DPP6 - DPP6

DPP6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1XFD
Identifikátory
Aliasy	DPP6, DPPX, VF2, MRD33, DPL1, dipeptidyl peptidáza jako 6
Externí ID	OMIM: 126141 MGI: 94921 HomoloGene: 22560 Genové karty: DPP6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	154,894,285 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	27,727,505 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita regulátoru draslíkového kanálu; • aktivita peptidázy serinového typu; • aktivita dipeptidyl-peptidázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • membrána; • komplex draslíkových kanálů s napětím;
Biologický proces	• lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • regulace transmembránového transportu iontů draslíku; • proteolýza;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1804
	13483
	ENSG00000130226; ENSG00000282974
	ENSMUSG00000061576
	P42658; Q8IYG9
	Q9Z218
	NM_001039350; NM_001290252; NM_001290253; NM_001936; NM_130797
	NM_001136060; NM_001198886; NM_010075; NM_207282
NP_001034439; NP_001277181; NP_001277182; NP_001927; NP_570629;
	NP_001351426; NP_001351427; NP_001351428; NP_001351429; NP_001351430; NP_001351431; NP_001277182.1; NP_570629.2; NP_001034439.1; NP_001277181.1; NP_001927.3; NP_570629.2
	NP_001129532; NP_001185815; NP_034205; NP_997165
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Dipeptidyl aminopeptidáza podobný protein 6 je protein že u lidí je kódován DPP6 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje jednoprůchodový membránový protein typu II, který je členem rodiny S9B v klanovém SC serinové proteázy. Tento protein není detekovatelný proteáza aktivita, nejpravděpodobněji kvůli nepřítomnosti konzervovaného serinového zbytku normálně přítomného v katalytické doméně serinových proteáz. Váže se však konkrétně napěťově řízené draslíkové kanály a mění jejich expresi a biofyzikální vlastnosti. Alternativní transkripční varianty sestřihu, různé kódování izoformy, byly charakterizovány.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000282974 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130226, ENSG00000282974 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061576 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wada K, Yokotani N, Hunter C, Doi K, Wenthold RJ, Shimasaki S (únor 1992). „Diferenciální exprese dvou odlišných forem mRNA kódujících členy rodiny dipeptidylaminopeptidázy“. Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (1): 197–201. doi:10.1073 / pnas.89.1.197. PMC 48203. PMID 1729689.
^ ^A ^b „Entrezův gen: DPP6 dipeptidyl-peptidáza 6“.

Další čtení

Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD a kol. (1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
Yokotani N, Doi K, Wenthold RJ, Wada K (1993). „Nezachovávání katalytického zbytku v proteinu souvisejícím s dipeptidylaminopeptidázou IV kódovaném genem na lidském chromozomu 7“. Hučení. Mol. Genet. 2 (7): 1037–9. doi:10,1093 / hmg / 2,7.1037. PMID 8103397.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Sanger Center, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (1999). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Genome Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
Kin Y, Misumi Y, Ikehara Y (2001). „Biosyntéza a charakterizace mozkového specifického membránového proteinu DPPX, proteinu souvisejícího s dipeptidyl peptidázou IV“. J. Biochem. 129 (2): 289–95. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a002856. PMID 11173531.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Nadal MS, Ozaita A, Amarillo Y a kol. (2003). „Protein DPPX podobný dipeptidyl aminopeptidáze podobný DP26 je kritickou složkou neuronálních kanálů K + typu“. Neuron. 37 (3): 449–61. doi:10.1016 / S0896-6273 (02) 01185-6. PMID 12575952. S2CID 11494299.
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA a kol. (2003). „Sekvence DNA lidského chromozomu 7“. Příroda. 424 (6945): 157–64. doi:10.1038 / nature01782. PMID 12853948.
Schmitt-Ulms G, Hansen K, Liu J a kol. (2005). „Časově řízené zesítění transkardiální perfúze pro studium proteinových interakcí ve složitých tkáních“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 724–31. doi:10.1038 / nbt969. PMID 15146195. S2CID 36630738.
Strop P, Bankovich AJ, Hansen KC a kol. (2004). „Struktura lidského proteinu DPPX interagujícího s draslíkovým kanálem, člen rodiny dipeptidylaminopeptidázy“. J. Mol. Biol. 343 (4): 1055–65. doi:10.1016 / j.jmb.2004.09.003. PMID 15476821.
Zagha E, Ozaita A, Chang SY a kol. (2005). „DPP10 moduluje draselné kanály typu A zprostředkované Kv4“. J. Biol. Chem. 280 (19): 18853–61. doi:10,1074 / jbc.M410613200. PMID 15671030.
Radicke S, Cotella D, Graf EM a kol. (2005). "Exprese a funkce dipeptidyl-aminopeptidázového proteinu 6 jako domnělé beta-podjednotky lidského srdečního přechodného vnějšího proudu kódovaného Kv4.3". J. Physiol. 565 (Pt 3): 751–6. doi:10.1113 / jphysiol.2005.087312. PMC 1464568. PMID 15890703.
Ren X, Hayashi Y, Yoshimura N, Takimoto K (2005). „Transmembránová interakce zprostředkovává tvorbu komplexu mezi homology peptidázy a kanály Kv4“. Mol. Buňka. Neurosci. 29 (2): 320–32. doi:10.1016 / j.mcn.2005.02.003. PMID 15911355. S2CID 34065803.
Jerng HH, Kunjilwar K, Pfaffinger PJ (2006). „Multiproteinová sestava Kv4.2, KChIP3 a DPP10 produkuje komplexy ternárních kanálů s vlastnostmi podobnými ISA“. J. Physiol. 568 (Pt 3): 767–88. doi:10.1113 / jphysiol.2005.087858. PMC 1464192. PMID 16123112.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Nadal MS, Amarillo Y, Vega-Saenz de Miera E, Rudy B (2006). Msgstr "Diferenciální charakterizace tří alternativních sestřihových izoforem DPPX". Brain Res. 1094 (1): 1–12. doi:10.1016 / j.brainres.2006.03.106. PMID 16764835. S2CID 33513405.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000282974 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130226, ENSG00000282974 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061576 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1729689-5] Wada K, Yokotani N, Hunter C, Doi K, Wenthold RJ, Shimasaki S (únor 1992). „Diferenciální exprese dvou odlišných forem mRNA kódujících členy rodiny dipeptidylaminopeptidázy“. Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (1): 197–201. doi:10.1073 / pnas.89.1.197. PMC 48203. PMID 1729689.

[entrez-6] A ^b „Entrezův gen: DPP6 dipeptidyl-peptidáza 6“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]