Podjednotka komplexu signalosomu COP9 3 - COP9 signalosome complex subunit 3

COPS3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4D10, 4D18, 4WSN
Identifikátory
Aliasy	COPS3, CSN3, SGN3, COP9 signalosomová podjednotka 3
Externí ID	OMIM: 604665 MGI: 1349409 HomoloGene: 2710 Genové karty: COPS3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	17,281,273 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	59,839,838 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• COP9 signalosom; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • v embryonálním vývoji dělohy; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • nukleotidová excize, rozpoznání poškození DNA; • signální transdukce; • reakce na světelný podnět; • proteinová deneddylace; • posttranslační modifikace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8533
	26572
	ENSG00000141030
	ENSMUSG00000019373
	Q9UNS2
	O88543
NM_001199125; NM_003653; NM_001316354; NM_001316355; NM_001316356;
	NM_001316357; NM_001316358
	NM_011991
NP_001186054; NP_001303283; NP_001303284; NP_001303285; NP_001303286;
	NP_001303287; NP_003644
	NP_036121
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka komplexu signalosomu COP9 3 je protein že u lidí je kódován COPS3 gen.^[5]^[6]^[7] Kóduje podjednotku COP9 signalosom.

Protein kódovaný tímto genem má aktivitu kinázy, která fosforyluje regulátory zapojené do signální transdukce. Fosforyluje I-kappa-B-alfa, p105 a c-Jun. Funguje jako dokovací místo pro komplexně zprostředkovanou fosforylaci. Gen se nachází v oblasti syndromu Smith-Magenis na chromozomu 17.^[7]

Viz také

Signalosome

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141030 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019373 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Seeger M, Kraft R, Ferrell K, Bech-Otschir D, Dumdey R, Schade R, Gordon C, Naumann M, Dubiel W (duben 1998). „Nový proteinový komplex zapojený do signální transdukce, který má podobnosti s podjednotkami proteasomu 26S“. FASEB J.. 12 (6): 469–78. doi:10.1096 / fasebj.12.6.469. PMID 9535219. S2CID 25424324.
^ Potocki L, Chen KS, Lupski JR (červen 1999). „Podjednotka 3 komplexu přenosu signálu COP9 je konzervována z rostlin na člověka a mapuje se v kritické oblasti syndromu Smith-Magenis v 17p11.2.“ Genomika. 57 (1): 180–2. doi:10.1006 / geno.1998.5748. PMID 10191102.
^ ^A ^b "Entrez Gene: COPS3 COP9 konstitutivní fotomorfogenní homologní podjednotka 3 (Arabidopsis)".

