ECH1 - ECH1

ECH1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2VRE
Identifikátory
Aliasy	ECH1, HPXEL, enoyl-CoA hydratáza 1, peroxisomální, enoyl-CoA hydratáza 1
Externí ID	OMIM: 600696 MGI: 1858208 HomoloGene: 1069 Genové karty: ECH1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	38,831,841 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	28,832,247 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na receptory; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita izomerázy; • katalytická aktivita; • aktivita delta3,5-delta2,4-dienoyl-CoA izomerázy;
Buněčná složka	• peroxisom; • extracelulární exosom; • membrána; • mitochondrie; • peroxisomální matrice; • cytosol;
Biologický proces	• beta-oxidace mastných kyselin; • metabolismus; • metabolický proces mastných kyselin; • metabolismus lipidů; • cílení proteinů na peroxisom;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1891
	51798
	ENSG00000104823; ENSG00000282853
	ENSMUSG00000053898
	Q13011
	O35459
	NM_001398
	NM_016772
	NP_001389
	NP_058052
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Delta (3,5) -delta (2,4) -dienoyl-CoA izomeráza, mitochondriální je enzym že u lidí je kódován ECH1 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena hydratázy /izomeráza nadčeleď. Genový produkt vykazuje vysokou sekvenční podobnost s enoyl-CoA hydratázy několika druhů, zejména v konzervované doméně charakteristické pro tyto proteiny. Kódovaný protein, A3,5-A2,4-dienoyl-CoA izomeráza, obsahuje a C-terminál peroxizomální cílená sekvence a lokalizuje se na peroxisomy. Krysa ortolog, který se lokalizuje do matice jak peroxisomu, tak i mitochondrie, může izomerizovat 3-trans, 5-cis-dienoyl-CoA na 2-trans, 4-trans-dienoyl-CoA, což naznačuje, že se jedná o delta3,5-delta2,4-dienoyl-CoA izomerázu. Tento enzym funguje v pomocném kroku beta-oxidační dráhy mastných kyselin. Exprese krysího genu je vyvolána proliferátory peroxisomu.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000282853 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104823, ENSG00000282853 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000053898 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ FitzPatrick DR, Germain-Lee E, Valle D (listopad 1995). "Izolace a charakterizace krysí a lidské cDNA kódující novou domnělou peroxisomální enoyl-CoA hydratázu". Genomika. 27 (3): 457–66. doi:10.1006 / geno.1995.1077. PMID 7558027.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ECH1 enoyl Coenzyme A hydratase 1, peroxisomal“.

Další čtení

Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Kovalyov LI, Kovalyova MA, Kovalyov PL a kol. (2006). "Polymorfismus delta3,5-delta2,4-dienoyl-koenzym A izomerázy (proteinový produktový gen ECH1) v lidské pruhované svalové tkáni". Biochemistry Mosc. 71 (4): 448–53. doi:10.1134 / S0006297906040146. PMID 16615866. S2CID 11794020.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Goehler H, Lalowski M, Stelzl U a kol. (2004). „Síť proteinových interakcí spojuje GIT1, zesilovač agregace huntingtinu, s Huntingtonovou chorobou“. Mol. Buňka. 15 (6): 853–65. doi:10.1016 / j.molcel.2004.09.016. PMID 15383276.
Jia Y, Qi C, Zhang Z a kol. (2004). „Nadměrná exprese genů regulovaných receptorem alfa (PPARalfa) aktivovaným proliferátorem peroxisomu v játrech v nepřítomnosti proliferace peroxisomu u myší s deficitem obou L- a D-forem enzymů enoyl-CoA hydratázy / dehydrogenázy peroxisomálního beta-oxidačního systému“. J. Biol. Chem. 278 (47): 47232–9. doi:10,1074 / jbc.M306363200. PMID 14500732.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Filppula SA, Yagi AI, Kilpeläinen SH a kol. (1998). "Delta3,5-delta2,4-dienoyl-CoA izomeráza z potkaních jater. Molekulární charakterizace". J. Biol. Chem. 273 (1): 349–55. doi:10.1074 / jbc.273.1.349. PMID 9417087.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q13011 (Delta (3,5) -Delta (2,4) -dienoyl-CoA izomeráza, mitochondriální) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000282853 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104823, ENSG00000282853 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000053898 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7558027-5] FitzPatrick DR, Germain-Lee E, Valle D (listopad 1995). "Izolace a charakterizace krysí a lidské cDNA kódující novou domnělou peroxisomální enoyl-CoA hydratázu". Genomika. 27 (3): 457–66. doi:10.1006 / geno.1995.1077. PMID 7558027.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ECH1 enoyl Coenzyme A hydratase 1, peroxisomal“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]