Víčko C. - C cap

Termín C cap (C-cap, Ccap) popisuje aminokyselina v konkrétní pozici v rámci a protein nebo polypeptid. [1] [2] [3] [4] [5] [6] Zbytek C cap z alfa šroubovice je poslední aminokyselina zbytek na C konec šroubovice. Přesněji je definován jako poslední zbytek (i), jehož NH skupina je vodíkově vázané na skupinu CO zbytku i-4 (nebo někdy zbytku i-3). Z tohoto důvodu je někdy také popisován jako zbytek po šroubovici.

Určité motivy se běžně vyskytují na čepici C nebo kolem ní, zejména na čepici Schellmanova smyčka a nika (proteinový strukturní motiv).

The Víčko N je odpovídající aminokyselinový zbytek na druhém konci šroubovice


Reference

  1. ^ Richardson, JM; Richardson DC (1988). "Předvolby aminokyselin pro konkrétní místa na koncích alfa-šroubovic". Věda. 240 (4859): 1648–1652. Bibcode:1988Sci ... 240.1648R. doi:10.1126 / science.3381086. PMID  3381086. S2CID  38467101.
  2. ^ Presta, LG; Rose GD (1988). "Helix Caps". Věda. 240 (4859): 1632–1641. Bibcode:1988Sci ... 240.1632P. doi:10.1126 / science.2837824. PMID  2837824.
  3. ^ Doig, AJ; MacArthur MW (1997). "Struktury N-konců helixů v proteinech". Věda o bílkovinách. 6 (1): 147–155. doi:10.1002 / pro.5560060117. PMC  2143508. PMID  9007987.
  4. ^ Aurora, R; Rose GD (1998). "Helix Capping". Věda o bílkovinách. 7 (1): 21–38. doi:10.1002 / pro.5560070103. PMC  2143812. PMID  9514257.
  5. ^ Gunasekaran, K; Nagarajam HA (1998). "Sterochemická interpunkční znaménka ve struktuře proteinu". Journal of Molecular Biology. 275 (5): 917–932. doi:10.1006 / jmbi.1997.1505. PMID  9480777. S2CID  35919397.
  6. ^ Leader, DP; Milner-White EJ (2011). "Struktura konců šroubovic v globulárních proteinech". Proteiny. 79 (3): 1010–1019. doi:10,1002 / prot. 22942. PMID  21287629.