Oddělení výpočetní biologie - Computational Biology Department - Wikipedia

Oddělení výpočetní biologie
Logo oddělení výpočetní biologie.jpg
TypSoukromé
Založeno2007 (jako Lane Center for Computational Biology)
Umístění
Pittsburgh, Pensylvánie
KampusMěstský
webová stránkahttp://www.cbd.cmu.edu/

The Výpočetní biologie oddělení (CBD) je divize uvnitř School of Computer Science na Univerzita Carnegie Mellon v Pittsburgh, Pensylvánie, Spojené státy. Nachází se v Gates-Hillmanově centru.

Založena v roce 2007 Robert F. Murphy jako Lane Center for Computational Biology s financováním od Raymond J. Lane a Stephanie Lane,[1] CBD se stala katedrou na School of Computer Science v roce 2016.[2]

Fakulta a studenti CBD provádějí výzkum v genomika,[3][4] biologie systémů,[5] a biologické zobrazování.[6][7] Jeho fakulta sloužila jako prezident Národní vědecká nadace,[8] prezident Mezinárodní společnosti pro moderní cytometrii,[9] a jako člen Národní institut zdraví Rada rad;[10] vyhráli Cenu Overton,[11] the Okawa Award,[12] A United States Air Force Cena mladého vyšetřovatele,[13] a a Cena prezidenta Young Investigator Award.[14]

V rámci iniciativy HHMI-NIBIB Interfaces Initiative[15] CBD obdržela financování od Howard Hughes Medical Institute[16] a Národní institut pro biomedicínské zobrazování a bioinženýrství (NIBIB)[17] vyvinout interdisciplinární Ph.D. program ve výpočetní biologii s University of Pittsburgh, která byla založena jako Joint CMU-Pitt Ph.D. Program ve výpočetní biologii v roce 2005.[18] Tento program v současné době dostává podporu školení prostřednictvím Grantu na školení T32 od National Institutes of Health.[19]

Pozoruhodná fakulta[20]

Pozoruhodné schůzky hostované

  • RECOMB 2014[21]
  • Bioinformatická konference Great Lakes 2013 (společně s University of Pittsburgh)[22]
  • Automatizovaná analýza osobního genomu (APGA) 2013[23]
  • Bioimage Informatics 2010[24]