externí odkazy

Člověk COPS3 umístění genomu a COPS3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk CSN3 umístění genomu a CSN3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Wolf DA, Zhou C, Wee S (2004). „Signalosom COP9: montážní a údržbová platforma pro cullinové ubikvitinové ligázy?“. Nat. Cell Biol. 5 (12): 1029–33. doi:10.1038 / ncb1203-1029. PMID 14647295. S2CID 37458780.
van Dartel M, Hulsebos TJ (2004). „Amplifikace a nadměrná exprese genů v 17p11.2 ~ p12 v osteosarkomu“. Genetika rakoviny. Cytogenet. 153 (1): 77–80. doi:10.1016 / j.cancergencyto.2004.03.007. PMID 15325100.
Wei N, Tsuge T, Serino G a kol. (1998). „Komplex COP9 je konzervován mezi rostlinami a savci a souvisí s regulačním komplexem proteasomu 26S“. Curr. Biol. 8 (16): 919–22. doi:10.1016 / S0960-9822 (07) 00372-7. PMID 9707402. S2CID 13873982.
Bianchi E, Denti S, Granata A a kol. (2000). „Integrin LFA-1 interaguje s transkripčním koaktivátorem JAB1 za účelem modulace aktivity AP-1“. Příroda. 404 (6778): 617–21. doi:10.1038/35007098. PMID 10766246. S2CID 4384395.
Tsuge T, Matsui M, Wei N (2001). „Podjednotka 1 signalosomu COP9 potlačuje genovou expresi prostřednictvím své N-terminální domény a začleňuje se do komplexu prostřednictvím domény PCI.“ J. Mol. Biol. 305 (1): 1–9. doi:10.1006 / jmbi.2000.4288. PMID 11114242.
Bech-Otschir D, Kraft R, Huang X a kol. (2001). "COP9 signalosomově specifická fosforylace cílí p53 na degradaci ubikvitinovým systémem". EMBO J.. 20 (7): 1630–9. doi:10.1093 / emboj / 20.7.1630. PMC 145508. PMID 11285227.
Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, et al. (2001). "Podpora štěpení konjugátu NEDD-CUL1 signalosomem COP9". Věda. 292 (5520): 1382–5. doi:10.1126 / science.1059780. PMID 11337588. S2CID 14224920.
Hong X, Xu L, Li X a kol. (2001). „CSN3 interaguje s IKKgamma a inhibuje aktivaci NF-kappaB indukovanou TNF, ale nikoli IL-1“. FEBS Lett. 499 (1–2): 133–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02535-2. PMID 11418127. S2CID 85296851.
Bi W, Yan J, Stankiewicz P a kol. (2002). „Geny v intervalu kritického delečního syndromu rafinovaného Smith-Magenisova syndromu na chromozomu 17p11.2 a Syntenické oblasti myši“. Genome Res. 12 (5): 713–28. doi:10,1101 / gr. 73702. PMC 186594. PMID 11997338.
Hoareau Alves K, Bochard V, Réty S, Jalinot P (2002). „Sdružení savčího protoonkoproteinu Int-6 se třemi proteinovými komplexy eIF3, signalosomem COP9 a proteasomem 26S“. FEBS Lett. 527 (1–3): 15–21. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03147-2. PMID 12220626. S2CID 39308598.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Petersen HH, Hilpert J, Militz D a kol. (2003). „Funkční interakce megalinu s megalin vazebným proteinem (MegBP), novou adaptorovou molekulou obsahující tetratrico peptidovou repetici“. J. Cell Sci. 116 (Pt 3): 453–61. doi:10,1242 / jcs.00243. PMID 12508107.
Serino G, Su H, Peng Z a kol. (2003). „Charakterizace poslední podjednotky signalosomu Arabidopsis COP9: důsledky pro celkovou strukturu a původ komplexu“. Rostlinná buňka. 15 (3): 719–31. doi:10,1105 / tpc.009092. PMC 150025. PMID 12615944.
Yuryev A, Wennogle LP (2003). „Nové interakce raf kináza-protein-protein nalezené vyčerpávající kvasinkovou dvouhybridní analýzou“. Genomika. 81 (2): 112–25. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 00008-3. PMID 12620389.
Uhle S, Medalia O, Waldron R a kol. (2003). „Proteinkináza CK2 a proteinkináza D jsou spojeny se signalosomem COP9“. EMBO J.. 22 (6): 1302–12. doi:10.1093 / emboj / cdg127. PMC 151059. PMID 12628923.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Groisman R, Polanowska J, Kuraoka I a kol. (2003). „Aktivita ubikvitinové ligázy v komplexech DDB2 a CSA je odlišně regulována signalosomem COP9 v reakci na poškození DNA“. Buňka. 113 (3): 357–67. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00316-7. PMID 12732143. S2CID 11639677.
Henriksen J, Aagesen TH, Maelandsmo GM a kol. (2003). „Amplifikace a nadměrná exprese COPS3 v osteosarkomech potenciálně cílí na TP53 pro degradaci zprostředkovanou proteazomy“. Onkogen. 22 (34): 5358–61. doi:10.1038 / sj.onc.1206671. PMID 12917637.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141030 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019373 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9535219-5] Seeger M, Kraft R, Ferrell K, Bech-Otschir D, Dumdey R, Schade R, Gordon C, Naumann M, Dubiel W (duben 1998). „Nový proteinový komplex zapojený do signální transdukce, který má podobnosti s podjednotkami proteasomu 26S“. FASEB J.. 12 (6): 469–78. doi:10.1096 / fasebj.12.6.469. PMID 9535219. S2CID 25424324.

[pmid10191102-6] Potocki L, Chen KS, Lupski JR (červen 1999). „Podjednotka 3 komplexu přenosu signálu COP9 je konzervována z rostlin na člověka a mapuje se v kritické oblasti syndromu Smith-Magenis v 17p11.2.“ Genomika. 57 (1): 180–2. doi:10.1006 / geno.1998.5748. PMID 10191102.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: COPS3 COP9 konstitutivní fotomorfogenní homologní podjednotka 3 (Arabidopsis)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]