CNOT4 - CNOT4

CNOT4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1E4U, 1UR6
Identifikátory
Aliasy	CNOT4, CLONE243, NOT4, NOT4H, CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 4
Externí ID	OMIM: 604911 MGI: 1859026 HomoloGene: 40870 Genové karty: CNOT4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	135,510,127 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	35,133,724 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • vazba kovových iontů; • aktivita transferázy; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytosol; • cytoplazma; • Komplex CCR4-NOT; • buněčné jádro;
Biologický proces	• ubikvitinace bílkovin; • zkrácení ocasu nukleární transkribované mRNA poly (A); • autoubiquitination bílkovin; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k zastavení buněčného cyklu; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, rozpad závislý na deadenylaci; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • regulace diferenciace megakaryocytů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4850
	53621
	ENSG00000080802
	ENSMUSG00000038784
	O95628
	Q8BT14
NM_001008225; NM_001190847; NM_001190848; NM_001190849; NM_001190850;
	NM_013316
	NM_001164411; NM_001164412; NM_001164413; NM_001164414; NM_016877
NP_001008226; NP_001177776; NP_001177777; NP_001177778; NP_001177779;
	NP_037448
	NP_001157883; NP_001157884; NP_001157885; NP_001157886; NP_058573
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční komplex CCR4-NOT, podjednotka 4 je protein že v lidé je kódován CNOT4 gen.^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je podjednotkou CCR4-ne komplexní, globální transkripční regulátor a Deadenylase. Kódovaný protein interaguje s CNOT1 a má ubikvitin ligáza aktivita. Několik variant přepisu kódujících různé izoformy byly nalezeny pro tento gen. [poskytnuté RefSeq, červenec 2010]. Mezi nemoci spojené s CNOT4 patří adenoiditida.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000080802 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000038784 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: transkripční komplex CCR4-NOT, podjednotka 4“.
^ "CNOT4 Gene - GeneCards | CNOT4 Protein | Protilátka CNOT4". www.genecards.org. Citováno 2019-06-21.

Další čtení

Grönholm J, Kaustio M, Myllymäki H, Kallio J, Saarikettu J, Kronhamn J, Valanne S, Silvennoinen O, Rämet M (březen 2012). „Not4 zvyšuje expresi genu závislou na dráze JAK / STAT v Drosophile a v lidských buňkách“. FASEB Journal. 26 (3): 1239–50. doi:10.1096 / fj.11-195875. PMID 22159038. S2CID 25618632.
Winkler GS, Albert TK, Dominguez C, Legtenberg YI, Boelens R, Timmers HT (březen 2004). „Altered-specificity ubiquitin-konjugující enzym / ubiquitin-protein ligase pair“. Journal of Molecular Biology. 337 (1): 157–65. doi:10.1016 / j.jmb.2004.01.031. PMID 15001359.
Lau NC, Kolkman A, van Schaik FM, Mulder KW, Pijnappel WW, Heck AJ, Timmers HT (září 2009). „Lidské komplexy Ccr4-Not obsahují variabilní podjednotky deadenylázy“ (PDF). The Biochemical Journal. 422 (3): 443–53. doi:10.1042 / BJ20090500. PMID 19558367.
Albert TK, Hanzawa H, Legtenberg YI, de Ruwe MJ, van den Heuvel FA, Collart MA, Boelens R, Timmers HT (únor 2002). „Identifikace podjednotky ligázy ubikvitin-protein v komplexu CCR4-NOT transkripčního represoru“. Časopis EMBO. 21 (3): 355–64. doi:10.1093 / emboj / 21.3.355. PMC 125831. PMID 11823428.
Dominguez C, Bonvin AM, Winkler GS, van Schaik FM, Timmers HT, Boelens R (duben 2004). „Strukturální model komplexu UbcH5B / CNOT4 odhalen kombinací NMR, mutageneze a dokovacích přístupů“. Struktura. 12 (4): 633–44. doi:10.1016 / j.str.2004.03.004. PMID 15062086.
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (červen 2002). „Vyjádřená analýza sekvenčních značek lidského RPE / choroidu pro projekt NEIBank: více než 6000 neredundantních transkriptů, nových genů a variant sestřihu“. Molekulární vidění. 8: 205–20. PMID 12107410.
Mersman DP, Du HN, Fingerman IM, South PF, Briggs SD (duben 2009). „Polyubikvitinace demethylázy Jhd2 řídí methylaci histonu a genovou expresi“. Geny a vývoj. 23 (8): 951–62. doi:10.1101 / gad.1769209. PMC 2675863. PMID 19346402.
Hanzawa H, de Ruwe MJ, Albert TK, van Der Vliet PC, Timmers HT, Boelens R (březen 2001). „Struktura prstence C4C4 lidského NOT4 odhaluje rysy odlišné od vlastností prstů C3HC4 RING.“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (13): 10185–90. doi:10,1074 / jbc.M009298200. PMID 11087754.
Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (únor 2000). "Izolace a charakterizace lidských ortologů kvasinkových komplexů CCR4-NOT". Výzkum nukleových kyselin. 28 (3): 809–17. doi:10.1093 / nar / 28.3.809. PMC 102560. PMID 10637334.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000080802 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000038784 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: transkripční komplex CCR4-NOT, podjednotka 4“.

[6] "CNOT4 Gene - GeneCards | CNOT4 Protein | Protilátka CNOT4". www.genecards.org. Citováno 2019-06-21.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]