Koagulační faktor XIII, polypeptid A1 - Coagulation factor XIII, A1 polypeptide - Wikipedia

F13A1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1EVU, 1EX0, 1F13, 1FIE, 1 GTG, 1GGU, 1GGY, 1QRK, 4KTY
Identifikátory
Aliasy	F13A1, F13A, řetězec koagulačního faktoru XIII A.
Externí ID	OMIM: 134570 MGI: 1921395 HomoloGene: 20077 Genové karty: F13A1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	6,321,013 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	37,050,244 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita protein-glutamin gama-glutamyltransferáza; • aktivita transferázy, přenos acylových skupin; • vazba kovových iontů; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • lumen destiček alfa granule; • krevní částice; • extracelulární oblast; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• zesíťování peptidů; • srážení krve, tvorba fibrinové sraženiny; • degranulace krevních destiček; • hemostáza; • srážení krve; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2162
	74145
	ENSG00000124491
	ENSMUSG00000039109
	P00488
	Q8BH61
	NM_000129
	NM_001166391; NM_028784
	NP_000120
	NP_001159863; NP_083060
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Řetězec koagulačního faktoru XIII je protein že u lidí je kódován F13A1 gen.

Funkce

Tento gen kóduje podjednotku koagulačního faktoru XIII A. Koagulační faktor XIII je posledním zymogenem, který se aktivuje v kaskádě srážení krve. Plazmový faktor XIII je heterotetramer složený ze 2 podjednotek A a 2 podjednotek B. Podjednotky A mají katalytickou funkci a podjednotky B nemají enzymatickou aktivitu a mohou sloužit jako molekuly nosiče plazmy. Faktor trombocytů XIII se skládá pouze z 2 podjednotek A, které jsou identické s podjednotkami plazmatického původu. Po štěpení aktivačního peptidu trombinem a v přítomnosti iontu vápníku plazmatický faktor XIII disociuje své B podjednotky a získá stejný aktivní enzym, faktor XIIIa, jako destičkový faktor XIII. Tento enzym působí jako transglutamináza, která katalyzuje tvorbu zesítění gama-glutamyl-epsilon-lysinu mezi molekulami fibrinu, čímž stabilizuje fibrinovou sraženinu. Také zesíťuje inhibitor alfa-2-plazminu nebo fibronektin na alfa řetězce fibrinu. Nedostatek faktoru XIII je rozdělen do dvou kategorií: nedostatek typu I, charakterizovaný nedostatkem podjednotek A i B; a nedostatek typu II, charakterizovaný nedostatkem samotné podjednotky A. Tyto vady mohou mít za následek celoživotní tendenci ke krvácení, vadné hojení ran a obvyklé potraty.^[5]

Interakce

Ukázalo se, že polypeptid koagulačního faktoru XIII, Al komunikovat s F13B.^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124491 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039109 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: F13A1 koagulační faktor XIII, polypeptid A1“.
^ Carrell NA, Erickson HP, McDonagh J (leden 1989). "Elektronová mikroskopie a hydrodynamické vlastnosti podjednotek faktoru XIII". J. Biol. Chem. 264 (1): 551–6. PMID 2491853.
^ Achyuthan KE, Rowland TC, Birckbichler PJ, Lee KN, Bishop PD, Achyuthan AM (září 1996). „Hierarchie ve vazbě lidského faktoru XIII, faktoru XIIIa a transglutaminázy endoteliálních buněk na lidský plazmatický fibrinogen, fibrin a fibronektin“. Mol. Buňka. Biochem. 162 (1): 43–9. doi:10.1007 / bf00250994. PMID 8905624. S2CID 23583301.

