Porovnání služeb sekvenování DNA - Comparison of DNA sequencing services - Wikipedia
Tato stránka uvádí různé služby sekvenování DNA. Lze rozlišit 2 hlavní typy:
- Sekvenování celého genomu (WGS) služby
- Jednonukleotidový polymorfismus (SNP) sekvenční služby
Sekvenování celého exomu je prostředníkem mezi těmito dvěma typy, kde je sekvenováno velké množství genů, ale pouze ty, které produkují smysluplné rozdíly důležité pro praktické účely, což je pouze 1% celého genomu.
Oba umožňují lidem detekovat přítomnost dědičných onemocnění (a / nebo jiných nedokonalostí) v jejich DNA a (pokud se používá WGS), dokonce umožňuje lidem znát specifika jejich dědičných chorob (a / nebo jiných nedokonalostí). Tato specifika mohou být důležitá, protože v mnoha případech onemocnění nezpůsobuje jediný gen, ale spíše kombinace genů.[1] V některých případech není znám ani přesný gen, ale pouze gen přibližná poloha kde nedokonalý nukleotidy jsou umístěny je známo.
Služby sekvenování celého genomu
Společnost | Požadovaný typ vzorku | Způsob doručení společnosti [2] | Umístění společnosti | Dodání výsledků | Poznámky |
---|---|---|---|---|---|
Společnost pro genetické testy | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[3] | ? | ? |
ACGT, Inc. | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[4] | ? | ? |
Admera Health LLC | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[5] | ? | ? |
Affiliate Genetics, Inc. | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[6] | ? | ? |
Applied Biological Materials Inc. | krevní vzorek | zasláno poštou | Kanada[7] | ? | ? |
CD Genomics | krevní vzorek | zasláno poštou | USA | ? | ? |
CEN4GEN Institut pro genomiku a molekulární diagnostiku | krevní vzorek | zasláno poštou | Kanada[8] | ? | ? |
ChunLab, Inc. | krevní vzorek | zasláno poštou | Korea, USA[9] | ? | ? |
Core Life Sciences, Inc. | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[10] | ? | ? |
Kompletní genomika | vzorek krve, zmrzlá tkáň, buněčné linie nebo sliny[11] | poslat poštou | USA | ? | ? |
Klinické mikročipové jádro | krevní vzorek | poslat poštou | USA | ? | ? |
DNA Link, Inc. | krevní vzorek | zasláno poštou | Korea, USA[12] | ? | ? |
Plná diagnostika | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[13] | ? | ? |
Full Genomes Corporation | vzorek slin | zaslat poštou | USA[14] | ? | www.fullgenomes.com/news/ |
GENEWIZ, Inc. | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[15] | ? | ? |
Gene by Gene | vzorek krve (3 až 5 ccm) | poslat poštou | USA | uloženy na serveru FTP po dobu 30–60 dnů | ? |
Genomix4Life | krevní vzorek | zasláno poštou | Itálie[16] | ? | ? |
Genomika Personalizované zdraví | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[17] | ? | ? |
HIB Laboratoř Genomics Services | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[18] | ? | ? |
Illumina | vzorek krve (4 až 8 ml lahvička)[19] | zasláno poštou | USA[20] | ? | Data (330 GB) se odesílají zpět na disk ve formátu BAM, VCF nebo gVCF; doba zpracování = 8 týdnů[21] |
Kinghorn Center for Clinical Genomics | krevní vzorek | zasláno poštou | Austrálie[22] | ? | ? |
Makrogen | krevní vzorek | zasláno poštou | Korea, Japonsko, USA, Nizozemsko[23] | ? | ? |
