CLK2 - CLK2

CLK2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3NR9
Identifikátory
Aliasy	CLK2, CDC jako kináza 2
Externí ID	OMIM: 602989 MGI: 1098669 HomoloGene: 33303 Genové karty: CLK2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	155,278,491 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	89,176,921 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • kinázová aktivita; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • aktivita proteinkinázy; • aktivita proteinu serin / threonin / tyrosin kináza; • ATP vazba; • vazba nukleotidů; • aktivita protein tyrosinkinázy; • aktivita transferázy; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • jaderná skvrna; • jaderné těleso;
Biologický proces	• negativní regulace glukoneogeneze; • regulace sestřihu RNA; • fosforylace; • fosforylace bílkovin; • autofosforylace; • reakce na organickou látku; • reakce na ionizující záření; • peptidyl-tyrosinová fosforylace; • reakce na kyselinu retinovou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1196
	12748
	ENSG00000261893; ENSG00000176444
	ENSMUSG00000068917
	P49760
	O35491
	NM_001291; NM_001294338; NM_001294339; NM_003993; NM_001363704
	NM_001163432; NM_007712
	NP_001281267; NP_001281268; NP_003984; NP_001350633
	NP_001156904; NP_031738
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Duální specificita protein kinázy CLK2 je enzym že u lidí je kódován CLK2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny CLK proteinové kinázy dvojí specificity. Členové rodiny CLK prokázali interakci s, a fosforylát, serin /arginin - bohaté (SR) proteiny spliceosomální komplex, který je součástí regulačního mechanismu, který umožňuje proteinům SR řídit sestřih RNA. Tato proteinová kináza se podílí na regulaci několika buněčných procesů a může sloužit jako spojka mezi progresí buněčného cyklu, apoptóza, a telomer regulace délky.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000176444 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000261893, ENSG00000176444 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068917 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hanes J, von der Kammer H, Klaudiny J, Scheit KH (prosinec 1994). "Charakterizace klonováním cDNA dvou nových lidských proteinových kináz. Důkaz porovnáním sekvencí nové rodiny savčích proteinových kináz". Journal of Molecular Biology. 244 (5): 665–72. doi:10.1006 / jmbi.1994.1763. PMID 7990150.
^ Talmadge CB, Finkernagel S, Sumegi J, Sciorra L, Rabinow L (říjen 1998). "Chromozomální mapování tří genů kódujících lidskou LAMMER protein-kinázu". Genetika člověka. 103 (4): 523–4. doi:10,1007 / s004390050861. PMID 9856501.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CLK2 CDC-like kinase 2“.

externí odkazy

Člověk CLK2 umístění genomu a CLK2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P49760 (Proteinová kináza s dvojitou specificitou CLK2) na PDBe-KB.

Další čtení

Lee K, Du C, Horn M, Rabinow L (listopad 1996). „Aktivita a autofosforylace proteinových kináz LAMMER“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (44): 27299–303. doi:10.1074 / jbc.271.44.27299. PMID 8910305.
Winfield SL, Tayebi N, Martin BM, Ginns EI, Sidransky E (říjen 1997). „Identifikace tří dalších genů sousedících s lokusem glukocerebrosidázy na chromozomu 1q21: důsledky pro Gaucherovu chorobu“. Výzkum genomu. 7 (10): 1020–6. doi:10.1101 / gr.7.10.1020. PMC 310674. PMID 9331372.
Duncan PI, Stojdl DF, Marius RM, Scheit KH, Bell JC (červen 1998). „Clk2 a Clk3 proteinové kinázy s dvojí specificitou regulují intranukleární distribuci proteinů SR a ovlivňují sestřih pre-mRNA“. Experimentální výzkum buněk. 241 (2): 300–8. doi:10.1006 / excr.1998.4083. PMID 9637771.
Tsujikawa M, Kurahashi H, Tanaka T, Okada M, Yamamoto S, Maeda N, Watanabe H, Inoue Y, Kiridoshi A, Matsumoto K, Ohashi Y, Kinoshita S, Shimomura Y, Nakamura Y, Tano Y (říjen 1998). "Homozygotní mapování genu odpovědného za želatinovou kapkovitou dystrofii rohovky na chromozom 1p". American Journal of Human Genetics. 63 (4): 1073–7. doi:10.1086/302071. PMC 1377503. PMID 9758629.
Nayler O, Schnorrer F, Stamm S, Ullrich A (prosinec 1998). „Buněčná lokalizace myší kinázy CLK2 bohaté na serin / arginin je regulována autofosforylací serinu 141“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (51): 34341–8. doi:10.1074 / jbc.273.51.34341. PMID 9852100.
Moeslein FM, Myers MP, Landreth GE (září 1999). „Rodina kináz CLK, CLK1 a CLK2, fosforyluje a aktivuje tyrosin fosfatázu, PTP-1B“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (38): 26697–704. doi:10.1074 / jbc.274.38.26697. PMID 10480872.
Nothwang HG, Kim HG, Aoki J, Geisterfer M, Kübart S, Wegner RD, van Moers A, Ashworth LK, Haaf T, Bell J, Arai H, Tommerup N, Ropers HH, Wirth J (duben 2001). „Funkční hemizygotnost PAFAH1B3 způsobená fúzním genem PAFAH1B3-CLK2 u ženy s mentální retardací, ataxií a atrofií mozku“. Lidská molekulární genetika. 10 (8): 797–806. doi:10,1093 / hmg / 10,8,797. PMID 11285245.
Ravichandran LV, Chen H, Li Y, Quon MJ (říjen 2001). "Fosforylace PTP1B na Ser (50) Aktem zhoršuje jeho schopnost defosforylovat inzulinový receptor". Molekulární endokrinologie. 15 (10): 1768–80. doi:10.1210 / opravit 15.10.0711. PMID 11579209.
Jiang N, Bénard CY, Kébir H, Shoubridge EA, Hekimi S (červen 2003). "Lidská CLK2 spojuje progresi buněčného cyklu, apoptózu a regulaci délky telomer". The Journal of Biological Chemistry. 278 (24): 21678–84. doi:10,1074 / jbc.M300286200. PMID 12670948.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). „Nedoceněná role pro dohled nad RNA“. Genome Biology. 5 (2): R8. doi:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. PMC 395752. PMID 14759258.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (srpen 2004) . „Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace“ (PDF). Aktuální biologie. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Collis SJ, Barber LJ, Clark AJ, Martin JS, Ward JD, Boulton SJ (duben 2007). „HCLK2 je nezbytný pro kontrolní bod S-fáze savců a dopady na stabilitu Chk1“. Přírodní buněčná biologie. 9 (4): 391–401. doi:10.1038 / ncb1555. PMID 17384638.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000176444 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000261893, ENSG00000176444 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068917 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7990150-5] Hanes J, von der Kammer H, Klaudiny J, Scheit KH (prosinec 1994). "Charakterizace klonováním cDNA dvou nových lidských proteinových kináz. Důkaz porovnáním sekvencí nové rodiny savčích proteinových kináz". Journal of Molecular Biology. 244 (5): 665–72. doi:10.1006 / jmbi.1994.1763. PMID 7990150.

[pmid9856501-6] Talmadge CB, Finkernagel S, Sumegi J, Sciorra L, Rabinow L (říjen 1998). "Chromozomální mapování tří genů kódujících lidskou LAMMER protein-kinázu". Genetika člověka. 103 (4): 523–4. doi:10,1007 / s004390050861. PMID 9856501.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CLK2 CDC-like kinase 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]