DNADynamo - DNADynamo
| Vývojáři | BlueTractorSoftware Ltd. |
|---|---|
| Operační systém | Mac OS X, Windows, Linux |
| Plošina | Jáva |
| Typ | Bioinformatika |
| Licence | komerční |
| webová stránka | bluetractorsoftware.co.uk |
DNADynamo je komerční softwarový balíček pro analýzu sekvenční DNA vyrobený společností Blue Tractor Software Ltd [1] který běží dál Microsoft Windows, Mac OS X a Linux [2]Používá se molekulární biologové [3] analyzovat sekvence DNA a proteinů. Demo zdarma je k dispozici na webových stránkách vývojářů softwaru.
Funkce
DNADynamo je univerzální balíček pro analýzu sekvencí DNA a proteinů, který může vykonávat většinu funkcí požadovaných standardní laboratoří pro molekulární biologii
- Prohlížení, úpravy a anotace DNA a sekvence proteinů
- Contig montáž a chromatogram editace včetně srovnání s referenční sekvencí k identifikaci mutací
- Globální Sekvenční zarovnání s ClustalW a SVAL a úpravy.
- Vyberte a přetáhněte Sekvenční zarovnání úpravy pro ručně vyrobené dna vs proteinové zarovnání
- Omezení analýza - pro prohlížení stránek s omezením v tabulkách a na lineárních a kruhových mapách.
- A Subklonování nástroj pro sestavování konstrukcí pomocí omezovacích stránek nebo Sestava Gibson,
- Agarózový gel simulace.
- Online vyhledávání v databázi - Prohledejte veřejné databáze v NCBI, jako je Genbank a UniProt.
- Online VÝBUCH vyhledávání.
- Analýza proteinů včetně odhadu molekulové hmotnosti, extinkčního koeficientu a pI.
- PCR Design Primeru, včetně rozhraní k Primeru3
- Prohlížení 3D struktury přes rozhraní do Jmol
Dějiny
DNADynamo byl vyvinut od roku 2004 společností BlueTractorSoftware Ltd, společností zabývající se vývojem softwaru se sídlem v severním Walesu ve Velké Británii [4]