Molekula buněčné adheze 1 - Cell adhesion molecule 1

CADM1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyCADM1, BL2, IGSF4, IGSF4A, NECL2, Necl-2, RA175, ST17, SYNCAM, TSLC1, sTSLC-1, sgIGSF, synCAM1, molekula buněčné adheze 1
Externí IDOMIM: 605686 MGI: 1889272 HomoloGene: 8641 Genové karty: CADM1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 11 (lidský)
Chr.Chromozom 11 (lidský)[1]
Chromozom 11 (lidský)
Genomické umístění pro CADM1
Genomické umístění pro CADM1
Kapela11q23.3Start115,169,218 bp[1]
Konec115,504,957 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE CADM1 209032 s na fs.png

PBB GE CADM1 209030 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001098517
NM_001301043
NM_001301044
NM_001301045
NM_014333

NM_001025600
NM_018770
NM_207675
NM_207676
NM_001310841

RefSeq (protein)

NP_001091987
NP_001287972
NP_001287973
NP_001287974
NP_055148

NP_001020771
NP_001297770
NP_061240
NP_997558
NP_997559

Místo (UCSC)Chr 11: 115,17 - 115,5 MbChr 9: 47,53 - 47,86 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Molekula buněčné adheze 1 je protein který je u lidí kódován CADM1 gen.[5][6]

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce CADM1. Podmíněný knockout myš linka, tzv Cadm1tm1.2Brd[10] byl vygenerován.[11] Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka k určení účinků vypuštění.[9][12] Dvacet šest testů bylo provedeno na homozygotech mutant myši a byla pozorována jedna významná abnormalita: muži byli neplodní.[9] Ukázala další analýza spermatogeneze zatčen u těchto myší.[11]

Interakce

Ukázalo se, že molekula 1 adheze buněk komunikovat s EPB41L3.[13]

Asociační studie

Genomové asociační studie identifikoval souvislost mezi index tělesné hmotnosti a dva lokusy poblíž CADM1 a CADM2 gen.[14] Experimentální výsledky jiné studie ukázaly, že obézní myši měly nadměrnou expresi obou CADM1 a CADM2 geny a ta ztráta CADM1 chráněné myši před obezitou, podporující negativní energetickou bilanci a hubnutí.[15] Dále rok 2019 GWAS studie odhalila souvislost mezi Anorexia nervosa a CADM1.[16]V mozku tyto geny zprostředkovávají synaptické shromáždění a mutace CADM1 jsou také spojeny s Porucha autistického spektra. [17]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182985 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032076 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Gomyo H, Arai Y, Tanigami A, Murakami Y, Hattori M, Hosoda F, Arai K, Aikawa Y, Tsuda H, Hirohashi S, Asakawa S, Shimizu N, Soeda E, Sakaki Y, Ohki M (únor 2000). „Kontigní mapa připravená na sekvenci 2 Mb a nový gen nadrodiny imunoglobulinů IGSF4 v oblasti LOH chromozomu 11q23.2“. Genomika. 62 (2): 139–46. doi:10.1006 / geno.1999.6001. PMID  10610705.
  6. ^ "Entrez Gene: CADM1 buněčná adhezní molekula 1".
  7. ^ "Salmonella data infekce pro Cadm1 ". Wellcome Trust Sanger Institute.
  8. ^ "Citrobacter data infekce pro Cadm1 ". Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. ^ A b C Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: Vysoce výkonná charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  10. ^ "Myší genomová informatika".
  11. ^ A b Van Der Weyden, L .; Arends, M. J .; Chausiaux, O.E .; Ellis, P. J .; Lange, USA; Surani, M. A .; Affara, N .; Murakami, Y .; Adams, D. J .; Bradley, A. (2006). „Ztráta TSLC1 způsobuje mužskou neplodnost v důsledku defektu v spermatogenní fázi spermatogeneze“. Molekulární a buněčná biologie. 26 (9): 3595–3609. doi:10.1128 / MCB.26.9.3595-3609.2006. PMC  1447413. PMID  16611999.
  12. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). „Sada nástrojů pro genetiku myší: odhalení funkce a mechanismu“. Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC  3218837. PMID  21722353.
  13. ^ Yageta, Mika; Kuramochi Masami; Masuda Mari; Fukami Takeshi; Fukuhara Hiroši; Marujama Tomoko; Shibuya Masabumi; Murakami Yoshinori (září 2002). „Přímá asociace TSLC1 a DAL-1, dvou odlišných nádorových supresorových proteinů u rakoviny plic“. Cancer Res. 62 (18): 5129–33. ISSN  0008-5472. PMID  12234973.
  14. ^ Speliotes EK, Willer CJ, Berndt SI, Monda KL, Thorleifsson G, Jackson AU a kol. (Listopad 2010). „Asociační analýzy 249 796 jedinců odhalily 18 nových lokusů spojených s indexem tělesné hmotnosti“. Genetika přírody. 42 (11): 937–48. doi:10,1038 / ng.686. PMC  3014648. PMID  20935630.
  15. ^ Rathjen T, Yan X, Kononenko NL, Ku MC, Song K, Ferrarese L a kol. (Srpen 2017). „Regulace homeostázy tělesné hmotnosti a energie pomocí molekuly adheze neuronových buněk 1“. Přírodní neurovědy. 20 (8): 1096–1103. doi:10.1038 / č. 4590. PMC  5533218. PMID  28628102.
  16. ^ Watson HJ, Yilmaz Z, Thornton LM, Hübel C, Coleman JR, Gaspar HA a kol. (Srpen 2019). „Celomanomová asociační studie identifikuje osm rizikových lokusů a implikuje metabo-psychiatrický původ pro mentální anorexii“. Genetika přírody. 51 (8): 1207–1214. doi:10.1038 / s41588-019-0439-2. PMC  6779477. PMID  31308545.
  17. ^ Fujita E, Tanabe Y, Imhof BA, Momoi MY, Momoi T (prosinec 2012). „Komplex synaptické adhezní molekuly CADM1, molekuly související s poruchou autistického spektra, s MUPP1 v mozečku“. J Neurochem. 123 (5): 886–94. doi:10.1111 / jnc.12022. PMID  22994563.

Další čtení