COG4 - COG4

COG4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3HR0
Identifikátory
Aliasy	COG4, CDG2J, COD1, složka oligomerního golgiho komplexu 4, SWILS
Externí ID	OMIM: 606976 MGI: 2142808 HomoloGene: 7155 Genové karty: COG4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	70,523,558 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	110,882,227 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• Golgiho transportní komplex; • Golgiho membrána; • Golgiho aparát; • membrána; • trans-Golgiho síťová membrána; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• transport bílkovin; • ER na transport zprostředkovaný vezikulemi Golgi; • retrográdní transport, recyklace vezikul v rámci Golgi; • Stabilizace prefuzního komplexu Golgiho váčku; • retrográdní transport zprostředkovaný vezikuly, Golgi do ER; • Golgiho organizace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	25839
	102339
	ENSG00000103051
	ENSMUSG00000031753
	Q9H9E3
	Q8R1U1
	NM_001195139; NM_015386; NM_001365426
	NM_133973; NM_001310607
	NP_001182068; NP_056201; NP_001352355
	NP_001297536; NP_598734
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Zachovaná oligomerní podjednotka komplexu Golgiho komplexu 4 je protein že u lidí je kódován COG4 gen.^[5]^[6]

Multiproteinové komplexy jsou klíčové determinanty struktury Golgiho aparátu a jeho kapacity pro intracelulární transport a modifikaci glykoproteinů. Bylo identifikováno několik komplexů, včetně transportního komplexu Golgi (GTC), komplexu LDLC, který se účastní glykosylačních reakcí, a komplexu SEC34, který se účastní vezikulárního transportu. Tyto 3 komplexy jsou identické a byly označeny jako konzervovaný oligomerní Golgiho komplex (COG), který zahrnuje COG4 (Ungar et al., 2002). [Dodáno společností OMIM]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že COG4 komunikovat s COG7,^[7] COG2,^[7] COG1^[7] a COG5.^[7]

Klinický

Mutace v tomto genu byly spojeny s Saul-Wilsonův syndrom.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000103051 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031753 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ungar D, Oka T, Brittle EE, Vasile E, Lupashin VV, Chatterton JE, Heuser JE, Krieger M, Waters MG (duben 2002). „Charakterizace savčího Golgiho lokalizovaného proteinového komplexu, COG, který je vyžadován pro normální morfologii a funkci Golgiho“. J Cell Biol. 157 (3): 405–15. doi:10.1083 / jcb.200202016. PMC 2173297. PMID 11980916.
^ ^A ^b „Entrez Gene: složka COG4 oligomerního golgiho komplexu 4“.
^ ^A ^b ^C ^d Loh, Eva; Hong Wanjin (červen 2004). „Binární interakční síť konzervovaného oligomerního Golgiho tetherovacího komplexu“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 279 (23): 24640–8. doi:10,1074 / jbc.M400662200. ISSN 0021-9258. PMID 15047703.
^ Ferreira C (2020) Saul-Wilsonův syndrom. In: Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA, Wallace SE, Bean LJH, Stephens K, Amemiya A, redaktoři. SourceGeneReviews. Seattle (WA): University of Washington, Seattle

Další čtení

Whyte JR, Munro S (2001). „Transportní komplex Sec34 / 35 Golgi souvisí s exocystou a definuje rodinu komplexů zapojených do několika kroků membránového provozu“. Dev. Buňka. 1 (4): 527–37. doi:10.1016 / S1534-5807 (01) 00063-6. PMID 11703943.
Loh E, Hong W (2002). „Sec34 je zapojen do provozu z endoplazmatického retikula do Golgi a existuje v komplexu s GTC-90 a ldlBp“. J. Biol. Chem. 277 (24): 21955–61. doi:10,1074 / jbc.M202326200. PMID 11929878.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). „Nedoceněná role pro dohled nad RNA“. Genome Biol. 5 (2): R8. doi:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. PMC 395752. PMID 14759258.
Loh E, Hong W (2004). „Binární interakční síť konzervovaného oligomerního Golgiho tetherovacího komplexu“. J. Biol. Chem. 279 (23): 24640–8. doi:10,1074 / jbc.M400662200. PMID 15047703.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

externí odkazy

Přehled GeneReviews / NCBI / NIH / UW o vrozených poruchách glykosylace Přehled
Člověk COG4 umístění genomu a COG4 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000103051 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031753 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11980916-5] Ungar D, Oka T, Brittle EE, Vasile E, Lupashin VV, Chatterton JE, Heuser JE, Krieger M, Waters MG (duben 2002). „Charakterizace savčího Golgiho lokalizovaného proteinového komplexu, COG, který je vyžadován pro normální morfologii a funkci Golgiho“. J Cell Biol. 157 (3): 405–15. doi:10.1083 / jcb.200202016. PMC 2173297. PMID 11980916.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: složka COG4 oligomerního golgiho komplexu 4“.

[pmid15047703-7] A ^b ^C ^d Loh, Eva; Hong Wanjin (červen 2004). „Binární interakční síť konzervovaného oligomerního Golgiho tetherovacího komplexu“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 279 (23): 24640–8. doi:10,1074 / jbc.M400662200. ISSN 0021-9258. PMID 15047703.

[Ferreira2020-8] Ferreira C (2020) Saul-Wilsonův syndrom. In: Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA, Wallace SE, Bean LJH, Stephens K, Amemiya A, redaktoři. SourceGeneReviews. Seattle (WA): University of Washington, Seattle

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]