Další čtení

Adány R (1997). „Intracelulární faktor XIII: buněčná distribuce podjednotky faktoru XIII a u lidí“. Semin. Tromb. Hemost. 22 (5): 399–408. doi:10.1055 / s-2007-999038. PMID 8989823.
Adány R, Bárdos H (2003). "Faktor XIII podjednotka A jako intracelulární transglutamináza". Buňka. Mol. Life Sci. 60 (6): 1049–60. doi:10.1007 / s00018-003-2178-9. PMID 12861374. S2CID 7831538.
Bereczky Z, Katona E, Muszbek L (2005). "Stabilizace fibrinu (faktor XIII), struktura fibrinu a trombóza". Pathophysiol. Haemost. Tromb. 33 (5–6): 430–7. doi:10.1159/000083841. PMID 15692256. S2CID 12156307.
Board P, Coggan M, Miloszewski K (1992). „Identifikace bodové mutace v deficitu podjednotky faktoru XIII“. Krev. 80 (4): 937–41. doi:10,1182 / krev. V80.4.937.937. PMID 1353995.
Kamura T, Okamura T, Murakawa M, Tsuda H, Teshima T, Shibuya T, Harada M, Niho Y (1992). „Nedostatek koagulačního faktoru XIII Podjednotka způsobená delecí dinukleotidů na 5 'konci exonu III“. J. Clin. Investovat. 90 (2): 315–9. doi:10,1172 / JCI115864. PMC 443104. PMID 1644910.
Harsfalvi J, Fesus L, Tarcsa E, Laczko J, Loewy AG (1991). "Přítomnost kovalentně zesítěné matrice v lidských krevních destičkách". Biochim. Biophys. Acta. 1073 (2): 268–74. doi:10.1016 / 0304-4165 (91) 90131-Y. PMID 2009280.
Bishop PD, Teller DC, Smith RA, Lasser GW, Gilbert T, Seale RL (1990). "Exprese, čištění a charakterizace lidského faktoru XIII v Saccharomyces cerevisiae". Biochemie. 29 (7): 1861–9. doi:10.1021 / bi00459a028. PMID 2184890.
Hilgenfeld R, Liesum A, Storm R, Metzner HJ, Karges HE (1990). "Krystalizace faktoru XIII srážení krve automatizovaným postupem". FEBS Lett. 265 (1–2): 110–2. doi:10.1016 / 0014-5793 (90) 80896-Q. PMID 2365049. S2CID 23295980.
Carrell NA, Erickson HP, McDonagh J (1989). "Elektronová mikroskopie a hydrodynamické vlastnosti podjednotek faktoru XIII". J. Biol. Chem. 264 (1): 551–6. PMID 2491853.
Takahashi N, Takahashi Y, Putnam FW (1986). "Primární struktura krevního koagulačního faktoru XIIIa (fibrinoligáza, transglutamináza) z lidské placenty". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 83 (21): 8019–23. Bibcode:1986PNAS ... 83.8019T. doi:10.1073 / pnas.83.21.8019. PMC 386858. PMID 2877456.
Grundmann U, Amann E, Zettlmeissl G, Küpper HA (1986). "Charakterizace cDNA kódující lidský faktor XIIIa". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 83 (21): 8024–8. Bibcode:1986PNAS ... 83.8024G. doi:10.1073 / pnas.83.21.8024. PMC 386859. PMID 2877457.
Ichinose A, Davie EW (1988). "Charakterizace genu pro podjednotku lidského faktoru XIII (plazmatická transglutamináza), faktoru srážení krve". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 85 (16): 5829–33. Bibcode:1988PNAS ... 85.5829I. doi:10.1073 / pnas.85.16.5829. PMC 281858. PMID 2901091.
Board PG, Webb GC, McKee J, Ichinose A (1988). "Lokalizace koagulačního faktoru XIII podjednotkového genu (F13A) do chromozomových pásem 6p24 ---- p25". Cytogenet. Cell Genet. 48 (1): 25–7. doi:10.1159/000132580. PMID 2903011.
Ichinose A, Hendrickson LE, Fujikawa K, Davie EW (1987). "Aminokyselinová sekvence podjednotky lidského faktoru XIII". Biochemie. 25 (22): 6900–6. doi:10.1021 / bi00370a025. PMID 3026437.
Takagi T, Doolittle RF (1974). „Aminokyselinové sekvenční studie na faktoru XIII a peptidu uvolněném během jeho aktivace trombinem“. Biochemie. 13 (4): 750–6. doi:10.1021 / bi00701a018. PMID 4811064.
Yee VC, Pedersen LC, Bishop PD, Stenkamp RE, Teller DC (1995). „Strukturální důkazy o tom, že se aktivační peptid po štěpení faktorem XIII trombinem neuvolňuje“. Tromb. Res. 78 (5): 389–97. doi:10.1016 / 0049-3848 (95) 00072-Y. PMID 7660355.
Coggan M, Baker R, Miloszewski K, Woodfield G, Board P (1995). "Mutace způsobující nedostatek koagulačního faktoru XIII podjednotky A: charakterizace mutantních proteinů po expresi v kvasinkách". Krev. 85 (9): 2455–60. doi:10.1182 / krev.V85.9.2455.bloodjournal8592455. PMID 7727776.
Kaczmarek E, Liu Y, Berse B, Chen CS, McDonagh J (1995). „Biosyntéza plazmatického faktoru XIII: důkazy transkripce a translace v buňkách hepatomu“. Biochim. Biophys. Acta. 1247 (1): 127–34. doi:10.1016 / 0167-4838 (94) 00167-f. PMID 7873582.
Yee VC, Pedersen LC, Le Trong I, Bishop PD, Stenkamp RE, Teller DC (1994). "Trojrozměrná struktura transglutaminázy: lidský krevní koagulační faktor XIII". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (15): 7296–300. Bibcode:1994PNAS ... 91,7296Y. doi:10.1073 / pnas.91.15.7296. PMC 44386. PMID 7913750.
Suzuki K, Iwata M, Ito S, Matsui K, Uchida A, Mizoi Y (1994). "Molekulární základ pro subtypické rozdíly podjednotky" a "koagulačního faktoru XIII s popisem geneze podtypů." Hučení. Genet. 94 (2): 129–35. doi:10.1007 / bf00202857. PMID 7913909. S2CID 20800219.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124491 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039109 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] „Entrez Gene: F13A1 koagulační faktor XIII, polypeptid A1“.

[pmid2491853-6] Carrell NA, Erickson HP, McDonagh J (leden 1989). "Elektronová mikroskopie a hydrodynamické vlastnosti podjednotek faktoru XIII". J. Biol. Chem. 264 (1): 551–6. PMID 2491853.

[pmid8905624-7] Achyuthan KE, Rowland TC, Birckbichler PJ, Lee KN, Bishop PD, Achyuthan AM (září 1996). „Hierarchie ve vazbě lidského faktoru XIII, faktoru XIIIa a transglutaminázy endoteliálních buněk na lidský plazmatický fibrinogen, fibrin a fibronektin“. Mol. Buňka. Biochem. 162 (1): 43–9. doi:10.1007 / bf00250994. PMID 8905624. S2CID 23583301.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]