RcsR1 malá RNA - RcsR1 small RNA
| RcsR1 sRNA | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence malé RNA RcsR1 | |
| Identifikátory | |
| Rfam | RF02552 |
| Další údaje | |
| Domény | Bakterie |
| JÍT | GO termín musí začínat GO:,SO: 0032055 |
| TAK | SO: 0000370 |
| PDB struktur | PDBe |
RcsR1 (rhizobiální chladný a slaný stresový riboregulátor 1) trans-působící sRNA, dříve známá jako SmelC587, je riboregulátor související se stresem, konzervovaný v Sinorhizobium, Rhizobium a Agrobacterium. Obsahuje vysoce konzervativní kmenové smyčky zapojené do interakce s několika cílovými mRNA (PhoR, MotE, anti-σE1, GntR, FgA, TrpC). v Sinorhizobium meliloti Méně konzervovaná centrální oblast RcsR1 je zodpovědná za druhově specifickou interakci s 5’UTR autoindukční syntáza kódující mRNA hřích. Interakce negativně ovlivňuje hřích překlad.[1]
Viz také
Reference
- ^ Baumgardt K, Šmídová K, Rahn H, Lochnit G, Robledo M, Evguenieva-Hackenberg E (květen 2016). „Stresová, rhizobiální malá RNA RcsR1 destabilizuje autoindukční syntázu kódující mRNA sinI v Sinorhizobium meliloti“. RNA Biology. 13 (5): 486–499. doi:10.1080/15476286.2015.1110673. PMC 4962803. PMID 26588798.