRNA v symbiotickém alfa-proteobakteriu vázajícím dusík Sinorhizobium meliloti“. BMC Genomics. 11: 245. doi:10.1186/1471-2164-11-245. PMC  2873474. PMID  20398411.
  2. ^ Reinkensmeier J, Schlüter JP, Giegerich R, Becker A (listopad 2011). "Zachování a výskyt transkódovaných sRNA v Rhizobiales". Geny. 2 (4): 925–956. doi:10,3390 / geny2040925. PMC  3927594. PMID  24710299.
  3. ^ del Val C, Rivas E, Torres-Quesada O, Toro N, Jiménez-Zurdo JI (prosinec 2007). „Identifikace diferenciálně exprimovaných malých nekódujících RNA v luštěninovém endosymbiontu Sinorhizobium meliloti srovnávací genomikou“. Molekulární mikrobiologie. 66 (5): 1080–1091. doi:10.1111 / j.1365-2958.2007.05978.x. PMC  2780559. PMID  17971083.
  4. ^ A b Robledo M, Frage B, Wright PR, Becker A (duben 2015). „Stresem indukovaná malá RNA moduluje progresi alfa-rhizobiálního buněčného cyklu“. Genetika PLoS. 11 (4): e1005153. doi:10.1371 / journal.pgen.1005153. PMC  4414408. PMID  25923724.