DEFA5 - DEFA5

DEFA5
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1ZMP, 2LXZ, 2MIT, 3I5W, 4E82, 4E83, 4E86, 4RBW, 4RBX, 5 CUM, 5CUJ, 5CUI
Identifikátory
Aliasy	DEFA5DEF5, HD-5, defensin alfa 5
Externí ID	OMIM: 600472 HomoloGene: 128604 Genové karty: DEFA5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	7,056,739 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• Golgiho lumen; • lumen sekreční granule; • transportní váček; • cytoplazmatický váček; • extracelulární oblast; • extracelulární;
Biologický proces	• obranná reakce; • obranná reakce na bakterii; • obranná reakce na houby; • antimikrobiální humorální odpověď; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem; • vrozený imunitní systém; • pozitivní regulace propustnosti membrány; • zabíjení buněk jiného organismu; • vrozená imunitní odpověď na sliznici; • antibakteriální humorální odpověď; • obranná odpověď na gramnegativní bakterii; • obranná reakce na grampozitivní bakterii; • narušení membrány v jiném organismu; • buněčná odpověď na lipopolysacharid;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1670
	n / a
	ENSG00000164816; ENSG00000285251
	n / a
	Q01523
	n / a
	NM_021010
	n / a
	NP_066290
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Defensin, alfa 5 (DEFA5) také známý jako lidský alfa defensin 5 (HD5) je člověk protein který je kódován DEFA5 gen.^[3]^[4] DEFA5 je vyjádřen v Panethovy buňky z ileum.^[5]

Defensiny jsou rodinou mikrobicidních a cytotoxických peptidů, o nichž se předpokládá, že se podílejí na obraně hostitele. Jsou hojně přítomny v granulích neutrofilů a nacházejí se také v epitelích povrchů sliznic, jako jsou povrchy střev, dýchacích cest, močových cest a pochvy. Členové rodiny defensinu jsou velmi podobní proteinové sekvenci a vyznačují se konzervovaným cysteinovým motivem. Několik lidí alfa defensin geny se zdají být shlukovány na chromozomu 8. Protein kódovaný tímto genem, defensin, alfa 5, je vysoce exprimován v sekrečních granulích Panethových buněk ilea.^[3]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000285251 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164816, ENSG00000285251 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DEFA5 defensin, alfa 5, Paneth cell-specific“.
^ Jones DE, Bevins CL (leden 1993). „Defensin-6 mRNA v lidských Panethových buňkách: důsledky pro antimikrobiální peptidy při obraně lidského střeva hostitelem“. FEBS Lett. 315 (2): 187–92. doi:10.1016/0014-5793(93)81160-2. PMID 8417977. S2CID 45099115.
^ Zhao C, Wang I, Lehrer RI (24. listopadu 1996). „Rozšířená exprese beta-defensinu hBD-1 v lidských sekrečních žlázách a epiteliálních buňkách“. FEBS Lett. 396 (2–3): 319–22. doi:10.1016/0014-5793(96)01123-4. PMID 8915011. S2CID 22367037.

Další čtení

Mallow EB, Harris A, Salzman N a kol. (1996). "Lidské enterické defensiny. Genová struktura a vývojová exprese". J. Biol. Chem. 271 (8): 4038–45. doi:10.1074 / jbc.271.8.4038. PMID 8626737.
Bevins CL, Jones DE, Dutra A a kol. (1996). "Lidské geny pro enterický defensin: poloha chromozomální mapy a model možných evolučních vztahů". Genomika. 31 (1): 95–106. doi:10.1006 / geno.1996.0014. PMID 8808285.
Porter EM, Liu L, Oren A a kol. (1997). "Lokalizace lidského střevního defensinu 5 v granulích Panethových buněk". Infikovat. Immun. 65 (6): 2389–95. doi:10.1128 / IAI.65.6.2389-2395.1997. PMC 175331. PMID 9169779.
Quayle AJ, Porter EM, Nussbaum AA a kol. (1998). "Genová exprese, imunolokalizace a sekrece lidského defensinu-5 v reprodukčním traktu lidské ženy". Dopoledne. J. Pathol. 152 (5): 1247–58. PMC 1858596. PMID 9588893.
Ghosh D, Porter E, Shen B a kol. (2002). „Trypsin z Panethových buněk je zpracovatelský enzym pro lidský defensin-5“. Nat. Immunol. 3 (6): 583–90. doi:10.1038 / ni797. PMID 12021776. S2CID 22022089.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Salzman NH, Ghosh D, Huttner KM a kol. (2003). "Ochrana před enterickou salmonelózou u transgenních myší exprimujících lidský intestinální defensin". Příroda. 422 (6931): 522–6. doi:10.1038 / nature01520. PMID 12660734. S2CID 1096692.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Szyk A, Wu Z, Tucker K a kol. (2006). „Krystalové struktury lidských alfa-defensinů HNP4, HD5 a HD6“. Protein Sci. 15 (12): 2749–60. doi:10.1110 / ps.062336606. PMC 2242434. PMID 17088326.
Wu Z, Ericksen B, Tucker K a kol. (2004). "Syntéza a charakterizace lidských alfa-defensinů 4-6". J Pept Res. 64 (3): 118–25. doi:10.1111 / j.1399-3011.2004.00179.x. PMID 15317502.
de Leeuw E, Burks SR, Li X a kol. (2007). "Strukturně závislé funkční vlastnosti lidského defensinu 5". FEBS Lett. 581 (3): 515–20. doi:10.1016 / j.febslet.2006.12.036. PMC 1832120. PMID 17250830.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000285251 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164816, ENSG00000285251 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-3] A ^b „Entrez Gene: DEFA5 defensin, alfa 5, Paneth cell-specific“.

[pmid8417977-4] Jones DE, Bevins CL (leden 1993). „Defensin-6 mRNA v lidských Panethových buňkách: důsledky pro antimikrobiální peptidy při obraně lidského střeva hostitelem“. FEBS Lett. 315 (2): 187–92. doi:10.1016/0014-5793(93)81160-2. PMID 8417977. S2CID 45099115.

[pmid8915011-5] Zhao C, Wang I, Lehrer RI (24. listopadu 1996). „Rozšířená exprese beta-defensinu hBD-1 v lidských sekrečních žlázách a epiteliálních buňkách“. FEBS Lett. 396 (2–3): 319–22. doi:10.1016/0014-5793(96)01123-4. PMID 8915011. S2CID 22367037.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]