Calumenin - Calumenin

CALU
Identifikátory
Aliasy	CALUkalumenin
Externí ID	OMIM: 603420 MGI: 1097158 HomoloGene: 936 Genové karty: CALU
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	128,773,400 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	29,377,110 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• Golgiho aparát; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • melanosom; • sarkoplazmatické retikulum; • extracelulární oblast; • endoplazmatické retikulum; • lumen sarkoplazmatického retikula; • lumen endoplazmatického retikula;
Biologický proces	• posttranslační modifikace; • buněčný proteinový metabolický proces; • biologický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	813
	12321
	ENSG00000128595
	ENSMUSG00000029767
	O43852
	O35887
NM_001130674; NM_001199671; NM_001199672; NM_001199673; NM_001199674;
	NM_001219
	NM_001285412; NM_007594; NM_184053
	NP_001124146; NP_001186600; NP_001186601; NP_001186602; NP_001210
	NP_001272341; NP_031620; NP_908942
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Calumenin je protein že u lidí je kódován CALU gen.^[5]^[6]

Calumenin (CALU) je protein vázající vápník lokalizovaný v endoplazmatické retikulum (ER) a podílí se na takových funkcích ER jako skládání bílkovin a třídění. Calumenin je členem EF ruka nadrodina v ER a Golgiho aparát s názvem CERC. CERC je zkratka pro členy rodiny Cab-45, retikulokalbin, Erc-55 (RCN2 ) a kalumenin. Gen CALU kóduje dedukovaný protein o 315 aminokyselinách obsahující 6 motivů EF-ruky, 1 potenciální N-glykosylační místo a retenční signál C-konce ER. Lidské a myší proteiny CALU jsou 98% identické. CALU mRNA je všudypřítomně exprimována v lidských tkáních a mapuje se na 7q32.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128595 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029767 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yabe D, Taniwaki M, Nakamura T, Kanazawa N, Tashiro K, Honjo T (srpen 1998). "Lidský kalumeninový gen (CALU): izolace cDNA a chromozomální mapování na 7q32". Genomika. 49 (2): 331–3. doi:10.1006 / geno.1998.5245. PMID 9598325.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CALU calumenin“.

externí odkazy

Člověk CALU umístění genomu a CALU stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Yabe D, Nakamura T, Kanazawa N a kol. (1997). „Calumenin, protein vázající Ca2 + zadržovaný v endoplazmatickém retikulu s novou karboxylterminální sekvencí, HDEF“. J. Biol. Chem. 272 (29): 18232–9. doi:10.1074 / jbc.272.29.18232. PMID 9218460.
Vorum H, Liu X, Madsen P a kol. (1998). "Molekulární klonování cDNA kódující lidský kalumenin, exprese v Escherichia coli a analýza jeho aktivity vázající Ca2 +". Biochim. Biophys. Acta. 1386 (1): 121–31. doi:10.1016 / s0167-4838 (98) 00089-2. PMID 9675259.
Hseu MJ, Yen CH, Tzeng MC (1999). „Crocalbin: nový protein vázající vápník, který je také vazebným proteinem pro crotoxin, neurotoxickou fosfolipázu A2“. FEBS Lett. 445 (2–3): 440–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00177-5. PMID 10094503. S2CID 40129100.
Vorum H, Hager H, Christensen BM a kol. (1999). „Lidský kalumenin se lokalizuje do sekreční dráhy a je vylučován do média“. Exp. Cell Res. 248 (2): 473–81. doi:10.1006 / excr.1999.4431. PMID 10222138.
Vorum H, Jacobsen C, Honoré B (2000). "Kalumenin interaguje se sérovou amyloidovou složkou P". FEBS Lett. 465 (2–3): 129–34. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01734-2. PMID 10631319. S2CID 1943508.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Basrur V, Yang F, Kushimoto T a kol. (2003). "Proteomická analýza časných melanosomů: identifikace nových melanosomálních proteinů". J. Proteome Res. 2 (1): 69–79. doi:10.1021 / pr025562r. PMID 12643545.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Lidský chromozom 7: sekvence DNA a biologie“. Věda. 300 (5620): 767–72. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). „Signální sekvence a lapač klíčových slov in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA s oligopohraničením“. DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Chi A, Valencia JC, Hu ZZ a kol. (2007). "Proteomická a bioinformatická charakterizace biogeneze a funkce melanosomů". J. Proteome Res. 5 (11): 3135–44. doi:10.1021 / pr060363j. PMID 17081065.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128595 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029767 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9598325-5] Yabe D, Taniwaki M, Nakamura T, Kanazawa N, Tashiro K, Honjo T (srpen 1998). "Lidský kalumeninový gen (CALU): izolace cDNA a chromozomální mapování na 7q32". Genomika. 49 (2): 331–3. doi:10.1006 / geno.1998.5245. PMID 9598325.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CALU calumenin“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]