COPS4 - COPS4

COPS4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4D0P, 4D10, 4D18, 4WSN
Identifikátory
Aliasy	COPS4, CSN4, COP9 signalosomová podjednotka 4, SGN4
Externí ID	OMIM: 616008 MGI: 1349414 HomoloGene: 8067 Genové karty: COPS4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	83,075,818 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	100,547,803 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • NEDD8-specifická proteázová aktivita;
Buněčná složka	• cytoplazma; • COP9 signalosom; • buněčné spojení; • synapse; • extracelulární exosom; • cytoplazmatický váček; • synaptický váček; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • nukleotidová excize, rozpoznání poškození DNA; • proteinová deneddylace; • posttranslační modifikace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51138
	26891
	ENSG00000138663
	ENSMUSG00000035297
	Q9BT78
	O88544
	NM_001258006; NM_016129; NM_001330727
	NM_012001; NM_001359203; NM_001359204
	NP_001244935; NP_001317656; NP_057213
	NP_036131; NP_001346132; NP_001346133
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka komplexu signalosomu COP9 4 je protein že u lidí je kódován COPS4 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje jednu z osmi podjednotek skládajících se COP9 signalosom, vysoce konzervovaný proteinový komplex, který funguje jako důležitý regulátor v několika signálních drahách. Struktura a funkce signalosomu COP9 je podobná struktuře a funkci regulační částice 19S proteazomu 26S. Ukázalo se, že signalosom COP9 interaguje s ubikvitinovými ligázami typu E3 SCF a působí jako pozitivní regulátor ubikvitinových ligáz E3.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138663 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035297 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wei N, Tsuge T, Serino G, Dohmae N, Takio K, Matsui M, Deng XW (říjen 1998). „Komplex COP9 je konzervován mezi rostlinami a savci a souvisí s regulačním komplexem proteasomu 26S“. Curr Biol. 8 (16): 919–924. doi:10.1016 / S0960-9822 (07) 00372-7. PMID 9707402. S2CID 13873982.
^ ^A ^b "Entrez Gene: COPS4 COP9 konstitutivní fotomorfogenní homologní podjednotka 4 (Arabidopsis)".

externí odkazy

Člověk COPS4 umístění genomu a COPS4 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Schwechheimer C, Deng XW (2001). „COP9 signalosome revisited: a new mediator of protein degradation“. Trends Cell Biol. 11 (10): 420–426. doi:10.1016 / S0962-8924 (01) 02091-8. PMID 11567875.
Wolf DA, Zhou C, Wee S (2004). „Signalosom COP9: montážní a údržbová platforma pro cullinové ubikvitinové ligázy?“. Nat. Cell Biol. 5 (12): 1029–1033. doi:10.1038 / ncb1203-1029. PMID 14647295. S2CID 37458780.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–174. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–156. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Seeger M, Kraft R, Ferrell K a kol. (1998). „Nový proteinový komplex zapojený do signální transdukce, který má podobnosti s podjednotkami proteasomu 26S“. FASEB J.. 12 (6): 469–78. doi:10.1096 / fasebj.12.6.469. PMID 9535219. S2CID 25424324.
Sanger Center, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (1999). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Genome Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
Naumann M, Bech-Otschir D, Huang X a kol. (2000). „Aktivace / stabilizace c-Jun zaměřená na signalosom COP9 je nezávislá na JNK“ (PDF). J. Biol. Chem. 274 (50): 35297–35300. doi:10.1074 / jbc.274.50.35297. PMID 10585392. S2CID 27417298.
Cohen H, Azriel A, Cohen T a kol. (2001). „Interakce mezi proteinem vázajícím se na sekvenci interferonu a podjednotkou COP9 / signalosomu CSN2 (Trip15). Možná vazba mezi signalizací regulačního faktoru interferonu a COP9 / signalosomem“. J. Biol. Chem. 275 (50): 39081–39089. doi:10,1074 / jbc.M004900200. PMID 10991940.
Tsuge T, Matsui M, Wei N (2001). „Podjednotka 1 signalosomu COP9 potlačuje genovou expresi prostřednictvím své N-terminální domény a začleňuje se do komplexu prostřednictvím domény PCI.“ J. Mol. Biol. 305 (1): 1–9. doi:10.1006 / jmbi.2000.4288. PMID 11114242.
Bech-Otschir D, Kraft R, Huang X a kol. (2001). "COP9 signalosomově specifická fosforylace cílí p53 na degradaci ubikvitinovým systémem". EMBO J.. 20 (7): 1630–1639. doi:10.1093 / emboj / 20.7.1630. PMC 145508. PMID 11285227.
Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, et al. (2001). "Podpora štěpení konjugátu NEDD-CUL1 signalosomem COP9". Věda. 292 (5520): 1382–1385. doi:10.1126 / science.1059780. PMID 11337588. S2CID 14224920.
Peyrl A, Weitzdoerfer R, Gulesserian T, et al. (2003). „Aberantní exprese proteinů souvisejících se signalizací 14-3-3 gama a RACK1 v mozku fetálního Downova syndromu (trizomie 21)“. Elektroforéza. 23 (1): 152–7. doi:10.1002 / 1522-2683 (200201) 23: 1 <152 :: AID-ELPS152> 3.0.CO; 2-T. PMID 11824616.
Hoareau Alves K, Bochard V, Réty S, Jalinot P (2002). „Sdružení savčího protoonkoproteinu Int-6 se třemi proteinovými komplexy eIF3, signalosomem COP9 a proteasomem 26S“. FEBS Lett. 527 (1–3): 15–21. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03147-2. PMID 12220626. S2CID 39308598.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Serino G, Su H, Peng Z a kol. (2003). „Charakterizace poslední podjednotky signalosomu Arabidopsis COP9: důsledky pro celkovou strukturu a původ komplexu“. Rostlinná buňka. 15 (3): 719–731. doi:10,1105 / tpc.009092. PMC 150025. PMID 12615944.
Uhle S, Medalia O, Waldron R a kol. (2003). „Proteinkináza CK2 a proteinkináza D jsou spojeny se signalosomem COP9“. EMBO J.. 22 (6): 1302–1312. doi:10.1093 / emboj / cdg127. PMC 151059. PMID 12628923.
Groisman R, Polanowska J, Kuraoka I a kol. (2003). „Aktivita ubikvitinové ligázy v komplexech DDB2 a CSA je odlišně regulována signalosomem COP9 v reakci na poškození DNA“. Buňka. 113 (3): 357–367. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00316-7. PMID 12732143. S2CID 11639677.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138663 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035297 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9707402-5] Wei N, Tsuge T, Serino G, Dohmae N, Takio K, Matsui M, Deng XW (říjen 1998). „Komplex COP9 je konzervován mezi rostlinami a savci a souvisí s regulačním komplexem proteasomu 26S“. Curr Biol. 8 (16): 919–924. doi:10.1016 / S0960-9822 (07) 00372-7. PMID 9707402. S2CID 13873982.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: COPS4 COP9 konstitutivní fotomorfogenní homologní podjednotka 4 (Arabidopsis)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]