CRD-BP - CRD-BP

Myš Protein vázající kódující oblast (CRD-BP) je Protein vázající RNA.[1] CRD-BP patří do rodiny proteinů vázajících RNA, které vykazují blízkou souvislost s kuřecím β-aktinovým proteinem vázajícím zipcode ZBP1 [1] a lidské formy proteinu IMP-1, IMP-2 a IMP-3.[1][2][3] Vzhledem k jejich blízkému vztahu, CRD-BP a jeho ortology Předpokládá se, že mají stejné biochemické vlastnosti. Po navázání na své transkripty hraje CRD-BP roli v translaci stabilizací a lokalizací transkriptů v buňce.[3] Normální exprese CRD-BP byla pozorována v časném vývoji embrya.[3] Naopak exprese CRD-BP v dospělé tkáni je extrémně nízká nebo zcela chybí.[4]

Struktura

CRD-BP je 577 aminokyselina protein, který obsahuje 4 KH domény, 2 RRM a krabici RGG (obrázek 2).[1] CRD-BP a lidský IMP-1 nejsou totožné, ale vykazují vysoký stupeň podobnosti. Velmi úzce souvisí s IMP-2, který byl stanoven fylogenetickou analýzou (obrázek 1).[3] V důsledku tohoto uzavření fylogeneze, struktura konzervovaných funkčních domén je sdílena mezi CRD-BP, ZBP1 a lidskými IMP (obrázek 2).[3][5]Konzervované KH domény jsou sdíleny v rámci ortologů a jsou schopné se tvořit dimery které orientují oblasti vázající RNA opačným polárním způsobem (obrázek 3A).[5] Tato orientace vytváří prostor pro každý motiv G-X-X-G (obrázek 3B) každé domény KH k navázání jeho transkriptu RNA (obrázek 3A).[5]

CRD-BP RNA transkripty

Bylo prokázáno, že CRD-BP a jeho ortology mají schopnost vázat se CD44, beta-aktin, c-myc, IGF2, H19 a transkripty tau RNA.[6] Bylo prokázáno, že CRD-BP hraje klíčovou roli v růstu rakoviny a invazi do tkání. Proteiny CD44 patří do rodiny molekul adheze na buněčný povrch, které se účastní komunikace mezi buňkami i buňkami a matricemi.[7] CRD-BP se váže na a chrání CD44 RNA, která vykazuje zvýšenou expresi v rakoviny.[6] CRD-BP hraje roli v lokalizaci p-aktinové mRNA vazbou na lokalizační prvek v 3'UTR kraj.[8] Aberantní exprese onkogenního genu c-myc byla prokázána při tvorbě nádorů.[1] c-myc mRNA obsahuje a oblast kódování nestabilita určující (CRD), na kterou se CRD-BP váže, a proto chrání c-myc mRNA před endonukleolytickým útokem.[1] CRD-BP také váže mRNA IGF2 a H19.[8] Gen H19 je lokalizován po směru IGF2 chromozom 11 a chromozom 7 na lidech a myších.[8] Ukázalo se, že vazba CRD-BP na tyto transkripty mění expresi genů. The protein spojený s mikrotubuly (MAP) je kódován tau mRNA a nachází se hlavně v axon z neurony.[8] 3’UTR tau mRNA obsahuje cis-regulační prvek, který řídí axonální lokalizaci tau mRNA.[8] CRD-BP se váže na axonální lokalizační signál (ALS) tau a hraje roli v lokalizaci transkriptu.[8]

CRD-BP se proto ukázal být upregulován u mnoha nemocí, včetně rakoviny.

Reference

  1. ^ A b C d E F Doyle, G. a kol. 1998. Protein vázající determinantní oblast c-myc¬: člen rodiny KH doménových proteinů vázajících RNA. Nuc. Kyselina. Res. 26: 5036-5044.
  2. ^ Liao, B. a kol. 2005. Protein vázající RNA IMP-3 je translační aktivátor inzulinový růstový faktor II leader-3 mRNA během proliferace člověka K562 leukémie buňky. Časopis biologické chemie, 280: 18517-18524
  3. ^ A b C d E Christiansen, J. a kol. 2009. IGF2 mRNA-vázající protein 2: biologická funkce a domnělá role u diabetu 2. typu. Journal of Molecular Endocrinology, 43: 187-195
  4. ^ Prokipcak, R. a kol. 1994. Čištění a vlastnosti proteinu, který se váže na C-koncovou kódující oblast lidské c-myc mRNA. Journal of Biological Chemistry, 12: 9261-9269.
  5. ^ A b C Chao, J., et al. 2010. Rozpoznání ZBP1 β-aktinového zipcodu indukuje smyčku RNA. Genes Dev, 24: 148-158.
  6. ^ A b Vikesaa, J. a kol. 2006. IMP vázající RNA podporují buněčnou adhezi a tvorbu invadopodií. EMBO 25: 1456-1468.
  7. ^ Goodison, S., et al. 1999. CD44 Molekuly buněčné adheze. Mol Path, 52: 189-196.
  8. ^ A b C d E F Ioannidis, P. a T. Trangas., 2006. CRD-BP / IMP1: Protein vázající RNA s tumorogenními charakteristikami. Trendy ve výzkumu RNA. 39-71.