Studijní programy

Reference

  1. ^ (CMU), Carnegie Mellon University. „20. září: Carnegie Mellon zakládá centrum Ray a Stephanie Lane pro výpočetní biologii - Carnegie Mellon University“. www.cmu.edu. Citováno 2016-03-14.
  2. ^ (CMU), Carnegie Mellon University. „22. září: Počítačová biologie se stala katedrou počítačové informatiky Carnegie Mellon - Carnegie Mellon University“. www.cmu.edu. Citováno 2016-03-14.
  3. ^ „Výpočetní metoda dramaticky zrychluje odhady genové exprese, zpráva CMU, UMD výzkumníků | Carnegie Mellon School of Computer Science“. www.cs.cmu.edu. Citováno 2016-03-15.
  4. ^ Patro, Rob; Mount, Stephen M .; Kingsford, Carl (01.05.2014). „Sailfish umožňuje kvantifikaci izoformy bez zarovnání ze čtení RNA-sek pomocí lehkých algoritmů“. Přírodní biotechnologie. 32 (5): 462–464. arXiv:1308.3700. doi:10.1038 / nbt.2862. ISSN  1087-0156. PMC  4077321. PMID  24752080.
  5. ^ Kanfi, Yariv; Naiman, Shoshana; Amir, Gail; Peshti, Victoria; Zinman, Guy; Nahum, Liat; Bar-Joseph, Ziv; Cohen, Haim Y. (březen 2012). „Sirtuin SIRT6 reguluje životnost u mužských myší“. Příroda. 483 (7388): 218–221. Bibcode:2012Natur.483..218K. doi:10.1038 / příroda10815. PMID  22367546.
  6. ^ Naik, Armaghan W .; Kangas, Joshua D .; Sullivan, Devin P .; Murphy, Robert F. (02.02.2016). „Aktivní experimenty řízené strojovým učením k určení složených účinků na proteinové vzorce. eLife. 5: e10047. doi:10,7554 / eLife.10047. PMC  4798950. PMID  26840049.
  7. ^ „Roboticky řízený systém vědců by mohl snížit náklady na objevování interakcí s drogami a cíli | Carnegie Mellon School of Computer Science“. www.cs.cmu.edu. Citováno 2016-03-15.
  8. ^ "Biografie Subra Suresh". www.nsf.gov. Citováno 2016-03-15.
  9. ^ „Minulí prezidenti - ISAC-NET“. isac-net.org. Archivovány od originál dne 06.03.2016. Citováno 2016-03-29.
  10. ^ „Murphy jmenován do rady NIH | Carnegie Mellon School of Computer Science“. www.cs.cmu.edu. Citováno 2016-03-29.
  11. ^ „2012 Overton Prize: Ziv Bar-Joseph“. www.iscb.org. Citováno 2016-03-15.
  12. ^ „Carbonell vyhrává cenu Okawa“. www.scs.cmu.edu. Citováno 2016-03-15.
  13. ^ „Letectvo investuje více než 14 milionů USD do výzkumného programu Young Investigators 2010“. www.wpafb.af.mil. Archivovány od originál dne 2016-04-13. Citováno 2016-03-15.
  14. ^ „Hledání cen NSF: Cena # 8351364 - Cena prezidenta Young Investigator Award“. www.nsf.gov. Citováno 2016-03-29.
  15. ^ „Iniciativa rozhraní HHMI-NIBIB“. HHMI.org. Archivovány od originál dne 12. 3. 2016. Citováno 2016-03-14.
  16. ^ „Institute News: HHMI Awards 10 milionů dolarů za interdisciplinární postgraduální vzdělávání“. HHMI.org. Citováno 2016-03-14.
  17. ^ „NIBIB investuje do interdisciplinárního školení postgraduálního výzkumu“. www.nibib.nih.gov. Citováno 2016-03-14.
  18. ^ „Tisková zpráva Carnegie Mellon: 6. září 2005“. www.cmu.edu. Archivovány od originál 9. dubna 2016. Citováno 2016-03-14.
  19. ^ „Informace o projektu - NIH RePORTER - NIH Research Portfolio Online Reporting Tools Výdaje a výsledky“. projectreporter.nih.gov. Citováno 2016-03-15.
  20. ^ University, Carnegie Mellon. „Hlasovací fakulta - katedra výpočetní biologie - Carnegie Mellon University“. cbd.cmu.edu. Archivovány od originál dne 2015-03-08. Citováno 2016-03-14.
  21. ^ „RECOMB 2014 - 2. – 5. Dubna, Pittsburgh, Pensylvánie“. murphylab.web.cmu.edu. Citováno 2016-03-14.
  22. ^ "DOMOV". www.iscb.org. Citováno 2016-03-14.
  23. ^ University, Carnegie Mellon. „Automatizovaná analýza osobního genomu pro klinické poradce: Výzvy a řešení - Oddělení výpočetní biologie - Carnegie Mellon University“. cbd.cmu.edu. Archivovány od originál dne 06.09.2015. Citováno 2016-03-29.
  24. ^ University, Carnegie Mellon. „Bioimage Informatics 2010-Computational Biology Department - Carnegie Mellon University“. cbd.cmu.edu. Archivovány od originál dne 2015-03-30. Citováno 2016-03-14.
  25. ^ „Společný doktorský program CMU-Pitt ve výpočetní biologii (CPCB)“. Citováno 2018-03-06.
  26. ^ University, Carnegie Mellon. „M.S. in Computational Biology - Carnegie Mellon University“. www.cmu.edu. Citováno 2016-03-14.
  27. ^ „Biotechnologie Innovation and Computation at Carnegie Mellon University“. bic.cs.cmu.edu. Archivovány od originál dne 09.03.2016. Citováno 2016-03-14.
  28. ^ "B.S. ve výpočetní biologii | Oddělení výpočetní biologie". Oddělení výpočetní biologie | Univerzita Carnegie Mellon. Citováno 2017-02-07.
  29. ^ University, Carnegie Mellon. „Minor in Computational Biology-Computational Biology Department - Carnegie Mellon University“. cbd.cmu.edu. Citováno 2016-03-14.