Zavázaný krok - Committed step
v enzymologie, odhodlaný krok (také známý jako První odhodlaný krok) je efektivní nevratný enzymatická reakce který se vyskytuje v bodě větvení během biosyntézy některých molekuly.[1][2]Jak název napovídá, po tomto kroku jsou molekuly „oddány“ cesta a nakonec skončí v konečném produktu cesty. První spáchaný krok by neměl být zaměňován s krok určující rychlost, což je nejpomalejší krok v reakci nebo cestě. Někdy se však stává, že první potvrzený krok je ve skutečnosti také krokem určujícím rychlost.[1]
Nařízení
Metabolické dráhy vyžadují přísnou regulaci, aby se správné sloučeniny vyráběly ve správném množství. První potvrzený krok je často regulován procesy, jako jsou inhibice zpětné vazby a aktivace. Taková regulace tuto cestu zajišťuje meziprodukty nehromadí se, což je situace, která může být pro buňku nehospodárná nebo dokonce škodlivá.
Příklady enzymů, které katalyzují první spáchané kroky metabolických drah
- Fosfofruktokináza 1 katalyzuje první spáchaný krok glykolýza.[3]
- LpxC katalyzuje první spáchaný krok lipid A biosyntéza.[4]
- 8-amino-7-oxononanoát syntáza katalyzuje první spáchaný krok v závodě biotin syntéza.[5]
- MurA katalyzuje první spáchaný krok peptidoglykan biosyntéza.[6]
- Aspartát-transkarbamoyláza katalyzuje spáchaný krok v pyrimidin biosyntetická cesta v E-coli.[2]
- 3-deoxy-D-arabinóza-heptulsonát 7-fosfát syntáza katalyzuje první spáchaný krok shikimální dráhy odpovědné za syntézu aromatických aminokyselin tyrosinu, tryptofanu a fenylalaninu v rostlinách, bakteriích, houbách a některých nižších eukaryotech.
Jiná použití
Termín byl také aplikován na další procesy, které zahrnují řadu kroků. Například vazba vajíčka a spermií lze považovat za první spáchaný krok metazoan oplodnění.[7]
Viz také
Reference
- ^ A b Bhagavan, N. V (2002). Lékařská biochemie. San Diego: Harcourt / Academic Press. ISBN 0-12-095440-0.
- ^ A b Berg, Jeremy M .; Tymoczko, John L .; Stryer, Lubert (2002). Biochemie (5. vydání). W. H. Freeman and Company. p.447. ISBN 0-7167-3051-0.
- ^ „Regulace fosfofruktokinázy“. Wiley Essential Biochemistry. Citováno 17. února 2010.
- ^ Raetz C, Whitfield C (2002). "Lipopolysacharidové endotoxiny". Annu Rev Biochem. 71: 635–700. doi:10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135414. PMC 2569852. PMID 12045108.
- ^ Pinon V, Ravanel S, Douce R, Alban C (2005). „Syntéza biotinu v rostlinách. První potvrzený krok dráhy je katalyzován syntázou cytosolické kyseliny 7-keto-8-aminopelargonové“. Fyziologie rostlin. 139 (4): 1666–76. doi:10.1104 / str. 105.070144. PMC 1310550. PMID 16299174.
- ^ Brown ED, Vivas EI, Walsh CT, Kolter R (červenec 1995). „MurA (MurZ), enzym, který katalyzuje první krok v biosyntéze peptidoglykanů, je u Escherichia coli nezbytný“. J. Bacteriol. 177 (14): 4194–7. doi:10.1128 / jb.177.14.4194-4197.1995. PMC 177162. PMID 7608103.
- ^ Dell A, Chalabi S, Easton RL a kol. (Prosinec 2003). „Myší a lidská zona pellucida 3 odvozená z myších vajec exprimují stejné O-glykany“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (26): 15631–6. doi:10.1073 / pnas.2635507100. PMC 307619. PMID 14673092.
externí odkazy
- Nařízení o glykolýze na Cliffsnotes.com