Drebrin - Drebrin-like

DBNL
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X67
Identifikátory
Aliasy	DBNL, ABP1, HIP-55, HIP55, SH3P7, podobné Drebrinu, podobné drebrinu
Externí ID	OMIM: 610106 MGI: 700006 HomoloGene: 8468 Genové karty: DBNL
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	44,069,456 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	5,800,962 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• specifické vazby na proteinovou doménu; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: aktivita aktivátoru enzymu 0010577; • vazba aktinového vlákna; • aktinová vazba; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• endozom; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • membrána; • Golgiho membrána; • buněčná membrána; • synapse; • intracelulární; • buněčné spojení; • dendrit; • časný endosom; • klatrinem potažená membrána vezikul; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • cytoplazmatický váček; • podosomy; • lamellipodium; • cytoplazma; • prohrábnout; • buněčná kůra; • cytosol; • extracelulární oblast; • lumen sekreční granule; • lumen terciární granule; • lumen granule bohaté na ficolin-1;
Biologický proces	• endocytóza; • adaptivní imunitní odpověď; • aktivace aktivity JUN kinázy; • proces imunitního systému; • sestava synapse; • morfogeneze projekce neuronů; • montáž podosomu; • Transdukce signálu proteinu Rac; • degranulace neutrofilů; • receptorem zprostředkovaná endocytóza; • sestavení volánku; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	28988
	13169
	ENSG00000136279
	ENSMUSG00000020476
	Q9UJU6
	Q62418
NM_001014436; NM_001122956; NM_001284313; NM_001284315; NM_014063;
	NM_001362723
	NM_001146308; NM_001146309; NM_013810
NP_001014436; NP_001116428; NP_001271242; NP_001271244; NP_054782;
	NP_001349652
	NP_001139780; NP_001139781; NP_038838
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Drebrin podobný protein je protein že u lidí je kódován DBNL gen.^[5]^[6]

Interakce

Ukázalo se, že podobná drebrinu komunikovat s Cyklin-dependentní kináza 4,^[7] MAP4K1^[8] a ZAP-70.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136279 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020476 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lee CG, Morse HC, Kay BK, Kozak CA (květen 1999). „Genetické mapování osmi genů domény SH3 na sedmi myších chromozomech“. Mamm genom. 10 (4): 402–4. doi:10.1007 / s003359901011. PMID 10087302. S2CID 11371043.
^ „Entrez Gene: DBNL drebrin like“.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Ensenat D, Yao Z, Wang XS, Kori R, Zhou G, Lee SC, Tan TH (listopad 1999). „Nová adaptační bílkovina src homologie 3 obsahující HIP-55, která interaguje s hematopoetickou progenitorovou kinázou 1“. J. Biol. Chem. 274 (48): 33945–50. doi:10.1074 / jbc.274.48.33945. PMID 10567356.
^ Han J, Kori R, Shui JW, Chen YR, Yao Z, Tan TH (prosinec 2003). „Adaptér HIP-55 obsahující doménu SH3 zprostředkovává aktivaci N-terminální kinázy c-Jun v signalizaci receptoru T buněk“. J. Biol. Chem. 278 (52): 52195–202. doi:10,1074 / jbc.M305026200. PMID 14557276.

