CROT (gen) - CROT (gene)

CROT
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1XL7, 1XL8, 1XMC, 1XMD
Identifikátory
Aliasy	CROT, COT, karnitin O-oktanoyltransferáza
Externí ID	OMIM: 606090 MGI: 1921364 HomoloGene: 10899 Genové karty: CROT
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	87,399,795 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	8,997,324 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba na receptory; • aktivita transferázy, přenos acylových skupin; • aktivita karnitin-O-oktanoyltransferázy;
Buněčná složka	• intracelulární membránou vázaná organela; • peroxisom; • peroxisomální matrice; • cytosol;
Biologický proces	• metabolický proces mastných kyselin se středním řetězcem; • koenzym Metabolický proces; • metabolismus lipidů; • transport mastných kyselin; • generace prekurzorových metabolitů a energie; • metabolický proces mastných kyselin; • beta-oxidace mastných kyselin pomocí acyl-CoA oxidázy; • beta-oxidace mastných kyselin; • karnitinový metabolický proces; • cílení proteinů na peroxisom;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54677
	74114
	ENSG00000005469
	ENSMUSG00000003623
	Q9UKG9
	Q9DC50
	NM_001143935; NM_001243745; NM_021151
	NM_023733
	NP_001137407; NP_001230674; NP_066974
	NP_076222
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Peroxisomální karnitin O-oktanoyltransferáza je enzym že u lidí je kódován CROT gen.^[5]^[6]

Karnitin oktanoyltransferáza (EC 2.3.1.137) je a karnitin acyltransferáza že katalyzuje reverzibilní přenos tuku acylové skupiny mezi CoA a karnitin. Tento enzym reguluje štěpení mastných kyselin s velmi dlouhým řetězcem (VLCFA ) provedením zásadního kroku při transportu středně dlouhých acylových řetězců ze savce peroxisom do cytosol a mitochondrie pro další rozdělení. Viz také CRAT (MIM 600184). Van der Leij a kol. (2000) přezkoumali funkci, strukturní rysy a fylogenetiku genů lidské karnitin acyltransferázy, včetně CROT. [Dodáváno společností OMIM]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000005469 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003623 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ferdinandusse S, Mulders J, IJlst L, Denis S, Dacremont G, Waterham HR, Wanders RJ (říjen 1999). „Molekulární klonování a exprese lidské karnitin-oktanoyltransferázy: důkazy o její roli v peroxisomální beta-oxidaci mastných kyselin s rozvětveným řetězcem“. Biochem Biophys Res Commun. 263 (1): 213–8. doi:10.1006 / bbrc.1999.1340. PMID 10486279.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CROT carnitine O-octanoyltransferase“.

externí odkazy

Člověk CROT umístění genomu a CROT stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

van der Leij FR, Huijkman NC, Boomsma C a kol. (2000). "Genomika genů lidské karnitin acyltransferázy". Mol. Genet. Metab. 71 (1–2): 139–53. doi:10,1006 / mgme. 2000,3055. PMID 11001805.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Lidský chromozom 7: sekvence DNA a biologie“. Věda. 300 (5620): 767–72. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Morillas M, Gómez-Puertas P, Rubí B a kol. (2002). „Strukturní model malonyl-CoA-vazebného místa karnitin oktanoyltransferázy a karnitin palmitoyltransferázy I: mutační analýza afinitní domény malonyl-CoA“. J. Biol. Chem. 277 (13): 11473–80. doi:10,1074 / jbc.M111628200. PMID 11790793.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000005469 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003623 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10486279-5] Ferdinandusse S, Mulders J, IJlst L, Denis S, Dacremont G, Waterham HR, Wanders RJ (říjen 1999). „Molekulární klonování a exprese lidské karnitin-oktanoyltransferázy: důkazy o její roli v peroxisomální beta-oxidaci mastných kyselin s rozvětveným řetězcem“. Biochem Biophys Res Commun. 263 (1): 213–8. doi:10.1006 / bbrc.1999.1340. PMID 10486279.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CROT carnitine O-octanoyltransferase“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]