Meporty | vzorek slin | zasláno poštou | USA [24] | ? | ? |
myGenomics, LLC | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[25] | ? | ? |
Novogene Corporation | krevní vzorek | zasláno poštou | USA, Velká Británie, Japonsko, Čína[26] | ? | |
Rychlá biologie | krevní vzorek | zaslat poštou | USA | ? | Doba obratu = 4 až 6 týdnů[27] |
Sequenom | krevní vzorek | kresleno na blízkém místě sekvence | USA | ? | Pouze pro ještě nenarozené pacientky (test u matky) |
SBMRI Základní zařízení analytické genomiky[28] | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[29] | ? | ? |
Sequentia Biotech SL | krevní vzorek | zasláno poštou | Španělsko[30] | ? | ? |
SGI-DNA | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[31] | ? | ? |
Theragen Etex Bio | krevní vzorek | zasláno poštou | Korea[32] | ? | ? |
UM Laboratoř bioanalytické služby | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[33] | ? | ? |
WIM Základní zařízení pro genomiku | krevní vzorek | zasláno poštou | USA[34] | ? | ? |
WUSTL Genome Technology Access Center | krevní vzorek | zasláno poštou | Kanada[35] | ? | ? |
Xcelris Labs Ltd. | krevní vzorek | zasláno poštou | Indie[36] | ? | ? |
Sekvenční služby SNP
Společnost | Požadovaný typ vzorku | Způsob doručení společnosti [37] | Umístění společnosti | Dodání výsledků | Poznámky |
---|---|---|---|---|---|
23andMe | sliny | poslat poštou[38] | USA | ? | ? |
Affymetrix | ? | zaslat poštou | Vlastní cena | USA, Velká Británie, Japonsko, Singapur, Čína[39] | Minimálně 88 vzorků k odeslání[40] |
Full Genomes Corporation | krevní vzorek | zaslat poštou | USA | ? | ? |
ACGT, Inc. | ? | zaslat poštou | USA[41] | ? | ? |
Avance Biosciences Inc. | ? | poslat poštou | USA[42] | ? | ? |
AKESOgen, Inc. | ? | poslat poštou | USA[43] | ? | ? |
BCH Základní zařízení pro molekulární genomiku | ? | zaslat poštou | USA[44] | ? | ? |
CD Genomics | ? | poslat poštou | USA | ? | ? |
Kruh DNA | ? | zaslat poštou | Hongkong[45] | ? | ? |
DMRI | ? | zaslat poštou | USA[46] | ? | ? |
DNA Link, Inc. | ? | zaslat poštou | Korea[47] | ? | ? |
EpigenDx | ? | poslat poštou | USA[48] | ? | ? |
Genemarkers | ? | zaslat poštou | USA[49] | ? | ? |
GUMC GESR | ? | poslat poštou | USA[50] | ? | ? |
GSM Transgenics and Genetic Constructs Shared Resource | ? | zaslat poštou | USA | ? | ? |
GenoTyping Center of America | ? | zaslat poštou | USA[51] | ? | ? |
Hadassah BrainLabs | ? | poslat poštou | Izrael[52] | ? | ? |
HD biologické vědy | ? | zaslat poštou | Čína[53] | ? | ? |
Laragen, Inc. | ? | poslat poštou | USA[54] | ? | ? |
MGH PNGUCL | ? | poslat poštou | USA[55] | ? | ? |
Nehir Biyoteknoloji | ? | poslat poštou | krocan[56] | ? | ? |
Novatein Biosciences | ? | poslat poštou | USA[57] | ? | ? |
Novogenie | ? | poslat poštou | Rakousko[58] | ? | ? |
Omega Bio-Tek | ? | zaslat poštou | USA[59] | ? | ? |
Prenetika | vzorek slin | zaslat poštou | Hongkong[60] | ? | ? |
Reniguard Life Sciences, Inc. | ? | zaslat poštou | USA[61] | ? | ? |
Rochen Pharma Co., Ltd. | ? | poslat poštou | Čína[62] | ? | ? |
RPCI Genomics Shared Resource | ? | poslat poštou | USA[63] | ? | ? |