Další čtení

Gipson IK, Spurr-Michaud S, Moccia R, Zhan Q, Toribara N, Ho SB, Gargiulo AR, Hill JA (1999). „Transkripty MUC4 a MUC5B jsou převládajícími mucinovými messengerovými ribonukleovými kyselinami lidského endocervixu.“ Biol. Reprod. 60 (1): 58–64. doi:10.1095 / biolreprod60.1.58. PMID 9858486.
Larbolette O, Wollscheid B, Schweikert J, Nielsen PJ, Wienands J (1999). „SH3P7 je protein adaptéru cytoskeletu a je spojen se signální transdukcí z receptorů antigenu lymfocytů“. Mol. Buňka. Biol. 19 (2): 1539–46. doi:10.1128 / MCB.19.2.1539. PMC 116082. PMID 9891087.
Ensenat D, Yao Z, Wang XS, Kori R, Zhou G, Lee SC, Tan TH (1999). „Nový src homologie 3 doménový adaptační protein, HIP-55, který interaguje s hematopoetickou progenitorovou kinázou 1“. J. Biol. Chem. 274 (48): 33945–50. doi:10.1074 / jbc.274.48.33945. PMID 10567356.
Yamazaki H, Takahashi H, Aoki T, Shirao T (2001). "Molekulární klonování a dendritická lokalizace krysího SH3P7". Eur. J. Neurosci. 14 (6): 998–1008. doi:10.1046 / j.0953-816x.2001.01727.x. PMID 11595038. S2CID 15501009.
Chen YR, Kori R, John B, Tan TH (2001). „Štěpení zprostředkované kaspázou aktin-vázajících proteinů a proteinů obsahujících doménu SH3, cortactin, HS1 a HIP-55 během apoptózy“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 288 (4): 981–9. doi:10.1006 / bbrc.2001.5862. PMID 11689006.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (2003 ). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mise-Omata S, Montagne B, Deckert M, Wienands J, Acuto O (2003). „Savčí protein vázající aktin 1 je nezbytný pro endocytózu, ale ne pro tvorbu lamellipodií: funkční analýza interferencí RNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (3): 704–10. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02972-8. PMID 12565838.
Hou P, Estrada L, Kinley AW, Parsons JT, Vojtek AB, Gorski JL (2004). „Fgd1, Cdc42 GEF odpovědný za Faciogenital Dysplasia, přímo interaguje s cortactinem a mAbp1 za účelem modulace tvaru buňky“. Hučení. Mol. Genet. 12 (16): 1981–93. doi:10,1093 / hmg / ddg209. PMID 12913069.
Han J, Kori R, Shui JW, Chen YR, Yao Z, Tan TH (2004). „Adaptér HIP-55 obsahující doménu SH3 zprostředkovává aktivaci N-terminální kinázy c-Jun v signalizaci receptoru T buněk“. J. Biol. Chem. 278 (52): 52195–202. doi:10,1074 / jbc.M305026200. PMID 14557276.
Le Bras S, Foucault I, Foussat A, Brignone C, Acuto O, Deckert M (2004). „Nábor proteinu vázajícího aktin HIP-55 k imunologické synapse reguluje signalizaci receptoru T buněk a endocytózu“. J. Biol. Chem. 279 (15): 15550–60. doi:10,1074 / jbc.M312659200. PMID 14729663.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Chem. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Wan D, Gong Y, Qin W, Zhang P, Li J, Wei L, Zhou X, Li H, Qiu X, Zhong F, He L, Yu J, Yao G, Jiang H, Qian L, Yu Y, Shu H , Chen X, Xu H, Guo M, Pan Z, Chen Y, Ge C, Yang S, Gu J (2004). „Rozsáhlý screening transfekce cDNA na geny související s vývojem a progresí rakoviny“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (44): 15724–9. doi:10.1073 / pnas.0404089101. PMC 524842. PMID 15498874.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Denis FM, Benecke A, Di Gioia Y, Touw IP, Cayre YE, Lutz PG (2005). „PRAM-1 potencuje aktivaci JNK vyvolanou oxidem arzenitým“. J. Biol. Chem. 280 (10): 9043–8. doi:10,1074 / jbc.M413564200. PMID 15637062.
Han J, Shui JW, Zhang X, Zheng B, Han S, Tan TH (2005). „HIP-55 je důležitý pro proliferaci T-buněk, produkci cytokinů a imunitní odpovědi“. Mol. Buňka. Biol. 25 (16): 6869–78. doi:10.1128 / MCB.25.16.6869-6878.2005. PMC 1190228. PMID 16055701.
Tao WA, Wollscheid B, O'Brien R, Eng JK, Li XJ, Bodenmiller B, Watts JD, Hood L, Aebersold R (2005). „Kvantitativní analýza fosfoproteomu pomocí dendrimerové konjugační chemie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Nat. Metody. 2 (8): 591–8. doi:10.1038 / nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136279 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020476 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10087302-5] Lee CG, Morse HC, Kay BK, Kozak CA (květen 1999). „Genetické mapování osmi genů domény SH3 na sedmi myších chromozomech“. Mamm genom. 10 (4): 402–4. doi:10.1007 / s003359901011. PMID 10087302. S2CID 11371043.

[entrez-6] „Entrez Gene: DBNL drebrin like“.

[pmid17353931-7] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid10567356-8] Ensenat D, Yao Z, Wang XS, Kori R, Zhou G, Lee SC, Tan TH (listopad 1999). „Nová adaptační bílkovina src homologie 3 obsahující HIP-55, která interaguje s hematopoetickou progenitorovou kinázou 1“. J. Biol. Chem. 274 (48): 33945–50. doi:10.1074 / jbc.274.48.33945. PMID 10567356.

[pmid14557276-9] Han J, Kori R, Shui JW, Chen YR, Yao Z, Tan TH (prosinec 2003). „Adaptér HIP-55 obsahující doménu SH3 zprostředkovává aktivaci N-terminální kinázy c-Jun v signalizaci receptoru T buněk“. J. Biol. Chem. 278 (52): 52195–202. doi:10,1074 / jbc.M305026200. PMID 14557276.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]