UA Genetické jádro | ? | zaslat poštou | USA[64] | ? | ? |
UMASS Základní laboratoř biomarkerů | ? | zaslat poštou | USA[65] | ? | ? |
WUSTL Genome Technology Access Center | ? | zasláno poštou | Kanada[66] | ? | ? |
Woble Helsinki Oy | ? | poslat poštou | Finsko[67] | ? | ? |
Xcelris Labs Ltd. | ? | poslat poštou | Indie[68] | ? | ? |
Reference
- ^ Stránka 25: několik genů často zodpovědných za stejné onemocnění
- ^ Možné metody jsou: jít do sídla společnosti (darování na místě) nebo nechat odebrat krev lékařem a poslat ji poštou. Pamatujte, že když je odeslán vzorek krve, nemusí být chlazen; stačí tedy běžné poštovní balení
- ^ Společnost pro genetické testy
- ^ Umístění ACGT
- ^ Umístění Admera Health
- ^ Přidružené genetické umístění
- ^ Umístění ABM
- ^ Poloha Cen4gen
- ^ Poloha Chunlab
- ^ Umístění CLS
- ^ Kompletní typ vzorku genomiky
- ^ Umístění DNA Link
- ^ Umístění Fulgent Diagnostics
- ^ Úplné umístění genomů
- ^ Poloha Genewiz
- ^ Poloha Genomix4life
- ^ Umístění GPH
- ^ Umístění laboratoře HIB Genomics Services
- ^ potřebné množství krve
- ^ Poloha města Illumina
- ^ Doba obratu
- ^ Umístění KCCG
- ^ „Místa makrogenu“. Archivovány od originál dne 2016-06-20. Citováno 2016-07-04.
- ^ „Domovská stránka Meports“. Archivovány od originál dne 2020-06-29. Citováno 2020-07-26.
- ^ „Umístění MyGenomics“. Archivovány od originál dne 2016-08-18. Citováno 2016-07-04.
- ^ Místa společnosti Novogene Corporation
- ^ Rychlá doba obratu biologie
- ^ Web SBMRI AGCF
- ^ „Umístění SBMRI AGCF“. Archivovány od originál dne 2016-08-17. Citováno 2016-07-04.
- ^ Poloha společnosti Sequentia Biotech
- ^ Umístění SGI-DNA
- ^ Umístění Theragen Etex Bio
- ^ „UM BioAnalytical Service Laboratory location“. Archivovány od originál dne 2016-08-16. Citováno 2016-07-04.
- ^ Umístění základního zařízení WIM Genomics
- ^ Umístění WUSTL GTAC
- ^ Umístění Xcelris Labs
- ^ Možné metody jsou: jít do sídla společnosti (dar na místě), nebo nechat odebrat krev lékařem a poslat ji poštou. Pamatujte, že když je odeslán vzorek krve, nemusí být chlazen; stačí tedy běžné poštovní balení
- ^ Způsob doručení do 23anMe
- ^ Affymetrix umístění
- ^ Služby Affymetrix SNP
- ^ Umístění ACGT
- ^ Umístění společnosti Avance Biosciences Inc.
- ^ Poloha AKESOgen Archivováno 2016-07-04 na Wayback Machine
- ^ Umístění MGCF
- ^ https://circledna.com/about-us
- ^ Umístění DMRI
- ^ Umístění DNA Link
- ^ Umístění EpigenDx Archivováno 2016-07-18 na Wayback Machine
- ^ Umístění značek
- ^ Umístění GUMC GESR
- ^ Umístění centra GenoTyping Center of America
- ^ Poloha města Hadassah Brainlabs
- ^ Umístění HD Biosciences Archivováno 19. 7. 2016 na Wayback Machine
- ^ Poloha Laragenu
- ^ Umístění PNGUCL
- ^ Poloha Nehir Biyoteknoloji
- ^ Umístění společnosti Novatein Biosciences
- ^ Poloha Novogenia
- ^ Poloha Omega Bio-Tek
- ^ https://www.scmp.com/business/companies/article/2174393/prenetics-first-hong-kong-firm-take-genetic-test-kit-cancer-risk
- ^ Poloha Reniguard
- ^ „Rochen Pharma location“. Archivovány od originál dne 10. 9. 2015. Citováno 2016-07-04.
- ^ Umístění RPCI
- ^ Umístění UA GC
- ^ UMASS BCL umístění
- ^ Umístění WUSTL GTAC
- ^ Poloha Wobble Helsinki Oy
- ^ Umístění Xcelris Labs